190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1237 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1237  protein of unknown function DUF885  100 
 
 		 602 aa  1240    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157803  normal  0.118959 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4531  hypothetical protein  42.83 
 
 		 582 aa  432  1e-120  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1935  hypothetical protein  36.18 
 
 		 592 aa  366  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00034791  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2375  putative lipoprotein  34.7 
 
 		 596 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151878  normal  0.0787288 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1907  hypothetical protein  35.23 
 
 		 609 aa  361  2e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000056708  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2167  hypothetical protein  34.43 
 
 		 596 aa  361  2e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.363343  normal  0.850087 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2244  hypothetical protein  34.38 
 
 		 596 aa  360  6e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.81668  normal  0.576675 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2570  putative lipoprotein  34.16 
 
 		 592 aa  353  5.9999999999999994e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2005  hypothetical protein  34.49 
 
 		 590 aa  350  4e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0461311  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2334  protein of unknown function DUF885  34.49 
 
 		 590 aa  349  7e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000423863  normal  0.0462508 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2053  hypothetical protein  34.33 
 
 		 590 aa  347  3e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.807252  hitchhiker  0.000853258 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1770  hypothetical protein  34.05 
 
 		 590 aa  342  9e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.989562  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1990  hypothetical protein  34.6 
 
 		 590 aa  341  2e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2151  hypothetical protein  34.21 
 
 		 599 aa  340  4e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0849922  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2293  hypothetical protein  32.61 
 
 		 591 aa  335  2e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000993307  normal  0.679763 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2317  hypothetical protein  33.5 
 
 		 592 aa  335  2e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000037575  hitchhiker  0.00132048 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1717  putative lipoprotein  33.28 
 
 		 595 aa  333  7.000000000000001e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.271095  normal  0.0681591 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2237  hypothetical protein  33.94 
 
 		 590 aa  329  9e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000589696  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1952  hypothetical protein  35.71 
 
 		 542 aa  316  6e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0887  hypothetical protein  36.12 
 
 		 554 aa  306  8.000000000000001e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0197  protein of unknown function DUF885  34.93 
 
 		 578 aa  305  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5817  hypothetical protein  35.08 
 
 		 536 aa  298  1e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0817  protein of unknown function DUF885  34.52 
 
 		 548 aa  281  4e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0452595 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2949  hypothetical protein  29.35 
 
 		 635 aa  253  9.000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2188  protein of unknown function DUF885  27.11 
 
 		 542 aa  212  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.667858 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1976  protein of unknown function DUF885  28.66 
 
 		 628 aa  191  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0897671 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2501  putative lipoprotein  27.38 
 
 		 540 aa  156  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.137553 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0417  protein of unknown function DUF885  26.07 
 
 		 581 aa  153  8.999999999999999e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.974704 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1385  hypothetical protein  25.95 
 
 		 575 aa  152  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2107  hypothetical protein  26.92 
 
 		 554 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.688349  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5177  protein of unknown function DUF885  24.87 
 
 		 543 aa  125  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1181  putative secreted protein  24.11 
 
 		 506 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.869398 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1391  protein of unknown function DUF885  25.99 
 
 		 583 aa  113  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  22.62 
 
 		 602 aa  113  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  22.36 
 
 		 603 aa  107  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  22.04 
 
 		 603 aa  107  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0089  hypothetical protein  23.31 
 
 		 635 aa  106  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  22.44 
 
 		 603 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  22.61 
 
 		 603 aa  106  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  23.08 
 
 		 589 aa  105  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0095  hypothetical protein  23.34 
 
 		 635 aa  105  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  22.36 
 
 		 603 aa  104  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  25.43 
 
 		 607 aa  102  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  25.43 
 
 		 607 aa  102  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  25.43 
 
 		 607 aa  102  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0683  hypothetical protein  23.79 
 
 		 502 aa  102  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3959  protein of unknown function DUF885  25.47 
 
 		 590 aa  102  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3964  hypothetical protein  23.07 
 
 		 621 aa  101  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  20.98 
 
 		 601 aa  101  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1325  hypothetical protein  22.26 
 
 		 614 aa  100  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0980607 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  21.38 
 
 		 601 aa  100  6e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  25.8 
 
 		 614 aa  100  7e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  21.19 
 
 		 601 aa  100  8e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  20.98 
 
 		 601 aa  100  8e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  22.89 
 
 		 585 aa  100  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  25.14 
 
 		 614 aa  99  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  21.33 
 
 		 617 aa  97.1  8e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  24.86 
 
 		 614 aa  97.1  9e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  23.25 
 
 		 1283 aa  96.7  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  26.4 
 
 		 608 aa  95.5  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1120  hypothetical protein  22.42 
 
 		 627 aa  96.3  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235834  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  25.82 
 
 		 622 aa  95.5  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  25.43 
 
 		 614 aa  95.5  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3972  hypothetical protein  24.34 
 
 		 544 aa  94.7  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.220987  normal  0.634668 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  22.52 
 
 		 599 aa  94.7  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1130  hypothetical protein  22.42 
 
 		 613 aa  94.4  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  21.88 
 
 		 591 aa  93.2  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  24.28 
 
 		 617 aa  92.4  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0094  hypothetical protein  31.61 
 
 		 635 aa  91.7  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  21.9 
 
 		 594 aa  92  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1390  hypothetical protein  27.03 
 
 		 609 aa  90.9  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  22.62 
 
 		 610 aa  90.5  8e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  21.54 
 
 		 587 aa  90.5  8e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  22.95 
 
 		 595 aa  90.1  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0473  protein of unknown function DUF885  24.77 
 
 		 522 aa  89.7  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3398  hypothetical protein  31.45 
 
 		 610 aa  90.1  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1933  hypothetical protein  22.47 
 
 		 629 aa  89.7  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.545709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  21.78 
 
 		 619 aa  90.1  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3047  hypothetical protein  21.73 
 
 		 616 aa  89  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000223999  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  23.38 
 
 		 609 aa  88.6  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  21.44 
 
 		 602 aa  87.4  6e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2230  hypothetical protein  23.79 
 
 		 560 aa  87.4  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.531151  decreased coverage  0.00593781 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4171  hypothetical protein  23.11 
 
 		 496 aa  86.3  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0258196  normal  0.693173 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3032  hypothetical protein  21.76 
 
 		 616 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  33.13 
 
 		 609 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2185  putative lipoprotein  22 
 
 		 617 aa  85.9  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0983749  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  23.42 
 
 		 599 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1650  hypothetical protein  26.18 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  20.09 
 
 		 613 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000182029  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  20.85 
 
 		 616 aa  84.3  0.000000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000502664  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  21.02 
 
 		 616 aa  84.3  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000481618  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3456  hypothetical protein  28.81 
 
 		 605 aa  84.3  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203936  normal  0.029844 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0235  hypothetical protein  23.87 
 
 		 560 aa  84.3  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3202  putative lipoprotein  30.91 
 
 		 633 aa  84  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  21.17 
 
 		 615 aa  84  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  31.93 
 
 		 609 aa  84  0.000000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0043  hypothetical protein  22.65 
 
 		 618 aa  84  0.000000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0062992  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  31.93 
 
 		 609 aa  84  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  31.93 
 
 		 609 aa  84  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  31.93 
 
 		 611 aa  84  0.000000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>