193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1183 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1183  TAP domain-containing protein  100 
 
 
495 aa  999    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7044  hypothetical protein  51.29 
 
 
522 aa  476  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393484  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25020  alpha/beta hydrolase family protein  44.54 
 
 
542 aa  353  2.9999999999999997e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4537  TAP domain protein  46.56 
 
 
506 aa  350  3e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0388  TAP domain-containing protein  42.76 
 
 
521 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0577  TAP domain protein  45.58 
 
 
508 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32570  alpha/beta hydrolase family protein  42.15 
 
 
541 aa  320  3e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0066  tripeptidyl-peptidase B  43.61 
 
 
540 aa  319  6e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.974168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8392  TAP domain protein  42.13 
 
 
537 aa  317  2e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258609  normal  0.179275 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0491  TAP domain protein  41.36 
 
 
515 aa  314  1.9999999999999998e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0881  TAP domain protein  39.5 
 
 
545 aa  314  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.478786  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0356  TAP domain protein  42.37 
 
 
523 aa  314  2.9999999999999996e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9211  hypothetical protein  40.72 
 
 
485 aa  311  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4956  TAP domain protein  40.33 
 
 
507 aa  309  8e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.30314 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24850  alpha/beta hydrolase family protein  41.79 
 
 
515 aa  307  3e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2192  TAP domain protein  37.9 
 
 
518 aa  305  2.0000000000000002e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1488  TAP domain-containing protein  38.49 
 
 
522 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026814 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1545  TAP domain-containing protein  37.47 
 
 
542 aa  303  7.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2780  tripeptidyl-peptidase B  38.6 
 
 
500 aa  301  3e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834234  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0841  TAP domain protein  37.85 
 
 
521 aa  298  1e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127306 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3464  TAP domain-containing protein  42 
 
 
527 aa  297  3e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.660985  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3391  tripeptidyl-peptidase B  40.71 
 
 
508 aa  295  9e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3340  tripeptidyl-peptidase B  40.71 
 
 
508 aa  295  9e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478437  normal  0.109915 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3329  tripeptidyl-peptidase B  40.71 
 
 
533 aa  295  1e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224727  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2767  TAP domain-containing protein  38.88 
 
 
546 aa  293  3e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0663  TAP domain protein  40.49 
 
 
525 aa  293  3e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419459  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1946  TAP domain protein  41.41 
 
 
518 aa  292  8e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0350254  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0715  TAP domain-containing protein  38.12 
 
 
524 aa  292  9e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0907  TAP domain protein  39.38 
 
 
521 aa  282  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3330  tripeptidyl-peptidase B  37.76 
 
 
511 aa  277  4e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3392  tripeptidyl-peptidase B  37.76 
 
 
511 aa  277  4e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3341  tripeptidyl-peptidase B  37.76 
 
 
511 aa  277  4e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175683  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07410  alpha/beta hydrolase family protein  37.87 
 
 
525 aa  276  6e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2906  alpha/beta hydrolase fold  40.04 
 
 
505 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.834545 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12252  exported protease  37.95 
 
 
520 aa  272  8.000000000000001e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.212366  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12253  exported protease  37.99 
 
 
520 aa  269  8.999999999999999e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.499354  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3599  TAP domain-containing protein  38.95 
 
 
505 aa  266  5.999999999999999e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3267  TAP domain protein  37.27 
 
 
538 aa  263  6e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000317549  decreased coverage  0.0000157542 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3600  TAP domain-containing protein  38.25 
 
 
516 aa  263  6.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.601455 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2904  TAP domain-containing protein  38.04 
 
 
495 aa  261  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411145  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0185  TAP domain protein  35.08 
 
 
551 aa  241  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.696189  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2656  TAP domain protein  37.89 
 
 
535 aa  238  2e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0201051  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2980  TAP domain protein  37.75 
 
 
557 aa  231  3e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.085257  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1042  TAP domain-containing protein  34.5 
 
 
535 aa  220  5e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0225624 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6275  TAP domain-containing protein  33.83 
 
 
476 aa  211  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1966  hypothetical protein  32.78 
 
 
530 aa  210  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52219  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4357  TAP domain-containing protein  31.25 
 
 
504 aa  209  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619924  normal  0.129935 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6091  TAP domain-containing protein  28.86 
 
 
504 aa  208  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2523  TAP domain protein  31.97 
 
 
564 aa  208  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5935  TAP domain protein  34.48 
 
 
518 aa  205  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235476  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2729  TAP domain protein  33.05 
 
 
515 aa  204  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196617  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0464  TAP domain-containing protein  30.13 
 
 
499 aa  203  6e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000978752 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4728  TAP domain-containing protein  31.25 
 
 
506 aa  202  8e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5024  TAP domain protein  32.98 
 
 
571 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412323  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0220  TAP domain protein  34.15 
 
 
551 aa  196  8.000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712779 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6093  TAP domain-containing protein  28.57 
 
 
505 aa  195  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11121  conserved hypothetical protein  30.75 
 
 
555 aa  194  3e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0230414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1065  TAP domain protein  31.04 
 
 
544 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4414  hypothetical protein  31.57 
 
 
505 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.694835  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7303  hypothetical protein  30.83 
 
 
532 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3316  TAP domain protein  33.47 
 
 
484 aa  189  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0266981  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2970  TAP domain protein  31.54 
 
 
542 aa  189  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32712  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4117  TAP domain-containing protein  32.61 
 
 
556 aa  187  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2416  TAP domain-containing protein  29.5 
 
 
505 aa  186  7e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000258971  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4973  TAP domain protein  31.38 
 
 
522 aa  185  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39691  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3369  TAP domain protein  33.78 
 
 
547 aa  183  7e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0557447  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6092  TAP domain-containing protein  28.42 
 
 
478 aa  182  8.000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0481  TAP domain protein  30.6 
 
 
539 aa  177  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.223264  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2254  TAP domain-containing protein  30.19 
 
 
486 aa  176  8e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.267716 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6090  TAP domain-containing protein  30.33 
 
 
508 aa  176  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3160  TAP domain protein  30.32 
 
 
527 aa  175  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2687  TAP domain protein  30.58 
 
 
643 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589968  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4710  TAP domain protein  32.37 
 
 
504 aa  174  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0644  hypothetical protein  27.04 
 
 
597 aa  171  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1652  hypothetical protein  26.76 
 
 
494 aa  169  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.916188  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4219  alpha/beta hydrolase fold protein  30.63 
 
 
486 aa  168  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2442  TAP domain protein  30.06 
 
 
597 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000431609  normal  0.057711 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3345  TAP domain-containing protein  27.61 
 
 
532 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0319674  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1723  TAP domain protein  28.71 
 
 
536 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00370292  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3616  TAP domain protein  31.58 
 
 
546 aa  162  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.812667  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2331  putative protease  41.41 
 
 
300 aa  161  3e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1310  TAP domain protein  30.51 
 
 
566 aa  160  5e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.330733  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4882  TAP domain-containing protein  30.54 
 
 
493 aa  160  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2276  putative protease  30.28 
 
 
524 aa  155  1e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.494839 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2212  TAP domain-containing protein  29.77 
 
 
520 aa  155  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.544179  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7397  TAP domain-containing protein  29.02 
 
 
613 aa  153  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312183  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24000  alpha/beta hydrolase family protein  27.43 
 
 
514 aa  151  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0638812 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3257  TAP domain-containing protein  28.42 
 
 
499 aa  150  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.590122  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  29.21 
 
 
750 aa  150  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0750  putative secreted peptidase  32.26 
 
 
521 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3544  TAP domain protein  32.29 
 
 
524 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000370838  hitchhiker  0.00997148 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6097  TAP domain protein  30.17 
 
 
559 aa  147  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1577  TAP domain protein  29.7 
 
 
514 aa  145  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2839  TAP domain protein  29.96 
 
 
517 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350131  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4190  TAP domain-containing protein  26.49 
 
 
519 aa  140  6e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3059  hypothetical protein  28.38 
 
 
459 aa  136  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0438  TAP domain protein  27.33 
 
 
542 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.574551  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0071  alpha/beta fold family hydrolase  28.61 
 
 
539 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3650  TAP domain-containing protein  26.53 
 
 
475 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0804319  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3994  TAP domain protein  31.58 
 
 
557 aa  128  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>