More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1888 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1888  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 212 aa  416  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.265772 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06170  response regulator  78.95 
 
 		 210 aa  314  8e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.624626  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00996  response regulator  78.95 
 
 		 210 aa  314  8e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0885199  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1311  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.57 
 
 		 226 aa  162  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.165019  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0894  two component LuxR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2911  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.9 
 
 		 209 aa  155  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0829  two component LuxR family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 219 aa  155  4e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121621 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3747  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.63 
 
 		 221 aa  151  8e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1230  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.76 
 
 		 215 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3668  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.46 
 
 		 213 aa  150  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2450  two component LuxR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00539256  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1293  LuxR family DNA-binding response regulator  40 
 
 		 216 aa  150  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3042  two component LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 222 aa  149  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280021 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0029  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 214 aa  150  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.317943  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1643  two component LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 219 aa  148  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.118638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4290  two component LuxR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1563  two component LuxR family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.241819 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1972  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.59 
 
 		 217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000794288  unclonable  0.0000000332591 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  38.68 
 
 		 215 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0876  two component LuxR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 233 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.481499  normal  0.345787 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0242  two component LuxR family transcriptional regulator  42.23 
 
 		 211 aa  145  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000159114 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3615  two component LuxR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.378192  normal  0.274637 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1317  response regulator  33.49 
 
 		 220 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.500574  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  38.68 
 
 		 215 aa  145  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  38.68 
 
 		 215 aa  145  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 215 aa  145  5e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0815  two component LuxR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 213 aa  145  5e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4516  two component LuxR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 214 aa  145  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0463384  normal  0.0270495 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.32 
 
 		 214 aa  145  5e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2126  LuxR family DNA-binding response regulator  39.91 
 
 		 219 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118459  normal  0.107719 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  41.97 
 
 		 219 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 215 aa  144  7.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  40.61 
 
 		 215 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  40.61 
 
 		 215 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  40.61 
 
 		 215 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  40.61 
 
 		 215 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  37.96 
 
 		 218 aa  144  8.000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1664  two component LuxR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 218 aa  144  8.000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.49018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  40.61 
 
 		 215 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1667  two component LuxR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.869411 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4715  Two component LuxR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.02 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1691  two component LuxR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 208 aa  143  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  38.21 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2253  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.79 
 
 		 216 aa  142  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.174263  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13730  transcriptional regulator NarL  40.72 
 
 		 219 aa  142  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.817999 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5066  LuxR response regulator receiver  40.7 
 
 		 217 aa  142  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.822528  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3957  two component LuxR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 219 aa  142  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.35 
 
 		 222 aa  142  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 237 aa  142  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_004310  BR0342  LuxR family DNA-binding response regulator  38.22 
 
 		 213 aa  141  6e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0601944  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0358  LuxR family DNA-binding response regulator  38.22 
 
 		 213 aa  141  6e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.363  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 250 aa  141  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1848  response regulator  38.05 
 
 		 218 aa  141  7e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0524957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1971  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.75 
 
 		 216 aa  141  8e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1205  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.58 
 
 		 212 aa  141  8e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0451  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.1 
 
 		 216 aa  141  9e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1229  transcriptional regulator NarL  40.72 
 
 		 219 aa  141  9e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.5 
 
 		 218 aa  141  9e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 237 aa  141  9e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5717  two component LuxR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 220 aa  140  9e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  hitchhiker  0.00405289 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2832  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.23 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.988429  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2415  two component LuxR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 217 aa  140  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2463  response regulator receiver  34.88 
 
 		 217 aa  140  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2482  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.35 
 
 		 211 aa  140  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46622  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1809  two component LuxR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1725  response regulator  37.86 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000351159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0467  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.62 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000507383 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2093  two component LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000328625  normal  0.180863 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  35.98 
 
 		 234 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3509  two component LuxR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 239 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325902  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3601  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.98 
 
 		 222 aa  140  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.324048  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1732  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.86 
 
 		 218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000321601  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1406  DNA-binding response regulator  36.84 
 
 		 215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.253896  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2147  response regulator  37.86 
 
 		 218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000040455  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2299  two component LuxR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1041  response regulator  37.86 
 
 		 218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644757  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1269  response regulator  37.86 
 
 		 218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584326  hitchhiker  0.00198125 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.74 
 
 		 217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2012  response regulator  37.86 
 
 		 218 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124814  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0977  two component LuxR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 223 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00800748  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 303 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2686  response regulator  37.86 
 
 		 218 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000957663  normal  0.053055 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1981  transcriptional regulatory protein DegU, putative  32.71 
 
 		 218 aa  139  3e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 221 aa  139  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1103  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 216 aa  139  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 213 aa  139  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3406  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.71 
 
 		 214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.588591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3676  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.38 
 
 		 214 aa  138  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0625047  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1714  two component LuxR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 213 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.975164  hitchhiker  0.000785935 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.61 
 
 		 213 aa  138  6e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0709  two component LuxR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 224 aa  138  7e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.421893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3862  two component LuxR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 210 aa  137  8.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.734244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2501  response regulator  38.16 
 
 		 218 aa  137  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000242353  normal  0.495647 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1173  response regulator  37.38 
 
 		 218 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000706228  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2162  response regulator  37.38 
 
 		 218 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.284818  hitchhiker  0.000000016111 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1987  two component LuxR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 215 aa  137  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0949899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4296  two component LuxR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 214 aa  137  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>