201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0118 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0118  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
503 aa  1001    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742968  normal  0.120342 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1192  alpha/beta hydrolase fold  35.57 
 
 
490 aa  210  4e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3874  TAP domain protein  32.05 
 
 
508 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0722  alpha/beta fold family hydrolase  28.03 
 
 
480 aa  132  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1447  TAP domain-containing protein  30.77 
 
 
511 aa  120  4.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1502  proteinase  30.09 
 
 
513 aa  119  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02798  cysteine proteinase  30.59 
 
 
533 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0265  TAP domain-containing protein  27.98 
 
 
669 aa  118  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0441544  normal  0.0338675 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0074  TAP domain-containing protein  26.63 
 
 
535 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.523955 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0071  alpha/beta fold family hydrolase  28.05 
 
 
539 aa  115  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0073  TAP domain protein  27.49 
 
 
545 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0072  TAP domain-containing protein  26.39 
 
 
535 aa  114  5e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0270  TAP domain-containing protein  28.88 
 
 
670 aa  114  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.948991  hitchhiker  0.000175368 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0076  TAP domain-containing protein  27.14 
 
 
549 aa  113  6e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0076  TAP domain-containing protein  26.56 
 
 
539 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000458817 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4278  TAP domain-containing protein  27.14 
 
 
540 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4190  TAP domain-containing protein  26.34 
 
 
519 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0071  TAP domain-containing protein  27.47 
 
 
538 aa  110  6e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0057  TAP domain-containing protein  25.74 
 
 
546 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4546  beta-lactamase  38.92 
 
 
740 aa  110  9.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2826  TAP domain-containing protein  27.47 
 
 
688 aa  106  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000578424  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4460  TAP domain-containing protein  25.6 
 
 
533 aa  104  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.726615 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3780  TAP domain-containing protein  26.12 
 
 
517 aa  103  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2538  TAP domain-containing protein  27.76 
 
 
693 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112565 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3575  alpha/beta fold family hydrolase  27.34 
 
 
507 aa  100  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3977  TAP domain-containing protein  25.71 
 
 
532 aa  99  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.692071  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2979  alpha/beta hydrolase fold protein  22.69 
 
 
480 aa  98.6  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.171473 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3647  alpha/beta fold family hydrolase  34.81 
 
 
680 aa  98.2  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0079  TAP domain-containing protein  25.52 
 
 
485 aa  97.8  5e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3206  TAP domain-containing protein  26.32 
 
 
475 aa  95.5  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812713  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0068  peptidase S33, prolyl aminopeptidase  26.29 
 
 
521 aa  94.4  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0147  alpha/beta fold family hydrolase  26.14 
 
 
668 aa  88.2  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.557879  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4864  TAP domain-containing protein  24.44 
 
 
527 aa  88.2  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0123  TAP domain protein  27.78 
 
 
656 aa  87  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3801  cysteine proteinase  37.16 
 
 
502 aa  83.6  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0184346 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1946  TAP domain protein  34.05 
 
 
518 aa  83.6  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0350254  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3330  tripeptidyl-peptidase B  27.08 
 
 
511 aa  80.1  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3392  tripeptidyl-peptidase B  27.08 
 
 
511 aa  80.1  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3341  tripeptidyl-peptidase B  27.08 
 
 
511 aa  80.1  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175683  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24850  alpha/beta hydrolase family protein  34.57 
 
 
515 aa  79.3  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2103  alpha/beta hydrolase fold  19.62 
 
 
645 aa  79.7  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418615  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1183  TAP domain-containing protein  32.61 
 
 
495 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3257  TAP domain-containing protein  34.24 
 
 
499 aa  78.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.590122  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3267  TAP domain protein  28.9 
 
 
538 aa  77.8  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000317549  decreased coverage  0.0000157542 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3345  TAP domain-containing protein  32.31 
 
 
532 aa  76.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0319674  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0841  TAP domain protein  25.57 
 
 
521 aa  76.3  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127306 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2145  alpha/beta hydrolase fold protein  22.05 
 
 
477 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0481  TAP domain protein  28.72 
 
 
539 aa  75.1  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.223264  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1042  TAP domain-containing protein  35.2 
 
 
535 aa  75.9  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0225624 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0663  TAP domain protein  26.2 
 
 
525 aa  75.1  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419459  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7044  hypothetical protein  29.46 
 
 
522 aa  75.1  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393484  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3329  tripeptidyl-peptidase B  32.31 
 
 
533 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224727  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3391  tripeptidyl-peptidase B  32.31 
 
 
508 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3340  tripeptidyl-peptidase B  32.31 
 
 
508 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478437  normal  0.109915 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0185  TAP domain protein  26.56 
 
 
551 aa  73.9  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.696189  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0715  TAP domain-containing protein  30.73 
 
 
524 aa  73.2  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0491  TAP domain protein  34.08 
 
 
515 aa  72.8  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2780  tripeptidyl-peptidase B  30.84 
 
 
500 aa  72.4  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834234  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3464  TAP domain-containing protein  35.2 
 
 
527 aa  72.4  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.660985  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3160  TAP domain protein  32.99 
 
 
527 aa  72.4  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2523  TAP domain protein  29.32 
 
 
564 aa  70.5  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12252  exported protease  27.8 
 
 
520 aa  70.1  0.00000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.212366  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2212  TAP domain-containing protein  27.66 
 
 
520 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.544179  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2656  TAP domain protein  28.09 
 
 
535 aa  69.3  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0201051  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4537  TAP domain protein  34.54 
 
 
506 aa  68.6  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0998  alpha/beta hydrolase fold protein  27.88 
 
 
675 aa  68.6  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2687  TAP domain protein  28.85 
 
 
643 aa  68.2  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589968  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2321  TAP domain-containing protein  31.28 
 
 
612 aa  67.8  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279811  normal  0.349466 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0066  tripeptidyl-peptidase B  32.28 
 
 
540 aa  67.8  0.0000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.974168 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2906  alpha/beta hydrolase fold  30.4 
 
 
505 aa  67.4  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.834545 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2331  putative protease  31.9 
 
 
300 aa  67  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2329  hydrolase, alpha/beta fold family  28.79 
 
 
291 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000968473  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3126  hydrolase, alpha/beta fold family  28.57 
 
 
301 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.83373  normal  0.0124269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4414  hypothetical protein  31.5 
 
 
505 aa  67  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.694835  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2199  hydrolase, alpha/beta fold family  29.69 
 
 
291 aa  67  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4956  TAP domain protein  25.3 
 
 
507 aa  66.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.30314 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32570  alpha/beta hydrolase family protein  32.62 
 
 
541 aa  66.2  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3351  alpha/beta hydrolase fold protein  28.24 
 
 
489 aa  66.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172382  normal  0.0371725 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3369  TAP domain protein  30.43 
 
 
547 aa  66.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0557447  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0472  alpha/beta hydrolase fold protein  28.74 
 
 
525 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0388  TAP domain-containing protein  30.36 
 
 
521 aa  65.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3599  TAP domain-containing protein  29.3 
 
 
505 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4728  TAP domain-containing protein  24.16 
 
 
506 aa  64.3  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1488  TAP domain-containing protein  30.39 
 
 
522 aa  63.9  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026814 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1966  hypothetical protein  27.39 
 
 
530 aa  63.9  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52219  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2276  putative protease  25.37 
 
 
524 aa  63.5  0.000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.494839 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2247  alpha/beta fold family hydrolase  28.65 
 
 
291 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371226  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4973  TAP domain protein  29.13 
 
 
522 aa  63.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39691  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1652  hypothetical protein  21.68 
 
 
494 aa  62  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.916188  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1545  TAP domain-containing protein  29.25 
 
 
542 aa  62  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0356  TAP domain protein  25.66 
 
 
523 aa  62  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0750  putative secreted peptidase  27.94 
 
 
521 aa  62  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1065  TAP domain protein  26.26 
 
 
544 aa  61.6  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0220  TAP domain protein  32.31 
 
 
551 aa  62  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712779 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2042  alpha/beta hydrolase fold  27.51 
 
 
291 aa  62  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2904  TAP domain-containing protein  29.57 
 
 
495 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411145  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2192  TAP domain protein  24.07 
 
 
518 aa  61.2  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7303  hypothetical protein  31.58 
 
 
532 aa  60.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0644  hypothetical protein  28.49 
 
 
597 aa  60.5  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2245  hydrolase, alpha/beta fold family  27.59 
 
 
301 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1528899999999994e-27 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>