290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0061 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0061  C-5 cytosine-specific DNA methylase  100 
 
 
236 aa  470  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.346771  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1925  C-5 cytosine-specific DNA methylase  87.76 
 
 
98 aa  180  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.302463  hitchhiker  0.00908439 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0230  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  37.92 
 
 
283 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3531  prophage LambdaBa01, C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  35.74 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3814  prophage LambdaBa01, C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  35.74 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3450  C-5 cytosine-specific DNA methylase  34.89 
 
 
251 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.189675  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4216  C-5 cytosine-specific DNA methylase  42.47 
 
 
329 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.757892  normal  0.411127 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  38.07 
 
 
437 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0330  C-5 cytosine-specific DNA methylase  31.76 
 
 
253 aa  108  8.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0129199  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  36.97 
 
 
423 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  36.53 
 
 
423 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  31.95 
 
 
331 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001833  DNA-cytosine methyltransferase  33.14 
 
 
427 aa  100  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  32.75 
 
 
451 aa  99  6e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1127  DNA-cytosine methyltransferase  37.21 
 
 
359 aa  96.7  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000503374  unclonable  0.0000088158 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  28.96 
 
 
406 aa  95.9  5e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1972  DNA-cytosine methyltransferase  29.41 
 
 
490 aa  95.5  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0825702  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  32.54 
 
 
727 aa  95.1  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  32.42 
 
 
368 aa  94.4  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20440  DNA-methyltransferase Dcm  32.42 
 
 
315 aa  94.4  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359782  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  28.65 
 
 
320 aa  93.6  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6177  DNA-cytosine methyltransferase  39.08 
 
 
390 aa  92  8e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  30.36 
 
 
328 aa  90.9  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0979  C-5 cytosine-specific DNA methylase  38.1 
 
 
484 aa  88.6  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.441427  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4863  DNA-cytosine methyltransferase  34.97 
 
 
418 aa  87.8  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  29.79 
 
 
657 aa  87.8  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1205  DNA-cytosine methyltransferase  35.15 
 
 
632 aa  87.4  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.649135 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  30.06 
 
 
313 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  31.55 
 
 
360 aa  86.7  3e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4296  DNA-cytosine methyltransferase  29.14 
 
 
456 aa  86.3  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  29.14 
 
 
456 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3182  C-5 cytosine-specific DNA methylase  34.76 
 
 
495 aa  85.9  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4252  DNA-cytosine methyltransferase  31.47 
 
 
318 aa  86.3  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0263417 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  30.6 
 
 
416 aa  85.9  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  33.63 
 
 
374 aa  85.9  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  29.7 
 
 
327 aa  85.9  5e-16  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  28.83 
 
 
313 aa  85.5  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  29.08 
 
 
465 aa  85.1  8e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  31.75 
 
 
345 aa  84.7  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0817  DNA-cytosine methyltransferase  38.79 
 
 
385 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  27.61 
 
 
324 aa  84.3  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0833  DNA-cytosine methyltransferase  38.79 
 
 
385 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  28.83 
 
 
308 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  28.07 
 
 
305 aa  84.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  30.25 
 
 
310 aa  84  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  30.49 
 
 
460 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  33.54 
 
 
337 aa  84.3  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  29.89 
 
 
417 aa  84  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4973  DNA-cytosine methyltransferase  31.52 
 
 
373 aa  83.6  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  30.49 
 
 
460 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  26.29 
 
 
357 aa  83.2  0.000000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  28.24 
 
 
319 aa  83.2  0.000000000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  27.95 
 
 
489 aa  82.8  0.000000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1245  DNA-cytosine methyltransferase  26.7 
 
 
438 aa  82.4  0.000000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  29.09 
 
 
329 aa  82.8  0.000000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  28.48 
 
 
338 aa  82.4  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3504  BsaWI methylase  28.16 
 
 
440 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.671295  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  27.88 
 
 
311 aa  81.6  0.000000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3372  C-5 cytosine-specific DNA methylase  35.58 
 
 
502 aa  81.6  0.000000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.126993 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  32.56 
 
 
342 aa  81.3  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2644  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.41 
 
 
362 aa  81.3  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  31.93 
 
 
418 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  31.76 
 
 
415 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  31.93 
 
 
418 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1568  DNA-cytosine methyltransferase  36.59 
 
 
662 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0406485  hitchhiker  0.00122877 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  37.58 
 
 
361 aa  80.9  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  30.3 
 
 
334 aa  79.7  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  28.31 
 
 
335 aa  79  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  30.11 
 
 
362 aa  79  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0394  DNA-cytosine methyltransferase  32.98 
 
 
440 aa  78.2  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0349953  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0598  DNA-cytosine methyltransferase  32.98 
 
 
440 aa  78.2  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0631504  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  27.96 
 
 
416 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4319  DNA-cytosine methyltransferase family protein  29.19 
 
 
312 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165512 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  32.16 
 
 
389 aa  76.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.14 
 
 
431 aa  77  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4652  DNA-cytosine methyltransferase  28.48 
 
 
413 aa  77  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2442  DNA-cytosine methyltransferase  27.75 
 
 
464 aa  77  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.767774  unclonable  0.00000000055978 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  31.79 
 
 
671 aa  75.9  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  29.48 
 
 
468 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3442  DNA-cytosine methyltransferase  32.56 
 
 
380 aa  75.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.836948  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  28.57 
 
 
350 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2321  C-5 cytosine-specific DNA methylase  30 
 
 
287 aa  75.5  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.343948  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  33.13 
 
 
356 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  30.72 
 
 
421 aa  75.1  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  28.57 
 
 
350 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0841  modification methylase HpaII (cytosine-specific methyltransferase HpaII)  28.26 
 
 
373 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.59966e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  25.23 
 
 
320 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  26.39 
 
 
434 aa  75.1  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  26.38 
 
 
328 aa  75.1  0.000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1183  hypothetical protein  25.6 
 
 
352 aa  74.7  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.401368  normal  0.0474441 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  31.98 
 
 
431 aa  74.3  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4337  cytosine-specific methyltransferase NlaX  29.31 
 
 
348 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0259442  hitchhiker  0.000000011708 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  30.68 
 
 
652 aa  73.6  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  28.88 
 
 
370 aa  73.2  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  31.61 
 
 
365 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  28.65 
 
 
313 aa  72.8  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  32.94 
 
 
446 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  26.25 
 
 
329 aa  72.4  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1728  DNA-cytosine methyltransferase  32.04 
 
 
483 aa  72.8  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.770689  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2869  DNA-cytosine methyltransferase  27.75 
 
 
409 aa  72.4  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000758151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>