More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1014 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_1014  NLP/P60 protein  100 
 
 
211 aa  431  1e-120  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0595  NLP/P60 protein  60.38 
 
 
201 aa  216  2e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1293  NLP/P60  43.36 
 
 
205 aa  122  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0496746  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3902  NLP/P60 protein  42.02 
 
 
171 aa  122  5e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1501  putative outer membrane lipoprotein  40.98 
 
 
172 aa  121  7e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2784  putative outer membrane lipoprotein  40.98 
 
 
194 aa  121  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2707  putative outer membrane lipoprotein  40.98 
 
 
194 aa  121  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3244  putative outer membrane lipoprotein  41.8 
 
 
191 aa  120  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0124301 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  40.48 
 
 
188 aa  119  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  40.48 
 
 
188 aa  119  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2565  putative outer membrane lipoprotein  39.68 
 
 
190 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159761  hitchhiker  0.000144355 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  40.48 
 
 
188 aa  119  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  40.48 
 
 
188 aa  119  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  40.48 
 
 
188 aa  119  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  40.48 
 
 
188 aa  119  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2454  putative outer membrane lipoprotein  39.68 
 
 
190 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00195047  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  40.48 
 
 
188 aa  119  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  40.48 
 
 
188 aa  119  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2451  putative outer membrane lipoprotein  39.68 
 
 
190 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000518421 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  40.48 
 
 
188 aa  119  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2408  putative outer membrane lipoprotein  39.68 
 
 
147 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000210623 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2363  putative outer membrane lipoprotein  39.68 
 
 
147 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000243067  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2771  putative outer membrane lipoprotein  40.48 
 
 
189 aa  118  4.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.805322  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1646  putative outer membrane lipoprotein  40.16 
 
 
194 aa  118  7e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79512  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1917  putative outer membrane lipoprotein  40.16 
 
 
193 aa  116  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2431  putative outer membrane lipoprotein  40.98 
 
 
191 aa  116  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0958  NLP/P60 protein  44.92 
 
 
167 aa  115  5e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.414472  normal  0.258055 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2335  putative outer membrane lipoprotein  40.98 
 
 
191 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1118  NLP/P60 protein  37.82 
 
 
189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.579853  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0069  NLP/P60 family lipoprotein  40.71 
 
 
148 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1657  NLP/P60 protein  40.8 
 
 
154 aa  109  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.983654  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4200  NLP/P60 protein  38.46 
 
 
156 aa  108  6e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1838  NLP/P60 protein  40.8 
 
 
154 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2605  NlpC/P60 family lipoprotein  40.8 
 
 
143 aa  107  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1732  NlpC/P60 family lipoprotein  40.8 
 
 
154 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02243  hypothetical protein  39.32 
 
 
162 aa  106  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1387  putative lipoprotein  43.24 
 
 
162 aa  106  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0376898  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3689  NLP/P60 family lipoprotein  38.79 
 
 
179 aa  105  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0428  NLP/P60 protein  40 
 
 
173 aa  104  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1628  NLP/P60 protein  40 
 
 
155 aa  103  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1788  NlpC/P60 family lipoprotein  41.6 
 
 
154 aa  103  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2426  lipoprotein, NlpC/P60 family  41.6 
 
 
154 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1927  NlpC/P60 family lipoprotein  41.6 
 
 
154 aa  103  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00858399  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1482  NlpC/P60 family lipoprotein  41.6 
 
 
154 aa  103  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  38.79 
 
 
207 aa  102  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2161  NLP/P60 protein  39.2 
 
 
154 aa  102  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.854022 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01677  predicted lipoprotein  41.6 
 
 
154 aa  102  5e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0294155  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1934  NLP/P60 protein  41.6 
 
 
154 aa  102  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0636747  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4465  NLP/P60 protein  34.45 
 
 
150 aa  102  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.231412 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01666  hypothetical protein  41.6 
 
 
154 aa  102  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0178073  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1923  NLP/P60 protein  41.6 
 
 
154 aa  102  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.468553 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3992  NLP/P60 protein  38.26 
 
 
196 aa  101  8e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000856339  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1912  lipoprotein, NlpC/P60 family  40.8 
 
 
154 aa  100  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  35.97 
 
 
188 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1830  NlpC (ORF-17)  40.8 
 
 
154 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1438  NlpC (ORF-17)  40.8 
 
 
154 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0813186 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2002  putative lipoprotein nlpC  40.8 
 
 
154 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.303201 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1454  putative lipoprotein nlpC  40.8 
 
 
154 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.297729  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1471  hypothetical protein  40.8 
 
 
154 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.235317  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2446  NLP/P60 protein  42.99 
 
 
208 aa  99.8  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2466  NLP/P60 protein  36.8 
 
 
162 aa  98.6  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.291366  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0897  NLP/P60 family protein  40.17 
 
 
231 aa  98.6  6e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.624146  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0170  NLP/P60 protein  40.65 
 
 
184 aa  98.6  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1142  lipoprotein NlpC  37.4 
 
 
166 aa  98.2  8e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0142689  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0427  NLP/P60 protein  38.26 
 
 
240 aa  97.8  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2772  NLP/P60 protein  36.8 
 
 
157 aa  97.8  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1592  NLP/P60  38.02 
 
 
171 aa  97.4  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.098676  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4872  NLP/P60 protein  36.28 
 
 
183 aa  97.1  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4708  NLP/P60 protein  38.52 
 
 
214 aa  97.1  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.341111  normal  0.0906731 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2178  NLP/P60 protein  40.19 
 
 
193 aa  97.1  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1734  NLP/P60 protein  39.2 
 
 
154 aa  95.9  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0791  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)-like  42.06 
 
 
221 aa  94.4  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0063  NLP/P60 protein  35.14 
 
 
164 aa  92.8  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.694655  hitchhiker  0.00200651 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  41.82 
 
 
303 aa  93.2  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0058  NLP/P60 protein  35.14 
 
 
164 aa  92.4  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0062  NLP/P60 protein  35.14 
 
 
154 aa  92.4  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  37.4 
 
 
341 aa  92.4  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4296  NLP/P60 protein  35.14 
 
 
164 aa  92.4  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.346407  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  43.24 
 
 
257 aa  92  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0061  NLP/P60 family lipoprotein  36.04 
 
 
154 aa  92  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0052  NLP/P60 protein  36.94 
 
 
154 aa  91.7  7e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00304715  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2584  NLP/P60 protein  34.17 
 
 
205 aa  91.7  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.416294  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2476  NLP/P60 protein  37.07 
 
 
214 aa  91.3  9e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.188506  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0061  NLP/P60 protein  36.04 
 
 
159 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000041841 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0059  NLP/P60 protein  36.04 
 
 
159 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.560848  hitchhiker  0.000388338 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0063  NLP/P60 protein  36.04 
 
 
159 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000156196 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  31.6 
 
 
230 aa  91.3  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  44.55 
 
 
207 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  44.55 
 
 
208 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  44.55 
 
 
208 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  40 
 
 
208 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1344  NLP/P60 protein  37.07 
 
 
207 aa  90.1  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  36.92 
 
 
319 aa  90.1  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  37.93 
 
 
265 aa  89.4  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  38.89 
 
 
333 aa  89.7  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  42.02 
 
 
210 aa  89.4  4e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  33.55 
 
 
217 aa  89  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  36.51 
 
 
338 aa  88.6  6e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  40 
 
 
226 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  40 
 
 
225 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>