More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3676 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3676  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 214 aa  422  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0625047  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3507  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.67 
 
 		 213 aa  221  9e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.892641  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3998  response regulator receiver protein  51.43 
 
 		 233 aa  203  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  0.263649 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4946  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.17 
 
 		 224 aa  201  6e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4902  response regulator receiver  51.9 
 
 		 216 aa  200  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443208  normal  0.676579 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.31 
 
 		 222 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4132  response regulator receiver  48.37 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.54 
 
 		 225 aa  194  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3601  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.15 
 
 		 222 aa  192  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.324048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7105  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.77 
 
 		 241 aa  191  7e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1523  response regulator receiver protein  48.82 
 
 		 215 aa  190  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.0152488 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  49.07 
 
 		 223 aa  189  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8793  response regulator receiver protein  50 
 
 		 221 aa  186  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  47.37 
 
 		 218 aa  185  4e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0645  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.77 
 
 		 220 aa  185  5e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.691779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 219 aa  184  7e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  47.71 
 
 		 221 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  47.27 
 
 		 226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4662  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.83 
 
 		 221 aa  182  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142047  hitchhiker  0.00679998 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2233  LuxR response regulator receiver  47.89 
 
 		 228 aa  180  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8243  response regulator receiver protein  48.33 
 
 		 217 aa  180  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.931194  normal  0.230681 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.19 
 
 		 217 aa  179  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0102  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.23 
 
 		 221 aa  179  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0637251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2737  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.07 
 
 		 227 aa  179  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418014  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.79 
 
 		 230 aa  178  4.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4263  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.77 
 
 		 230 aa  178  4.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  47.53 
 
 		 227 aa  178  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  48.34 
 
 		 220 aa  178  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1477  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.61 
 
 		 234 aa  177  9e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1972  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.83 
 
 		 217 aa  177  9e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000794288  unclonable  0.0000000332591 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  44.98 
 
 		 219 aa  177  9e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  47.93 
 
 		 226 aa  177  9e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6963  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.029709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0767  LuxR response regulator receiver  50.23 
 
 		 221 aa  176  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.88397  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1740  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.47 
 
 		 228 aa  175  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4684  two component LuxR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 223 aa  175  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3643  two component LuxR family transcriptional regulator  45.97 
 
 		 215 aa  175  5e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5619  response regulator receiver protein  49.07 
 
 		 226 aa  175  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0556461  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0404  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.83 
 
 		 218 aa  175  5e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21850  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  43.52 
 
 		 222 aa  173  9.999999999999999e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118113  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4002  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 222 aa  174  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.947887  normal  0.770727 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1633  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.3 
 
 		 241 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.457155  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4508  response regulator receiver protein  48.84 
 
 		 219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401356  normal  0.568133 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.2 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.41 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7161  two component LuxR family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0588186  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  43.33 
 
 		 218 aa  172  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1998  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.41 
 
 		 225 aa  172  2.9999999999999996e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.12496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6049  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.61 
 
 		 224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.764436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5893  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.78 
 
 		 218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.19 
 
 		 217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  47.91 
 
 		 230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.23 
 
 		 218 aa  172  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7211  response regulator receiver protein  46.63 
 
 		 215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0769384 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0335  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.15 
 
 		 220 aa  172  3.9999999999999995e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4254  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.58 
 
 		 225 aa  171  5e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.867992  normal  0.287586 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3251  response regulator receiver protein  44.39 
 
 		 221 aa  171  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1049  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.62 
 
 		 222 aa  171  5.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.89 
 
 		 229 aa  171  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26840  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  45.25 
 
 		 239 aa  171  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274056  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.54 
 
 		 226 aa  170  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  40.28 
 
 		 215 aa  170  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7812  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.62 
 
 		 227 aa  169  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3219  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.37 
 
 		 208 aa  170  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.01 
 
 		 224 aa  170  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.13 
 
 		 225 aa  169  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0676  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.38 
 
 		 215 aa  170  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1874  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.23 
 
 		 213 aa  169  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.635222  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.43 
 
 		 217 aa  170  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0683  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.74 
 
 		 234 aa  169  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344925  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2780  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.87 
 
 		 219 aa  169  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.855193  normal  0.402473 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0480  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.37 
 
 		 214 aa  169  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1845  LuxR response regulator receiver  45.21 
 
 		 215 aa  169  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00433344  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3639  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.97 
 
 		 215 aa  169  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.274763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7843  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.92 
 
 		 231 aa  169  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.176081 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  41.23 
 
 		 215 aa  169  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4417  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.48 
 
 		 232 aa  168  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.79 
 
 		 220 aa  168  5e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 216 aa  168  5e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  41.23 
 
 		 215 aa  168  6e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1796  response regulator receiver  45.12 
 
 		 230 aa  168  6e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4051  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.05 
 
 		 225 aa  168  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00308286  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6511  two component LuxR family transcriptional regulator  44.6 
 
 		 215 aa  168  6e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.100644 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7301  response regulator receiver protein  46.23 
 
 		 220 aa  168  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  40.76 
 
 		 215 aa  168  7e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  41.23 
 
 		 215 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  41.23 
 
 		 215 aa  167  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  41.23 
 
 		 215 aa  167  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4577  response regulator receiver protein  44.34 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172592 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  41.23 
 
 		 215 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0956  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.78 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3748  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.48 
 
 		 236 aa  167  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  41.23 
 
 		 215 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0523  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.48 
 
 		 230 aa  167  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5265  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.23 
 
 		 218 aa  166  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  48.74 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6405  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.42 
 
 		 225 aa  166  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2015  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.36 
 
 		 232 aa  167  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.706703  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7117  two component LuxR family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 214 aa  166  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2270  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.73 
 
 		 242 aa  167  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000113212 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>