171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_24850 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_24850  alpha/beta hydrolase family protein  100 
 
 
515 aa  1027    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0491  TAP domain protein  45.87 
 
 
515 aa  382  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4537  TAP domain protein  46.37 
 
 
506 aa  385  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0388  TAP domain-containing protein  43.83 
 
 
521 aa  362  1e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0356  TAP domain protein  43.24 
 
 
523 aa  359  7e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9211  hypothetical protein  45.8 
 
 
485 aa  351  2e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3464  TAP domain-containing protein  41.88 
 
 
527 aa  342  1e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.660985  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0577  TAP domain protein  43.48 
 
 
508 aa  342  1e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0715  TAP domain-containing protein  39.92 
 
 
524 aa  341  2e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0841  TAP domain protein  41.01 
 
 
521 aa  330  3e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127306 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32570  alpha/beta hydrolase family protein  42.28 
 
 
541 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7044  hypothetical protein  42.47 
 
 
522 aa  324  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393484  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25020  alpha/beta hydrolase family protein  43.04 
 
 
542 aa  324  3e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2780  tripeptidyl-peptidase B  41.81 
 
 
500 aa  318  2e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834234  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4956  TAP domain protein  41.75 
 
 
507 aa  317  4e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.30314 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2192  TAP domain protein  38.72 
 
 
518 aa  313  6.999999999999999e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1183  TAP domain-containing protein  41.79 
 
 
495 aa  307  4.0000000000000004e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8392  TAP domain protein  39.63 
 
 
537 aa  300  6e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258609  normal  0.179275 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3267  TAP domain protein  40.53 
 
 
538 aa  293  5e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000317549  decreased coverage  0.0000157542 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2767  TAP domain-containing protein  38.48 
 
 
546 aa  293  7e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0881  TAP domain protein  35.79 
 
 
545 aa  291  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.478786  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0663  TAP domain protein  40.63 
 
 
525 aa  290  6e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419459  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07410  alpha/beta hydrolase family protein  39.04 
 
 
525 aa  288  1e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1545  TAP domain-containing protein  37.45 
 
 
542 aa  278  1e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1488  TAP domain-containing protein  38.71 
 
 
522 aa  273  8.000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026814 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3330  tripeptidyl-peptidase B  37.82 
 
 
511 aa  272  1e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3392  tripeptidyl-peptidase B  37.82 
 
 
511 aa  272  1e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3341  tripeptidyl-peptidase B  37.82 
 
 
511 aa  272  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175683  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1946  TAP domain protein  37.07 
 
 
518 aa  272  1e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0350254  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2904  TAP domain-containing protein  38.03 
 
 
495 aa  269  8e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411145  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12253  exported protease  38.85 
 
 
520 aa  268  2e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.499354  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0907  TAP domain protein  36.07 
 
 
521 aa  267  4e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3600  TAP domain-containing protein  37.18 
 
 
516 aa  257  3e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.601455 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3329  tripeptidyl-peptidase B  36.81 
 
 
533 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224727  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3391  tripeptidyl-peptidase B  36.89 
 
 
508 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3340  tripeptidyl-peptidase B  36.89 
 
 
508 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478437  normal  0.109915 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0066  tripeptidyl-peptidase B  36.36 
 
 
540 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.974168 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2906  alpha/beta hydrolase fold  37.53 
 
 
505 aa  244  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.834545 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12252  exported protease  37.01 
 
 
520 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.212366  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3599  TAP domain-containing protein  36.74 
 
 
505 aa  241  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2523  TAP domain protein  34.62 
 
 
564 aa  229  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2656  TAP domain protein  36.8 
 
 
535 aa  226  9e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0201051  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0185  TAP domain protein  35.82 
 
 
551 aa  221  3.9999999999999997e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.696189  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2980  TAP domain protein  36.08 
 
 
557 aa  207  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.085257  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2970  TAP domain protein  33.4 
 
 
542 aa  206  6e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32712  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1065  TAP domain protein  31.77 
 
 
544 aa  202  9e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6275  TAP domain-containing protein  30.6 
 
 
476 aa  197  5.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1042  TAP domain-containing protein  32.74 
 
 
535 aa  195  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0225624 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2687  TAP domain protein  34.31 
 
 
643 aa  194  4e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589968  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4728  TAP domain-containing protein  31.2 
 
 
506 aa  194  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6093  TAP domain-containing protein  29.44 
 
 
505 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0464  TAP domain-containing protein  30.56 
 
 
499 aa  186  7e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000978752 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5024  TAP domain protein  35.01 
 
 
571 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412323  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6091  TAP domain-containing protein  29.75 
 
 
504 aa  183  6e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4357  TAP domain-containing protein  29.83 
 
 
504 aa  179  9e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619924  normal  0.129935 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0220  TAP domain protein  32.78 
 
 
551 aa  179  9e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712779 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2729  TAP domain protein  31.14 
 
 
515 aa  178  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196617  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3257  TAP domain-containing protein  31.59 
 
 
499 aa  175  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.590122  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1966  hypothetical protein  30.6 
 
 
530 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52219  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4414  hypothetical protein  32.9 
 
 
505 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.694835  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7303  hypothetical protein  30.89 
 
 
532 aa  174  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2416  TAP domain-containing protein  28.66 
 
 
505 aa  172  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000258971  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4710  TAP domain protein  31.43 
 
 
504 aa  171  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0481  TAP domain protein  31.15 
 
 
539 aa  171  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.223264  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4882  TAP domain-containing protein  31.87 
 
 
493 aa  171  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3345  TAP domain-containing protein  30.27 
 
 
532 aa  167  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0319674  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0750  putative secreted peptidase  32.61 
 
 
521 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6092  TAP domain-containing protein  30.26 
 
 
478 aa  162  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11121  conserved hypothetical protein  30.71 
 
 
555 aa  162  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0230414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5935  TAP domain protein  31.57 
 
 
518 aa  159  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235476  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2442  TAP domain protein  29.41 
 
 
597 aa  158  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000431609  normal  0.057711 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3160  TAP domain protein  30.43 
 
 
527 aa  158  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1652  hypothetical protein  29.01 
 
 
494 aa  158  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.916188  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6090  TAP domain-containing protein  30.87 
 
 
508 aa  156  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2331  putative protease  39.68 
 
 
300 aa  156  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3616  TAP domain protein  30.77 
 
 
546 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.812667  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4973  TAP domain protein  29.92 
 
 
522 aa  154  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39691  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0644  hypothetical protein  27.5 
 
 
597 aa  150  6e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24000  alpha/beta hydrolase family protein  29.04 
 
 
514 aa  150  7e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0638812 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3369  TAP domain protein  29.63 
 
 
547 aa  145  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0557447  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2839  TAP domain protein  29.63 
 
 
517 aa  145  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350131  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1723  TAP domain protein  30.94 
 
 
536 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00370292  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3316  TAP domain protein  30.63 
 
 
484 aa  142  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0266981  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3544  TAP domain protein  32.52 
 
 
524 aa  139  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000370838  hitchhiker  0.00997148 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2212  TAP domain-containing protein  28.12 
 
 
520 aa  137  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.544179  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4219  alpha/beta hydrolase fold protein  29.62 
 
 
486 aa  134  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2254  TAP domain-containing protein  32.78 
 
 
486 aa  128  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.267716 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7397  TAP domain-containing protein  26.36 
 
 
613 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312183  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0438  TAP domain protein  26.85 
 
 
542 aa  125  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.574551  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4117  TAP domain-containing protein  32.96 
 
 
556 aa  124  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2276  putative protease  28.74 
 
 
524 aa  124  5e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.494839 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0071  alpha/beta fold family hydrolase  25.55 
 
 
539 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4190  TAP domain-containing protein  27.65 
 
 
519 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3650  TAP domain-containing protein  27.47 
 
 
475 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0804319  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1310  TAP domain protein  29.26 
 
 
566 aa  119  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.330733  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02798  cysteine proteinase  27.62 
 
 
533 aa  118  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3575  alpha/beta fold family hydrolase  26.22 
 
 
507 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3780  TAP domain-containing protein  25.44 
 
 
517 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0472  alpha/beta hydrolase fold protein  28.51 
 
 
525 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  26.18 
 
 
750 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.689132 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>