More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0452 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_0452  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 
622 aa  1262    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5151  methyl-accepting chemotaxis protein  67.28 
 
 
776 aa  542  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2928  methyl-accepting chemotaxis protein  60.95 
 
 
792 aa  530  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2927  methyl-accepting chemotaxis protein  64.87 
 
 
730 aa  519  1e-146  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0257741  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5372  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.69 
 
 
627 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.756404 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5092  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.1 
 
 
626 aa  423  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.359668  normal  0.0114189 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9088  methyl-accepting chemotaxis protein  54.1 
 
 
761 aa  422  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0980  methyl-accepting chemotaxis protein  48.24 
 
 
611 aa  397  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.442512  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0697  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.53 
 
 
610 aa  393  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4811  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.34 
 
 
625 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.327513  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2608  methyl-accepting chemotaxis protein  51.28 
 
 
655 aa  392  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.445883  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3005  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.79 
 
 
665 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4113  methyl-accepting chemotaxis protein  55.96 
 
 
778 aa  386  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.433818  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4670  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.05 
 
 
625 aa  388  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.817515 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1117  methyl-accepting chemotaxis protein  41.99 
 
 
657 aa  383  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.593573  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0640  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.69 
 
 
604 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.122515  normal  0.297773 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5554  methyl-accepting chemotaxis protein  50.72 
 
 
653 aa  385  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0672502  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3729  methyl-accepting chemotaxis protein  50 
 
 
644 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.554142  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4686  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.92 
 
 
601 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.115608  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1208  methyl-accepting chemotaxis protein  53.67 
 
 
604 aa  373  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0988  methyl-accepting chemotaxis protein  52.85 
 
 
695 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.09 
 
 
698 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000832175  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0185  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.17 
 
 
669 aa  365  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0214  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.54 
 
 
663 aa  360  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.287216 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0996  methyl-accepting chemotaxis protein  52.64 
 
 
647 aa  355  1e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5896  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.19 
 
 
605 aa  354  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.54 
 
 
644 aa  352  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.307243 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0563  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.66 
 
 
645 aa  351  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.73856 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0368  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.14 
 
 
843 aa  350  5e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0662296 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2177  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43 
 
 
602 aa  348  1e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.180362  normal  0.483778 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0305  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.56 
 
 
841 aa  347  3e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  47.93 
 
 
785 aa  346  6e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0400  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.92 
 
 
843 aa  345  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170819 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.15 
 
 
677 aa  344  2e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0125911 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0082  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.1 
 
 
665 aa  343  8e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4945  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.91 
 
 
635 aa  342  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1449  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.6 
 
 
647 aa  341  2e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6126  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.42 
 
 
650 aa  340  5e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.375381  normal  0.0878449 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3923  methyl-accepting chemotaxis protein  49.27 
 
 
843 aa  339  9.999999999999999e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.88 
 
 
665 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.713215  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3647  methyl-accepting chemotaxis protein  50.12 
 
 
680 aa  336  7e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5166  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.78 
 
 
669 aa  336  7.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4524  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.81 
 
 
661 aa  336  7.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.66296 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0943  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  47.2 
 
 
793 aa  335  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.27721  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4775  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.76 
 
 
842 aa  335  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.507772  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0083  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.27 
 
 
665 aa  335  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0972557  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0590  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.65 
 
 
627 aa  335  2e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.727839  hitchhiker  0.0000148535 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1159  methyl-accepting chemotaxis protein  45.29 
 
 
671 aa  333  4e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.573311  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0806  methyl-accepting chemotaxis protein  48.4 
 
 
842 aa  333  7.000000000000001e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6402  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.63 
 
 
688 aa  333  8e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.579482  normal  0.320846 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2791  methyl-accepting chemotaxis protein  55.08 
 
 
622 aa  332  1e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3714  methyl-accepting chemotaxis protein  42.74 
 
 
679 aa  329  9e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0885803  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1613  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.02 
 
 
603 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.183078  normal  0.160096 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0051  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.32 
 
 
796 aa  326  7e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000874578 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0236  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.65 
 
 
660 aa  326  8.000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105118  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3811  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.78 
 
 
840 aa  324  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0520  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.87 
 
 
636 aa  320  7e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0276  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.42 
 
 
657 aa  319  1e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.461968  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0052  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.34 
 
 
778 aa  318  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0947231 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  51.44 
 
 
605 aa  317  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0222  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.1 
 
 
642 aa  316  8e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.414219  normal  0.376796 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9076  methyl-accepting chemotaxis protein  43.06 
 
 
612 aa  316  8e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.02 
 
 
599 aa  315  9.999999999999999e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.367406  normal  0.838811 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5255  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  53.04 
 
 
585 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.700683  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0994  methyl-accepting chemotaxis protein  47.02 
 
 
649 aa  315  1.9999999999999998e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2181  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.32 
 
 
606 aa  313  7.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.440189  normal  0.953277 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2860  methyl-accepting chemotaxis protein  43.09 
 
 
668 aa  310  4e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0369  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.81 
 
 
615 aa  310  6.999999999999999e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00881781 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2144  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.19 
 
 
556 aa  310  6.999999999999999e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3209  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.26 
 
 
782 aa  309  8e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.684679  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2051  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.49 
 
 
717 aa  309  8e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.245091  normal  0.347836 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1141  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  51.99 
 
 
501 aa  308  1.0000000000000001e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.489477  hitchhiker  0.000166409 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4013  methyl-accepting chemotaxis protein  41.54 
 
 
756 aa  309  1.0000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.74 
 
 
615 aa  308  2.0000000000000002e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.371991  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3921  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  51.78 
 
 
586 aa  307  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2893  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.72 
 
 
589 aa  307  3e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1547  methyl-accepting chemotaxis protein  36.12 
 
 
635 aa  305  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0672502  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0793  methyl-accepting chemotaxis protein  43.71 
 
 
740 aa  304  3.0000000000000004e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3799  methyl-accepting chemotaxis protein  42.89 
 
 
601 aa  304  3.0000000000000004e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2600  methyl-accepting chemotaxis protein  41.21 
 
 
633 aa  304  3.0000000000000004e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.390364  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5354  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.17 
 
 
714 aa  303  8.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.642158  normal  0.0994281 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0401  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.95 
 
 
615 aa  303  9e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000192098 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3632  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  56.25 
 
 
592 aa  302  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.377399 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9065  methyl-accepting chemotaxis protein  40.93 
 
 
509 aa  300  6e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5069  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.41 
 
 
714 aa  298  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.277036  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5535  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  51.61 
 
 
591 aa  298  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.435889 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7643  sensory methylation accepting chemotaxis protein  53.95 
 
 
575 aa  298  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3511  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.47 
 
 
771 aa  297  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.595827 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.5 
 
 
771 aa  297  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.556382 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8025  sensory methylation accepting chemotaxis protein  49.7 
 
 
594 aa  293  6e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2435  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.27 
 
 
507 aa  293  7e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.264745  normal  0.414024 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3177  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.12 
 
 
749 aa  291  2e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.726311  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5523  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.11 
 
 
616 aa  291  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00344787 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1200  methyl-accepting chemotaxis protein  46.65 
 
 
728 aa  290  6e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2705  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.64 
 
 
509 aa  290  6e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1998  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.17 
 
 
624 aa  290  7e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128789  normal  0.773053 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2590  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.33 
 
 
642 aa  290  8e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.156907  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2952  sensory methylation accepting chemotaxis protein  52.86 
 
 
575 aa  288  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0110  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  52.88 
 
 
588 aa  288  2e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.885184  normal  0.0508963 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1201  methyl-accepting chemotaxis protein  43.43 
 
 
728 aa  288  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>