More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2342 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2342  ABC transporter related protein  100 
 
 		 274 aa  549  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477655  normal  0.561455 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1995  ABC transporter related  51.66 
 
 		 289 aa  207  2e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0371  ABC transporter related  50.24 
 
 		 302 aa  203  3e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0926  ABC transporter-related protein  45.45 
 
 		 290 aa  201  8e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00057204  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0438  ABC transporter related  51.52 
 
 		 289 aa  199  3e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0322  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  47.66 
 
 		 296 aa  199  3.9999999999999996e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0345  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  47.66 
 
 		 294 aa  199  6e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.127515  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2671  ABC transporter related  53.3 
 
 		 314 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452313  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1712  ATPase  51.52 
 
 		 299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1442  ABC transporter related  49.75 
 
 		 315 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0417  ABC transporter related  47.57 
 
 		 301 aa  189  2.9999999999999997e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2243  ABC transporter related  47.89 
 
 		 281 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0680  ABC transporter related  44.08 
 
 		 309 aa  189  5.999999999999999e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1716  ABC transporter related protein  47.66 
 
 		 286 aa  187  1e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.604131  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3143  ABC transporter related  49.48 
 
 		 275 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2281  RNA pseudouridine synthase  44.39 
 
 		 285 aa  176  5e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0360  molybdenum transport ATP-binding protein  44.56 
 
 		 283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0582  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA (Sulfate-transporting ATPase)  45.54 
 
 		 291 aa  172  5e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3891  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  50.5 
 
 		 356 aa  171  7.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540067  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0315  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA (Sulfate-transporting ATPase)  44.33 
 
 		 284 aa  171  2e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.599525  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5390  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  48.28 
 
 		 345 aa  170  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.695996  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.94 
 
 		 370 aa  169  6e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3520  ATPase  44.5 
 
 		 243 aa  169  6e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3669  ABC transporter related  44.39 
 
 		 233 aa  168  7e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261724 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1209  ABC transporter related  42.79 
 
 		 380 aa  168  7e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4506  ABC transporter related  44.39 
 
 		 233 aa  168  7e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3858  ABC transporter related  44.39 
 
 		 233 aa  168  7e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4115  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  46.31 
 
 		 357 aa  168  8e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1455  ABC transporter related  41.71 
 
 		 380 aa  168  1e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1903  sulphate transport system permease protein 1  47.52 
 
 		 343 aa  168  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000843013  hitchhiker  0.000000000000895278 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4911  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.95 
 
 		 336 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.69 
 
 		 372 aa  166  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0308  ABC transporter related  43.94 
 
 		 360 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0746  ABC transporter related  41.38 
 
 		 380 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0110  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.06 
 
 		 359 aa  166  5e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2238  ABC molybdate transporter, ATPase subunit  43.93 
 
 		 233 aa  166  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.27159  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3403  sulphate transport system permease protein 1  47.98 
 
 		 356 aa  166  5e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.270321  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0542  ABC transporter related  44.16 
 
 		 346 aa  166  5e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.999499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2659  ABC transporter related  42.38 
 
 		 374 aa  165  5.9999999999999996e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2777  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  47.47 
 
 		 332 aa  165  8e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0811  ABC transporter related protein  42.25 
 
 		 371 aa  165  8e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1349  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  47.29 
 
 		 343 aa  165  8e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1829  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  47 
 
 		 354 aa  165  8e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0107  putative sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  48.06 
 
 		 386 aa  165  8e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  44.67 
 
 		 352 aa  165  9e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1739  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.8 
 
 		 355 aa  165  9e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2841  ABC transporter related  42.38 
 
 		 343 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.355371  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1284  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  42.72 
 
 		 289 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0107  ABC transporter related  45.69 
 
 		 375 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00134117  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2534  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.83 
 
 		 354 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1014  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.07 
 
 		 357 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.939142  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4452  ABC transporter related  38.2 
 
 		 380 aa  163  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3116  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.72 
 
 		 369 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0632  ABC transporter related  45 
 
 		 240 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.225775  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4887  ABC transporter related  47.87 
 
 		 233 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00327201 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5213  ABC transporter related  47.24 
 
 		 346 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5504  ABC transporter related  47.24 
 
 		 346 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5124  ABC transporter related  47.24 
 
 		 346 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  45.81 
 
 		 426 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5846  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  48.51 
 
 		 346 aa  162  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4587  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  45.59 
 
 		 375 aa  162  6e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0123  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  46.31 
 
 		 354 aa  162  6e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0595  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.05 
 
 		 347 aa  162  6e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.645255 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0584  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.05 
 
 		 348 aa  162  7e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3556  ABC transporter related  42.79 
 
 		 370 aa  162  7e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0802709  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1136  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  45.81 
 
 		 240 aa  161  8.000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0559  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.05 
 
 		 327 aa  161  9e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.387345 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3656  ATPase  43.43 
 
 		 366 aa  161  9e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6758  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  49.01 
 
 		 346 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.420036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1391  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.34 
 
 		 350 aa  161  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1047  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.33 
 
 		 330 aa  161  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0507  ABC transporter related protein  50.29 
 
 		 353 aa  160  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.956057 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0569  ABC transporter-related protein  41.1 
 
 		 244 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5476  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  47.03 
 
 		 376 aa  161  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.351267  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2026  ABC transporter related  45.18 
 
 		 349 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1199  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  42.57 
 
 		 357 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3858  sulfate/molybdate ABC transporter ATPase  46.15 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.177813  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2548  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.3 
 
 		 374 aa  160  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.469643  normal  0.012535 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1759  ABC transporter related  43.65 
 
 		 353 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.483638  normal  0.015539 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0781  ABC transporter related  45.05 
 
 		 368 aa  160  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000566525  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0279  ABC transporter, ATPase subunit  44.04 
 
 		 386 aa  160  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.213397  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0943  ABC transporter related  45.55 
 
 		 209 aa  160  2e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000624644  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0782  ABC transporter related  42.72 
 
 		 356 aa  160  2e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4541  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.59 
 
 		 367 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.68861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1960  ABC transporter related  43.54 
 
 		 349 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1300  ABC transporter related  42.93 
 
 		 356 aa  160  2e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.437284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1980  ABC transporter related  45.18 
 
 		 349 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262332  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1128  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA  40.62 
 
 		 357 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4182  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  46.15 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.564485 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1495  sulphate transport system permease protein 1  48.02 
 
 		 338 aa  160  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3696  ABC sulfate/thiosulfate transporter, ATPase subunit CysA  41.74 
 
 		 371 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0791  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  48.51 
 
 		 239 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3754  hypothetical protein  47.03 
 
 		 239 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3431  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.74 
 
 		 371 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.405046 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0562  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 		 374 aa  159  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12425  sulfate-transport ATP-binding protein ABC transporter cysA1  45 
 
 		 351 aa  159  4e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00408359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4615  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  44.44 
 
 		 374 aa  159  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0126  ABC type ATPase  45.59 
 
 		 352 aa  159  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228603 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1642  ABC-type sugar transport system, ATPase component  40.59 
 
 		 361 aa  159  4e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1797  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.29 
 
 		 371 aa  159  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.472003 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>