More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0489 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_0988  methyl-accepting chemotaxis protein  65.14 
 
 
695 aa  895    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
698 aa  1405    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000832175  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1117  methyl-accepting chemotaxis protein  68.22 
 
 
657 aa  527  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.593573  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0185  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.9 
 
 
669 aa  514  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3729  methyl-accepting chemotaxis protein  63.66 
 
 
644 aa  510  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.554142  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0214  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  68.84 
 
 
663 aa  511  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.287216 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0563  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  70.62 
 
 
645 aa  503  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.73856 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  69.8 
 
 
644 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.307243 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0943  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  48.38 
 
 
793 aa  472  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.27721  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  47.33 
 
 
785 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0994  methyl-accepting chemotaxis protein  64.1 
 
 
649 aa  451  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6126  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.57 
 
 
650 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.375381  normal  0.0878449 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5151  methyl-accepting chemotaxis protein  56.75 
 
 
776 aa  406  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6402  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.28 
 
 
688 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.579482  normal  0.320846 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4524  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.76 
 
 
661 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.66296 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2893  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.29 
 
 
589 aa  395  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0051  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.97 
 
 
796 aa  394  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000874578 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5554  methyl-accepting chemotaxis protein  55.81 
 
 
653 aa  387  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0672502  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1449  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.19 
 
 
647 aa  383  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9088  methyl-accepting chemotaxis protein  49.14 
 
 
761 aa  385  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5092  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.81 
 
 
626 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.359668  normal  0.0114189 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2608  methyl-accepting chemotaxis protein  53.81 
 
 
655 aa  385  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.445883  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5535  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  69.93 
 
 
591 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.435889 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3921  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  66.67 
 
 
586 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4113  methyl-accepting chemotaxis protein  41.78 
 
 
778 aa  382  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.433818  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5255  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  69.23 
 
 
585 aa  382  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.700683  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0052  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.71 
 
 
778 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0947231 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3632  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  64.58 
 
 
592 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.377399 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4091  methyl-accepting chemotaxis protein  65.5 
 
 
592 aa  379  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5372  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.4 
 
 
627 aa  378  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.756404 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0697  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.36 
 
 
610 aa  375  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2051  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.87 
 
 
717 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.245091  normal  0.347836 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3647  methyl-accepting chemotaxis protein  53.53 
 
 
680 aa  375  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0369  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.25 
 
 
615 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00881781 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.05 
 
 
677 aa  369  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0125911 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2928  methyl-accepting chemotaxis protein  53.98 
 
 
792 aa  371  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1208  methyl-accepting chemotaxis protein  51.16 
 
 
604 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0400  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.39 
 
 
843 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170819 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0305  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.95 
 
 
841 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0401  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.9 
 
 
615 aa  369  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000192098 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0640  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.13 
 
 
604 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.122515  normal  0.297773 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0980  methyl-accepting chemotaxis protein  53.87 
 
 
611 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.442512  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0368  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.75 
 
 
843 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0662296 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0452  methyl-accepting chemotaxis protein  53.09 
 
 
622 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0806  methyl-accepting chemotaxis protein  52.63 
 
 
842 aa  363  4e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3005  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.67 
 
 
665 aa  363  7.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3923  methyl-accepting chemotaxis protein  52 
 
 
843 aa  360  4e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0236  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.79 
 
 
660 aa  358  9.999999999999999e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105118  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4013  methyl-accepting chemotaxis protein  44.78 
 
 
756 aa  358  1.9999999999999998e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2177  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.07 
 
 
602 aa  358  2.9999999999999997e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.180362  normal  0.483778 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1200  methyl-accepting chemotaxis protein  38.73 
 
 
728 aa  357  3.9999999999999996e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3445  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  38.51 
 
 
746 aa  357  5.999999999999999e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.2502  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.82 
 
 
599 aa  356  6.999999999999999e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.367406  normal  0.838811 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1201  methyl-accepting chemotaxis protein  37.71 
 
 
728 aa  356  6.999999999999999e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2927  methyl-accepting chemotaxis protein  46.12 
 
 
730 aa  356  7.999999999999999e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0257741  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0520  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.57 
 
 
636 aa  354  2.9999999999999997e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4775  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.95 
 
 
842 aa  352  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.507772  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0276  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.4 
 
 
657 aa  352  1e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.461968  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0626  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  39.1 
 
 
726 aa  351  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3177  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.43 
 
 
749 aa  346  1e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.726311  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5354  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.76 
 
 
714 aa  345  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.642158  normal  0.0994281 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.82 
 
 
615 aa  345  2e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.371991  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2590  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.77 
 
 
642 aa  345  2e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.156907  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4811  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.33 
 
 
625 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.327513  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5069  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.04 
 
 
714 aa  343  5.999999999999999e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.277036  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0222  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.67 
 
 
642 aa  341  2e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.414219  normal  0.376796 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4686  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.65 
 
 
601 aa  341  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.115608  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.91 
 
 
625 aa  340  4e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0996  methyl-accepting chemotaxis protein  53.18 
 
 
647 aa  338  1.9999999999999998e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  54.36 
 
 
605 aa  337  5e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2860  methyl-accepting chemotaxis protein  49.42 
 
 
668 aa  337  5e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4670  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.94 
 
 
625 aa  337  5.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.817515 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56000  chemotactic transducer PctA  34.14 
 
 
629 aa  336  7e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0512673  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4877  chemotactic transducer PctB  32.57 
 
 
629 aa  336  9e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164155  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2181  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.21 
 
 
606 aa  335  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.440189  normal  0.953277 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3811  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.36 
 
 
840 aa  335  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2705  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51 
 
 
509 aa  335  1e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3511  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.21 
 
 
771 aa  335  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.595827 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5896  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.75 
 
 
605 aa  335  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56010  chemotactic transducer PctB  32.47 
 
 
629 aa  335  2e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5166  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.21 
 
 
669 aa  333  6e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0083  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.41 
 
 
665 aa  332  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0972557  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1613  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.12 
 
 
603 aa  331  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.183078  normal  0.160096 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.2 
 
 
665 aa  331  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.713215  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4874  chemotactic transducer PctC  33.99 
 
 
632 aa  330  4e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.153332  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.83 
 
 
771 aa  330  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.556382 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1061  methyl-accepting chemotaxis protein  33.76 
 
 
626 aa  330  8e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.646209  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2775  methyl-accepting chemotaxis protein  53.55 
 
 
558 aa  328  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536477  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4945  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.3 
 
 
635 aa  328  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55960  chemotactic transducer PctC  33.99 
 
 
632 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.289325  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2144  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.34 
 
 
556 aa  326  7e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9076  methyl-accepting chemotaxis protein  42.94 
 
 
612 aa  326  7e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0793  methyl-accepting chemotaxis protein  46.71 
 
 
740 aa  324  3e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0082  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.42 
 
 
665 aa  324  3e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4876  chemotactic transducer PctA  33.71 
 
 
629 aa  323  5e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.647167  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0906  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 
626 aa  323  6e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1141  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  57.68 
 
 
501 aa  323  8e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.489477  hitchhiker  0.000166409 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1159  methyl-accepting chemotaxis protein  46.92 
 
 
671 aa  322  1.9999999999999998e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.573311  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2791  methyl-accepting chemotaxis protein  57 
 
 
622 aa  318  2e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1355  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48 
 
 
494 aa  318  2e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>