More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3197 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3197  alanine racemase domain-containing protein  100 
 
 		 219 aa  444  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3923  alanine racemase domain protein  79.45 
 
 		 219 aa  356  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823584  normal  0.338994 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4380  hypothetical protein  77.63 
 
 		 219 aa  351  4e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4249  alanine racemase domain protein  76.71 
 
 		 219 aa  344  6e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.405464 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3208  hypothetical protein  74.31 
 
 		 225 aa  325  3e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491657  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1808  hypothetical protein  70.18 
 
 		 226 aa  306  1.0000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1741  hypothetical protein  70.18 
 
 		 226 aa  304  6e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1094  alanine racemase domain-containing protein  72.77 
 
 		 250 aa  303  1.0000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0438  hypothetical protein  64.79 
 
 		 221 aa  277  7e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0174  hypothetical protein  63.85 
 
 		 228 aa  274  9e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal  0.913317 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0383  hypothetical protein  62.44 
 
 		 221 aa  271  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.69916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0282  hypothetical protein  60.56 
 
 		 219 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0278  alanine racemase domain-containing protein  65.26 
 
 		 232 aa  267  8.999999999999999e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.334709  normal  0.0228737 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0096  hypothetical protein  61.97 
 
 		 225 aa  266  2e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.480165  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0089  hypothetical protein  61.03 
 
 		 224 aa  265  2.9999999999999995e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.937473  normal  0.0909898 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0288  alanine racemase domain protein  63.68 
 
 		 219 aa  265  5e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0102  hypothetical protein  58.14 
 
 		 226 aa  264  5.999999999999999e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0226  alanine racemase domain-containing protein  59.45 
 
 		 230 aa  263  2e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0695521  normal  0.167093 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0335  alanine racemase domain protein  61.75 
 
 		 230 aa  257  9e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00537658 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1403  alanine racemase domain-containing protein  59.05 
 
 		 227 aa  254  6e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1661  alanine racemase domain protein  57.34 
 
 		 244 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.19823 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1285  alanine racemase domain-containing protein  63.02 
 
 		 230 aa  246  1e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1021  alanine racemase domain protein  58.25 
 
 		 227 aa  246  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.952251  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3634  hypothetical protein  56.16 
 
 		 242 aa  246  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.205526  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1857  alanine racemase domain protein  55.87 
 
 		 247 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.821186 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1578  alanine racemase domain-containing protein  55.4 
 
 		 247 aa  241  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.417677  normal  0.0750539 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4107  alanine racemase domain-containing protein  55.05 
 
 		 250 aa  240  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.760524  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5034  alanine racemase domain-containing protein  63.4 
 
 		 214 aa  238  6.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2952  hypothetical protein  55.5 
 
 		 225 aa  234  7e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01766  hypothetical protein  55.76 
 
 		 226 aa  231  5e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.720058  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0042  alanine racemase domain protein  55.87 
 
 		 218 aa  226  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000221923 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3131  alanine racemase domain-containing protein  54.46 
 
 		 220 aa  225  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.803662  hitchhiker  0.000192693 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0048  hypothetical protein  55.4 
 
 		 218 aa  224  6e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.434055 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2762  alanine racemase domain-containing protein  54.93 
 
 		 217 aa  223  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0716815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0414  hypothetical protein  52.58 
 
 		 217 aa  218  6e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0415  alanine racemase domain protein  48.1 
 
 		 225 aa  214  5.9999999999999996e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.837437  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2856  alanine racemase domain-containing protein  52.8 
 
 		 221 aa  214  9e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0170216  normal  0.0492664 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0844  hypothetical protein  53.99 
 
 		 221 aa  210  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2502  alanine racemase domain-containing protein  53.52 
 
 		 221 aa  209  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.936846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3024  hypothetical protein  52.75 
 
 		 220 aa  209  3e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0628  alanine racemase domain protein  55.67 
 
 		 248 aa  202  3e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0643141 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0433  hypothetical protein  55.73 
 
 		 191 aa  202  3e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2054  alanine racemase domain-containing protein  53.49 
 
 		 229 aa  190  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0733965  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  45.61 
 
 		 231 aa  171  9e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2164  alanine racemase domain protein  40.28 
 
 		 219 aa  166  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  39.83 
 
 		 235 aa  155  5.0000000000000005e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  41.23 
 
 		 227 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  45.83 
 
 		 213 aa  151  7e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1137  alanine racemase domain-containing protein  39.11 
 
 		 233 aa  150  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  39.74 
 
 		 231 aa  149  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1127  alanine racemase domain-containing protein  41.33 
 
 		 233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0116545  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2860  hypothetical protein  38.67 
 
 		 228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1288  hypothetical protein  43.24 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  39.57 
 
 		 244 aa  142  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  41.85 
 
 		 237 aa  142  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  43.75 
 
 		 223 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1332  alanine racemase domain-containing protein  38.22 
 
 		 244 aa  141  8e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993906 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  43.75 
 
 		 227 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1630  alanine racemase domain-containing protein  40 
 
 		 229 aa  138  4.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00531953 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  36.28 
 
 		 224 aa  139  4.999999999999999e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3759  hypothetical protein  41.92 
 
 		 238 aa  138  6e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.125293  normal  0.217424 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3884  hypothetical protein  42.04 
 
 		 229 aa  138  6e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.508799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4142  alanine racemase domain-containing protein  39.29 
 
 		 243 aa  138  6e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1193  hypothetical protein  38.67 
 
 		 238 aa  138  6e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3817  hypothetical protein  42.04 
 
 		 257 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1194  hypothetical protein  38.22 
 
 		 238 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.680899 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3641  hypothetical protein  40.18 
 
 		 226 aa  137  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03578  hypothetical protein  39.21 
 
 		 236 aa  137  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3040  alanine racemase domain-containing protein  38.22 
 
 		 232 aa  136  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000913695  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2682  hypothetical protein  39.66 
 
 		 235 aa  137  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00281403  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1264  hypothetical protein  38.22 
 
 		 238 aa  136  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00567806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  40.87 
 
 		 228 aa  137  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1189  hypothetical protein  41.59 
 
 		 245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  40 
 
 		 229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2411  hypothetical protein  41.59 
 
 		 245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.429006  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2598  hypothetical protein  41.59 
 
 		 245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.734317  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1062  hypothetical protein  41 
 
 		 216 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0247  hypothetical protein  44.78 
 
 		 239 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0731  hypothetical protein  44.78 
 
 		 239 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18938  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0328  hypothetical protein  41.59 
 
 		 245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1232  alanine racemase domain-containing protein  38.67 
 
 		 234 aa  135  4e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  normal  0.432188 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3299  hypothetical protein  42.34 
 
 		 232 aa  135  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.244071  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3333  hypothetical protein  42.34 
 
 		 232 aa  135  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0013  hypothetical protein  37 
 
 		 236 aa  135  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1338  alanine racemase domain protein  37.78 
 
 		 239 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300901  hitchhiker  0.000000312862 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2919  alanine racemase domain protein  39.56 
 
 		 236 aa  135  5e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489919  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3346  hypothetical protein  41.59 
 
 		 305 aa  135  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  40.27 
 
 		 232 aa  135  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  37.72 
 
 		 230 aa  135  7.000000000000001e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3352  hypothetical protein  37.78 
 
 		 237 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  41.92 
 
 		 235 aa  134  7.000000000000001e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  40.97 
 
 		 232 aa  134  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2263  alanine racemase domain protein  40.65 
 
 		 212 aa  134  9e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0647  alanine racemase domain-containing protein  44 
 
 		 232 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2687  alanine racemase domain-containing protein  37.78 
 
 		 232 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.91415  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3718  hypothetical protein  38.67 
 
 		 227 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0621  hypothetical protein  43.24 
 
 		 268 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3183  alanine racemase domain-containing protein  37.78 
 
 		 232 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000633261  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2477  hypothetical protein  40.35 
 
 		 235 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.58685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2910  alanine racemase domain-containing protein  43.23 
 
 		 242 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000373899  normal  0.226909 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>