214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3951 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_3951  methyltransferase type 11  100 
 
 
211 aa  442  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3583  methyltransferase type 12  60.19 
 
 
211 aa  280  9e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4134  methyltransferase type 12  58.57 
 
 
213 aa  278  4e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0201  methyltransferase type 11  59.05 
 
 
217 aa  276  1e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0259  methyltransferase type 12  60.48 
 
 
211 aa  275  5e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.562572 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0201  Methyltransferase type 11  57.62 
 
 
216 aa  273  2e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.63845 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4267  methyltransferase type 11  57.62 
 
 
223 aa  272  3e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.14672 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0258  methyltransferase type 12  58.57 
 
 
211 aa  266  1e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4550  methyltransferase domain-containing protein  56.4 
 
 
212 aa  262  3e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0329  methyltransferase type 11  56.67 
 
 
212 aa  259  2e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3944  methyltransferase type 11  57.35 
 
 
212 aa  258  4e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3746  methyltransferase type 12  55.92 
 
 
212 aa  252  3e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3819  methyltransferase type 11  55.92 
 
 
212 aa  249  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0301  methyltransferase type 11  55.5 
 
 
214 aa  245  3e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2134  methyltransferase type 11  53.81 
 
 
212 aa  234  8e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.453927 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0230  hypothetical protein  50.94 
 
 
214 aa  220  1e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.818653  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00577  hypothetical protein  48.82 
 
 
212 aa  216  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0514  methyltransferase domain-containing protein  48.79 
 
 
225 aa  215  5e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1601  thymidylate kinase  50.72 
 
 
215 aa  215  5e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0530437  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2405  methyltransferase-related protein  48.34 
 
 
222 aa  214  1e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3445  methyltransferase domain-containing protein  54.59 
 
 
213 aa  214  1e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001914  putative methyltransferase associated with DUF414  49.05 
 
 
212 aa  213  2e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2158  methyltransferase type 12  44.76 
 
 
223 aa  201  1e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1082  methyltransferase type 12  46.19 
 
 
215 aa  197  1e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.578159  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0965  methyltransferase type 11  43.75 
 
 
217 aa  195  3e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00498957  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2554  methyltransferase type 12  43.27 
 
 
215 aa  189  3e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239321  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0643  methyltransferase type 12  41.63 
 
 
257 aa  181  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00013  methyltransferase-related protein  41.23 
 
 
233 aa  178  4e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0420  methyltransferase type 12  40.58 
 
 
230 aa  177  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.662097  hitchhiker  0.00821739 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0899  Methyltransferase type 11  38.32 
 
 
217 aa  172  2e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1150  methyltransferase type 12  38.46 
 
 
222 aa  166  2e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06720  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  34.47 
 
 
214 aa  125  4e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0892  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  31.8 
 
 
214 aa  118  7e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0109  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1,4- ben zoquinolmethylase  35.03 
 
 
214 aa  117  1e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3946  hypothetical protein  32.55 
 
 
220 aa  113  2e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3717  hypothetical protein  31.9 
 
 
222 aa  112  4e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00803491  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3908  hypothetical protein  31.75 
 
 
212 aa  112  4e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00391987  normal  0.262705 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0093  hypothetical protein  33.18 
 
 
232 aa  111  7e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0397586  decreased coverage  8.60939e-06 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0090  hypothetical protein  31.13 
 
 
226 aa  110  1e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  8.69669e-05  normal  0.185327 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4727  hypothetical protein  31.28 
 
 
212 aa  110  2e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4293  hypothetical protein  30.33 
 
 
212 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00170008  unclonable  4.96851e-12 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0056  hypothetical protein  29.52 
 
 
220 aa  106  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.425414  normal  0.0220256 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4000  hypothetical protein  30.81 
 
 
212 aa  106  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4490  hypothetical protein  31.16 
 
 
212 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0393698 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4348  hypothetical protein  31.16 
 
 
212 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  2.31362e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0050  hypothetical protein  31.16 
 
 
212 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00137393  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4113  hypothetical protein  29.86 
 
 
212 aa  101  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3910  hypothetical protein  30.7 
 
 
212 aa  97.1  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0099  hypothetical protein  31.78 
 
 
222 aa  95.5  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3623  hypothetical protein  30.37 
 
 
223 aa  90.1  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0347369  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1742  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.09 
 
 
253 aa  59.3  4e-08  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.581641 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  22.48 
 
 
291 aa  57.4  2e-07  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0252  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  26.21 
 
 
273 aa  54.7  1e-06  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4080  methyltransferase type 12  29.37 
 
 
274 aa  52.4  5e-06  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  29.84 
 
 
214 aa  52.4  5e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 
1312 aa  52  6e-06  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2800  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.97 
 
 
242 aa  52  6e-06  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3858  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  36.73 
 
 
260 aa  51.6  8e-06  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  3.01378e-06 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  23.53 
 
 
300 aa  51.2  1e-05  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1419  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.76 
 
 
240 aa  50.8  1e-05  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000287901 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2527  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.76 
 
 
240 aa  51.2  1e-05  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02117  hypothetical protein  32.76 
 
 
240 aa  50.8  1e-05  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2372  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.76 
 
 
240 aa  50.8  1e-05  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2383  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.76 
 
 
240 aa  51.2  1e-05  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.679426  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2607  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.76 
 
 
240 aa  50.8  1e-05  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1427  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.76 
 
 
240 aa  51.2  1e-05  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  5.05917e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02158  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.76 
 
 
240 aa  50.8  1e-05  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2495  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.25 
 
 
238 aa  50.1  2e-05  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2461  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.9 
 
 
242 aa  50.8  2e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  normal  0.0528077 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2620  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.9 
 
 
242 aa  50.8  2e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0890164  normal  0.121795 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2412  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.9 
 
 
242 aa  50.8  2e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114708  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2516  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.9 
 
 
242 aa  50.8  2e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.158942  normal  0.172126 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2503  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.9 
 
 
242 aa  50.8  2e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2847  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.56 
 
 
242 aa  50.1  3e-05  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.170371  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.56 
 
 
242 aa  50.1  3e-05  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.167435  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  27.48 
 
 
240 aa  49.7  3e-05  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  8.58625e-10 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  28.23 
 
 
222 aa  49.7  3e-05  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1311  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.56 
 
 
242 aa  50.1  3e-05  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.310574  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3366  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.25 
 
 
240 aa  50.1  3e-05  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2288  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30 
 
 
236 aa  49.3  4e-05  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  4.34685e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2057  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30 
 
 
236 aa  49.3  4e-05  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00373445  unclonable  1.81282e-12 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2061  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30 
 
 
236 aa  49.3  4e-05  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000216259  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2405  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30 
 
 
236 aa  49.3  4e-05  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0031453  unclonable  1.07222e-05 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1948  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30 
 
 
262 aa  48.9  5e-05  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.767246  normal  0.0132888 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.6 
 
 
345 aa  48.9  5e-05  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1104  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.33 
 
 
239 aa  48.5  6e-05  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.580904  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0864  methyltransferase type 12  29.33 
 
 
204 aa  48.9  6e-05  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  1.43474e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1147  methyltransferase type 12  24.83 
 
 
288 aa  48.9  6e-05  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1919  hypothetical protein  28.18 
 
 
241 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.596935  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2131  hypothetical protein  23.13 
 
 
220 aa  47.4  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.967434  normal  0.0119772 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1007  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  44.07 
 
 
249 aa  47.8  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3212  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.15 
 
 
239 aa  47.8  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.812098  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.78 
 
 
232 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4499  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  60.53 
 
 
266 aa  47.8  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.52328e-07 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  29.07 
 
 
237 aa  47.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2861  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  27.78 
 
 
240 aa  47  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0308666  decreased coverage  1.35895e-10 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.17 
 
 
232 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4502  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.46 
 
 
244 aa  47.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1730  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.46 
 
 
237 aa  47.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00224217 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0398  histidine triad (HIT) protein  27.73 
 
 
284 aa  46.6  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.315945 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>