More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0553 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  100 
 
 		 213 aa  420  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  84.83 
 
 		 220 aa  342  2.9999999999999997e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  60.48 
 
 		 227 aa  238  5e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3409  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.01 
 
 		 221 aa  227  1e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000306896  hitchhiker  0.000114505 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5375  two component transcriptional regulator, LuxR family  63.81 
 
 		 218 aa  215  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1446  response regulator receiver protein  60.95 
 
 		 209 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0167897  normal  0.0778626 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3835  two component LuxR family transcriptional regulator  56.19 
 
 		 217 aa  212  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.760782  normal  0.0940778 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1435  two component LuxR family transcriptional regulator  52.86 
 
 		 218 aa  202  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 219 aa  197  9e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.47 
 
 		 217 aa  196  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3326  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.65 
 
 		 223 aa  195  5.000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.93 
 
 		 216 aa  193  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.12 
 
 		 224 aa  189  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.2 
 
 		 217 aa  189  4e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  45.97 
 
 		 216 aa  187  8e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  46.95 
 
 		 214 aa  185  3e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  47.37 
 
 		 218 aa  183  2.0000000000000003e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  46.89 
 
 		 219 aa  181  5.0000000000000004e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.34 
 
 		 218 aa  181  7e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  50.23 
 
 		 218 aa  181  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  50.23 
 
 		 223 aa  181  8.000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0938  two component LuxR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 242 aa  181  9.000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1346  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.05 
 
 		 236 aa  181  9.000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  hitchhiker  0.00000337078 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 228 aa  179  2.9999999999999997e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7105  two component transcriptional regulator, LuxR family  47 
 
 		 241 aa  179  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  49.51 
 
 		 221 aa  179  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.89 
 
 		 253 aa  178  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  47.37 
 
 		 234 aa  178  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1579  two component LuxR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 242 aa  178  4.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.19 
 
 		 210 aa  177  8e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.13 
 
 		 217 aa  177  8e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  44.95 
 
 		 223 aa  177  9e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 222 aa  176  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  46.15 
 
 		 226 aa  175  4e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  50.24 
 
 		 216 aa  175  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 237 aa  175  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 222 aa  175  5e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  45.79 
 
 		 238 aa  175  5e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3238  regulatory protein LuxR  46.05 
 
 		 228 aa  175  6e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.3 
 
 		 226 aa  174  6e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1321  response regulator  44.39 
 
 		 210 aa  174  7e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000332221  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.77 
 
 		 239 aa  174  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  46.01 
 
 		 250 aa  174  8e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  48.4 
 
 		 226 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.53 
 
 		 226 aa  173  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.32 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4002  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.23 
 
 		 222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.947887  normal  0.770727 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4577  response regulator receiver protein  43.05 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172592 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2171  two component LuxR family transcriptional regulator  46.7 
 
 		 218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0762379  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.89 
 
 		 220 aa  172  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3849  DNA-binding response regulator  43.9 
 
 		 210 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000308683  hitchhiker  0.000000000350245 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1563  DNA-binding response regulator  43.9 
 
 		 210 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1348  DNA-binding response regulator  43.9 
 
 		 210 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000440829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1322  response regulator  43.9 
 
 		 210 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.30192e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1457  DNA-binding response regulator  43.9 
 
 		 210 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000538049  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  45.93 
 
 		 234 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 237 aa  172  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1601  DNA-binding response regulator  43.9 
 
 		 210 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000136266  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.42 
 
 		 224 aa  172  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0480  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.93 
 
 		 214 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8243  response regulator receiver protein  47.66 
 
 		 217 aa  172  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.931194  normal  0.230681 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1363  two component LuxR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 210 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0039551  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1563  two component LuxR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 257 aa  172  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.781509  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4158  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.06 
 
 		 216 aa  171  5.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.962754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.44 
 
 		 226 aa  171  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 221 aa  171  6.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 216 aa  171  9e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.22 
 
 		 218 aa  171  9e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.02 
 
 		 241 aa  171  9e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1998  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.64 
 
 		 225 aa  170  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.12496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1160  two component LuxR family transcriptional regulator  43.41 
 
 		 210 aa  171  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.95 
 
 		 222 aa  170  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4662  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.51 
 
 		 221 aa  169  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142047  hitchhiker  0.00679998 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1495  DNA-binding response regulator  43.41 
 
 		 210 aa  169  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000174821  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1531  DNA-binding response regulator  43.41 
 
 		 210 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.64189e-24 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  46.43 
 
 		 227 aa  169  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0102  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.37 
 
 		 221 aa  170  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0637251  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0322  DNA-binding response regulator  43.54 
 
 		 213 aa  169  3e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4132  response regulator receiver  45.54 
 
 		 235 aa  169  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  45.93 
 
 		 222 aa  169  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.764026 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7812  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 227 aa  169  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  45.24 
 
 		 242 aa  169  4e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2557  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.21 
 
 		 224 aa  169  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.33 
 
 		 211 aa  168  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1387  DNA-binding response regulator  44.61 
 
 		 214 aa  168  6e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00141106  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.98 
 
 		 218 aa  168  7e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1938  two component LuxR family transcriptional regulator  44.02 
 
 		 209 aa  167  9e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1972  response regulator receiver  44.02 
 
 		 209 aa  167  9e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2548  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.24 
 
 		 218 aa  167  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2579  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.5 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1796  response regulator receiver  46.51 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0759  two component LuxR family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000356105  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.41 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0415698  normal  0.590713 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0615  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.64 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.81 
 
 		 228 aa  166  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4902  response regulator receiver  45.12 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443208  normal  0.676579 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.7 
 
 		 225 aa  166  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 218 aa  166  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1984  two component LuxR family transcriptional regulator  44.5 
 
 		 220 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.123783 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>