More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2093 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  100 
 
 
385 aa  777    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  62.83 
 
 
387 aa  473  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  48.61 
 
 
384 aa  320  3e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  43.32 
 
 
378 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  48.31 
 
 
390 aa  289  5.0000000000000004e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  44.73 
 
 
389 aa  289  6e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  46.95 
 
 
391 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  45.08 
 
 
386 aa  280  2e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  43.41 
 
 
392 aa  276  5e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  45.43 
 
 
390 aa  276  5e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5057  lipid-transfer protein  45.97 
 
 
385 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4758  lipid-transfer protein  45.97 
 
 
385 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5694  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4672  lipid-transfer protein  45.97 
 
 
385 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.495157  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5253  lipid-transfer protein  46.49 
 
 
385 aa  269  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.509405 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  44.47 
 
 
394 aa  269  7e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  44.84 
 
 
397 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1513  lipid-transfer protein  45.97 
 
 
385 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  42.78 
 
 
390 aa  263  4e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2621  lipid-transfer protein  43.7 
 
 
395 aa  262  6.999999999999999e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000528338  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  43.68 
 
 
389 aa  261  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  44.59 
 
 
388 aa  259  4e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2016  lipid-transfer protein  43.16 
 
 
388 aa  256  4e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314529  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  39.85 
 
 
390 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  41.28 
 
 
381 aa  252  9.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  44.56 
 
 
390 aa  251  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  43.42 
 
 
394 aa  249  4e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3321  lipid-transfer protein  43.37 
 
 
389 aa  248  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0828492  hitchhiker  0.000989049 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  42.04 
 
 
382 aa  243  3e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2819  lipid-transfer protein  44.85 
 
 
389 aa  242  9e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  40.26 
 
 
385 aa  240  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2044  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  39.44 
 
 
360 aa  238  9e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  41.3 
 
 
385 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  41.67 
 
 
548 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  39.37 
 
 
389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  42.9 
 
 
389 aa  233  3e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  40.58 
 
 
383 aa  233  6e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  39.53 
 
 
383 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  39.74 
 
 
388 aa  227  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  40.26 
 
 
383 aa  228  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  35.55 
 
 
396 aa  226  7e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  39.58 
 
 
383 aa  226  7e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  38.29 
 
 
548 aa  225  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4492  hypothetical protein  36.51 
 
 
385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  39.43 
 
 
389 aa  220  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  38.29 
 
 
550 aa  219  5e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  38.29 
 
 
550 aa  219  5e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  38.29 
 
 
550 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  41.37 
 
 
381 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  39.83 
 
 
380 aa  218  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  38.44 
 
 
388 aa  218  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  39.32 
 
 
383 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  39.22 
 
 
403 aa  216  4e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  39.41 
 
 
384 aa  216  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  38.66 
 
 
390 aa  216  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  37.8 
 
 
385 aa  215  8e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  40.05 
 
 
381 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  38.27 
 
 
379 aa  212  7.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1835  lipid-transfer protein  37.8 
 
 
381 aa  211  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.722448  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  38.76 
 
 
402 aa  211  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3310  hypothetical protein  39.1 
 
 
393 aa  211  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4716  DitF protein  40.37 
 
 
453 aa  212  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  38.5 
 
 
402 aa  211  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0891  thiolase  34.69 
 
 
405 aa  211  2e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.849216  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  38.01 
 
 
379 aa  210  4e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  37.47 
 
 
379 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  38.01 
 
 
379 aa  209  6e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4108  diterpenoid dioxygenase  34.85 
 
 
397 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.742638  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  37.2 
 
 
386 aa  205  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  36.92 
 
 
393 aa  204  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5454  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.89 
 
 
388 aa  202  6e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.839799  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5851  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.89 
 
 
388 aa  202  6e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0314395  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1694  putative nonspecific lipid-transfer protein  38.42 
 
 
388 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1670  putative nonspecific lipid-transfer protein  38.42 
 
 
388 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1643  putative nonspecific lipid-transfer protein  38.42 
 
 
388 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0554  putative nonspecific lipid-transfer protein  38.42 
 
 
388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0636  putative nonspecific lipid-transfer protein  38.42 
 
 
388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  36.83 
 
 
390 aa  201  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0844  thiolase  43.23 
 
 
384 aa  199  5e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  42.37 
 
 
382 aa  199  5e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5643  putative nonspecific lipid-transfer protein  38.16 
 
 
388 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6832  DitF protein  38.75 
 
 
396 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  34.02 
 
 
541 aa  199  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0906  hypothetical protein  35.96 
 
 
394 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00747371  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  38.86 
 
 
389 aa  195  9e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3540  hypothetical protein  35.06 
 
 
392 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1971  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  38.21 
 
 
387 aa  194  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  33.24 
 
 
395 aa  193  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0529  putative nonspecific lipid-transfer protein  38.42 
 
 
388 aa  192  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384509  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5553  hypothetical protein  35.77 
 
 
383 aa  192  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0900  hypothetical protein  35.05 
 
 
389 aa  186  5e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.049177  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  39.16 
 
 
383 aa  185  9e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1026  hypothetical protein  35.45 
 
 
396 aa  185  9e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.651118  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  37.6 
 
 
388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  36.6 
 
 
391 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  36.63 
 
 
389 aa  182  8.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3401  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  36.81 
 
 
380 aa  181  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  35.97 
 
 
379 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  35.64 
 
 
386 aa  181  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1502  acetyl-CoA acetyltransferase  36.13 
 
 
390 aa  181  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  36.04 
 
 
388 aa  179  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>