255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0074 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0076  TAP domain-containing protein  95.36 
 
 
539 aa  1072  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  4.58817e-05 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0057  TAP domain-containing protein  73.31 
 
 
546 aa  817  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3977  TAP domain-containing protein  59.38 
 
 
532 aa  644  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.692071  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3780  TAP domain-containing protein  63.75 
 
 
517 aa  638  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0073  TAP domain protein  77.66 
 
 
545 aa  890  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4864  TAP domain-containing protein  66.02 
 
 
527 aa  660  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0071  alpha/beta fold family hydrolase  87.01 
 
 
539 aa  974  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0071  TAP domain-containing protein  78.41 
 
 
538 aa  888  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0074  TAP domain-containing protein  100 
 
 
535 aa  1117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.523955 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0076  TAP domain-containing protein  76.7 
 
 
549 aa  884  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4278  TAP domain-containing protein  77.98 
 
 
540 aa  883  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4190  TAP domain-containing protein  65.98 
 
 
519 aa  678  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4460  TAP domain-containing protein  62.77 
 
 
533 aa  663  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.726615 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0072  TAP domain-containing protein  99.25 
 
 
535 aa  1108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0068  peptidase S33, prolyl aminopeptidase  61.97 
 
 
521 aa  624  1e-177  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3575  alpha/beta fold family hydrolase  57.69 
 
 
507 aa  582  1e-165  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0722  alpha/beta fold family hydrolase  37.2 
 
 
480 aa  344  3e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02798  cysteine proteinase  35.31 
 
 
533 aa  248  3e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3874  TAP domain protein  33.63 
 
 
508 aa  239  1e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1447  TAP domain-containing protein  31.64 
 
 
511 aa  227  5e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1502  proteinase  31.79 
 
 
513 aa  225  2e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3801  cysteine proteinase  34.19 
 
 
502 aa  216  8e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0184346 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2826  TAP domain-containing protein  28.84 
 
 
688 aa  191  3e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  5.78424e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2538  TAP domain-containing protein  27.91 
 
 
693 aa  189  9e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112565 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0270  TAP domain-containing protein  31.6 
 
 
670 aa  187  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.948991  hitchhiker  0.000175368 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0265  TAP domain-containing protein  29.45 
 
 
669 aa  182  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0441544  normal  0.0338675 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2103  alpha/beta hydrolase fold  24.89 
 
 
645 aa  145  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418615  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3206  TAP domain-containing protein  25.94 
 
 
475 aa  133  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812713  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0079  TAP domain-containing protein  25.85 
 
 
485 aa  133  8e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0123  TAP domain protein  31.08 
 
 
656 aa  123  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0147  alpha/beta fold family hydrolase  25.78 
 
 
668 aa  122  2e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.557879  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3647  alpha/beta fold family hydrolase  26.56 
 
 
680 aa  122  2e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1183  TAP domain-containing protein  27.05 
 
 
495 aa  120  7e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6275  TAP domain-containing protein  26.37 
 
 
476 aa  119  2e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0998  alpha/beta hydrolase fold protein  26.5 
 
 
675 aa  118  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4546  beta-lactamase  29.15 
 
 
740 aa  117  4e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0118  alpha/beta hydrolase fold  26.63 
 
 
503 aa  114  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742968  normal  0.120342 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24850  alpha/beta hydrolase family protein  25.64 
 
 
515 aa  113  8e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2979  alpha/beta hydrolase fold protein  23.11 
 
 
480 aa  111  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.171473 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3391  tripeptidyl-peptidase B  25.64 
 
 
508 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3340  tripeptidyl-peptidase B  25.64 
 
 
508 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478437  normal  0.109915 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0663  TAP domain protein  26.12 
 
 
525 aa  108  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419459  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3329  tripeptidyl-peptidase B  25.85 
 
 
533 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224727  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7044  hypothetical protein  23.7 
 
 
522 aa  103  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393484  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9211  hypothetical protein  25.75 
 
 
485 aa  103  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2904  TAP domain-containing protein  26.07 
 
 
495 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411145  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2436  alpha/beta hydrolase fold protein  22.96 
 
 
484 aa  103  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.425173  normal  0.0661487 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2145  alpha/beta hydrolase fold protein  24.88 
 
 
477 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2523  TAP domain protein  24.3 
 
 
564 aa  99.8  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12253  exported protease  24.35 
 
 
520 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.499354  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0464  TAP domain-containing protein  27.76 
 
 
499 aa  97.8  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000978752 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2906  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
505 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.834545 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3351  alpha/beta hydrolase fold protein  23.11 
 
 
489 aa  96.7  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172382  normal  0.0371725 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0715  TAP domain-containing protein  24.62 
 
 
524 aa  95.5  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2321  TAP domain-containing protein  24.26 
 
 
612 aa  95.1  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279811  normal  0.349466 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3330  tripeptidyl-peptidase B  23.27 
 
 
511 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0380101  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2767  TAP domain-containing protein  25.86 
 
 
546 aa  94.7  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3392  tripeptidyl-peptidase B  23.27 
 
 
511 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2192  TAP domain protein  23.72 
 
 
518 aa  95.1  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3341  tripeptidyl-peptidase B  23.27 
 
 
511 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175683  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3369  TAP domain protein  24.17 
 
 
547 aa  94.7  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0557447  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0577  TAP domain protein  24.11 
 
 
508 aa  94  6e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1652  hypothetical protein  26.18 
 
 
494 aa  93.6  8e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.916188  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3599  TAP domain-containing protein  27.81 
 
 
505 aa  93.6  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2780  tripeptidyl-peptidase B  25.83 
 
 
500 aa  92.4  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834234  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4728  TAP domain-containing protein  25.92 
 
 
506 aa  92  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5024  TAP domain protein  23.89 
 
 
571 aa  91.7  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412323  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0388  TAP domain-containing protein  24.63 
 
 
521 aa  90.9  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0356  TAP domain protein  24.32 
 
 
523 aa  90.5  7e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4537  TAP domain protein  24.94 
 
 
506 aa  90.5  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3464  TAP domain-containing protein  25.42 
 
 
527 aa  90.5  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.660985  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6091  TAP domain-containing protein  27.07 
 
 
504 aa  90.1  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4956  TAP domain protein  23.33 
 
 
507 aa  90.1  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.30314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0881  TAP domain protein  31.73 
 
 
545 aa  89.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.478786  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3600  TAP domain-containing protein  24.35 
 
 
516 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.601455 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6093  TAP domain-containing protein  28.18 
 
 
505 aa  88.2  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2254  TAP domain-containing protein  24.45 
 
 
486 aa  88.2  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.267716 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4710  TAP domain protein  24.71 
 
 
504 aa  87.4  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0066  tripeptidyl-peptidase B  26.6 
 
 
540 aa  87.4  6e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.974168 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12252  exported protease  27.13 
 
 
520 aa  86.3  1e-15  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.212366  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1042  TAP domain-containing protein  24.4 
 
 
535 aa  86.3  1e-15  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0225624 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11121  conserved hypothetical protein  28.68 
 
 
555 aa  85.9  2e-15  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0230414 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2331  putative protease  28.69 
 
 
300 aa  85.1  3e-15  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2729  TAP domain protein  25.74 
 
 
515 aa  84.3  5e-15  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196617  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7303  hypothetical protein  23.97 
 
 
532 aa  84.3  6e-15  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2687  TAP domain protein  26.96 
 
 
643 aa  84  7e-15  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589968  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2416  TAP domain-containing protein  26.01 
 
 
505 aa  82.4  2e-14  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  2.58971e-05  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0644  hypothetical protein  27.8 
 
 
597 aa  82  3e-14  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6092  TAP domain-containing protein  28.52 
 
 
478 aa  81.3  4e-14  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4117  TAP domain-containing protein  22.66 
 
 
556 aa  81.3  4e-14  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3345  TAP domain-containing protein  23.06 
 
 
532 aa  80.9  6e-14  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0319674  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  24.83 
 
 
750 aa  80.5  7e-14  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3257  TAP domain-containing protein  23.87 
 
 
499 aa  79.3  1e-13  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.590122  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2970  TAP domain protein  22.2 
 
 
542 aa  79.7  1e-13  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32712  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1545  TAP domain-containing protein  27.31 
 
 
542 aa  79.7  1e-13  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07410  alpha/beta hydrolase family protein  25 
 
 
525 aa  79  2e-13  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3267  TAP domain protein  24.17 
 
 
538 aa  79.3  2e-13  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  3.17549e-05  decreased coverage  1.57542e-05 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2980  TAP domain protein  26.05 
 
 
557 aa  78.6  3e-13  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.085257  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0907  TAP domain protein  23.81 
 
 
521 aa  77.8  5e-13  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3160  TAP domain protein  30.96 
 
 
527 aa  77.4  6e-13  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>