218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3206 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3206  TAP domain-containing protein  100 
 
 
475 aa  961    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812713  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0265  TAP domain-containing protein  33.48 
 
 
669 aa  201  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0441544  normal  0.0338675 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2538  TAP domain-containing protein  31.22 
 
 
693 aa  195  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112565 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0270  TAP domain-containing protein  32.6 
 
 
670 aa  191  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.948991  hitchhiker  0.000175368 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2826  TAP domain-containing protein  29.89 
 
 
688 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000578424  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0079  TAP domain-containing protein  29.17 
 
 
485 aa  153  8e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4190  TAP domain-containing protein  26.97 
 
 
519 aa  150  5e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3647  alpha/beta fold family hydrolase  26.79 
 
 
680 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0147  alpha/beta fold family hydrolase  27.75 
 
 
668 aa  144  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.557879  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3780  TAP domain-containing protein  27.33 
 
 
517 aa  144  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2145  alpha/beta hydrolase fold protein  25.8 
 
 
477 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0071  alpha/beta fold family hydrolase  27.52 
 
 
539 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0072  TAP domain-containing protein  26.6 
 
 
535 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0074  TAP domain-containing protein  25.94 
 
 
535 aa  134  5e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.523955 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0071  TAP domain-containing protein  27.02 
 
 
538 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4546  beta-lactamase  37.04 
 
 
740 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0057  TAP domain-containing protein  25.82 
 
 
546 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0076  TAP domain-containing protein  26.25 
 
 
539 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000458817 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4278  TAP domain-containing protein  27.34 
 
 
540 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4460  TAP domain-containing protein  25.44 
 
 
533 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.726615 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3575  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 
507 aa  125  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0073  TAP domain protein  26.87 
 
 
545 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2321  TAP domain-containing protein  28.57 
 
 
612 aa  123  7e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279811  normal  0.349466 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0722  alpha/beta fold family hydrolase  25.56 
 
 
480 aa  123  8e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0076  TAP domain-containing protein  26.11 
 
 
549 aa  123  8e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3977  TAP domain-containing protein  25 
 
 
532 aa  121  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.692071  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2979  alpha/beta hydrolase fold protein  25.93 
 
 
480 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.171473 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4864  TAP domain-containing protein  24.67 
 
 
527 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2103  alpha/beta hydrolase fold  22.78 
 
 
645 aa  114  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418615  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3874  TAP domain protein  25.76 
 
 
508 aa  113  9e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0068  peptidase S33, prolyl aminopeptidase  25.11 
 
 
521 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0123  TAP domain protein  28.63 
 
 
656 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1447  TAP domain-containing protein  25.38 
 
 
511 aa  110  5e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02798  cysteine proteinase  25.81 
 
 
533 aa  109  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1502  proteinase  24.78 
 
 
513 aa  105  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0118  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 
503 aa  95.9  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742968  normal  0.120342 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3801  cysteine proteinase  26.52 
 
 
502 aa  90.1  9e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0184346 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3369  TAP domain protein  25.55 
 
 
547 aa  75.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0557447  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0750  putative secreted peptidase  27.15 
 
 
521 aa  74.3  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07410  alpha/beta hydrolase family protein  26.87 
 
 
525 aa  73.9  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0998  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
675 aa  73.9  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3351  alpha/beta hydrolase fold protein  26.62 
 
 
489 aa  73.9  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172382  normal  0.0371725 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4219  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 
486 aa  72.4  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2212  TAP domain-containing protein  24.45 
 
 
520 aa  72.4  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.544179  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3267  TAP domain protein  25.22 
 
 
538 aa  72.4  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000317549  decreased coverage  0.0000157542 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1183  TAP domain-containing protein  24.51 
 
 
495 aa  71.6  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7044  hypothetical protein  23.01 
 
 
522 aa  71.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393484  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6091  TAP domain-containing protein  26.22 
 
 
504 aa  70.1  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0663  TAP domain protein  23.81 
 
 
525 aa  68.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419459  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0185  TAP domain protein  22.96 
 
 
551 aa  68.2  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.696189  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3600  TAP domain-containing protein  25.74 
 
 
516 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.601455 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2767  TAP domain-containing protein  24.55 
 
 
546 aa  67.4  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1042  TAP domain-containing protein  23.87 
 
 
535 aa  67.4  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0225624 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3329  tripeptidyl-peptidase B  27.51 
 
 
533 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224727  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3330  tripeptidyl-peptidase B  25.43 
 
 
511 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3391  tripeptidyl-peptidase B  30.67 
 
 
508 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3392  tripeptidyl-peptidase B  25.43 
 
 
511 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3340  tripeptidyl-peptidase B  30.67 
 
 
508 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478437  normal  0.109915 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3341  tripeptidyl-peptidase B  25.43 
 
 
511 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175683  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2906  alpha/beta hydrolase fold  25.77 
 
 
505 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.834545 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1192  alpha/beta hydrolase fold  30.47 
 
 
490 aa  63.5  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2254  TAP domain-containing protein  23.18 
 
 
486 aa  63.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.267716 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2331  putative protease  29.36 
 
 
300 aa  62.4  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3951  proline iminopeptidase  29.17 
 
 
322 aa  62  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3257  TAP domain-containing protein  22.44 
 
 
499 aa  61.6  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.590122  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3599  TAP domain-containing protein  30.57 
 
 
505 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6275  TAP domain-containing protein  24.89 
 
 
476 aa  61.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2980  TAP domain protein  29.74 
 
 
557 aa  61.2  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.085257  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1488  TAP domain-containing protein  23 
 
 
522 aa  60.1  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026814 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4537  TAP domain protein  25.33 
 
 
506 aa  60.1  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4414  hypothetical protein  30.09 
 
 
505 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.694835  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12253  exported protease  28.68 
 
 
520 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.499354  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12252  exported protease  28.64 
 
 
520 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.212366  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3059  hypothetical protein  28.44 
 
 
459 aa  59.3  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2436  alpha/beta hydrolase fold protein  32.22 
 
 
484 aa  58.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.425173  normal  0.0661487 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0894  proline iminopeptidase  27.32 
 
 
311 aa  58.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0691  proline iminopeptidase  25.73 
 
 
313 aa  58.2  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.527577 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2590  proline iminopeptidase  33.12 
 
 
328 aa  57.8  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.704595 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0881  TAP domain protein  27.49 
 
 
545 aa  57.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.478786  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0464  TAP domain-containing protein  24.24 
 
 
499 aa  57.8  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000978752 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1545  TAP domain-containing protein  22.27 
 
 
542 aa  56.6  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5024  TAP domain protein  25.85 
 
 
571 aa  56.6  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412323  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2656  TAP domain protein  26.79 
 
 
535 aa  56.2  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0201051  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2729  TAP domain protein  28.38 
 
 
515 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196617  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2904  TAP domain-containing protein  24.44 
 
 
495 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411145  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2370  proline iminopeptidase  25.69 
 
 
296 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1966  hypothetical protein  22.96 
 
 
530 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52219  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2056  proline iminopeptidase  29.45 
 
 
324 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604828  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0476  alpha/beta hydrolase fold protein  23.97 
 
 
625 aa  55.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0548452  normal  0.176558 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3412  TAP domain protein  35.06 
 
 
766 aa  55.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04582  proline iminopeptidase  29.14 
 
 
313 aa  55.5  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2416  TAP domain-containing protein  27.84 
 
 
505 aa  55.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000258971  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2780  tripeptidyl-peptidase B  28.43 
 
 
500 aa  54.7  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834234  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0850  prolyl aminopeptidase  24.85 
 
 
313 aa  54.7  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0481  TAP domain protein  23.69 
 
 
539 aa  55.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.223264  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2133  proline iminopeptidase  25.93 
 
 
315 aa  54.7  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0577  TAP domain protein  23.33 
 
 
508 aa  54.7  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1652  hypothetical protein  29.88 
 
 
494 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.916188  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4728  TAP domain-containing protein  23.73 
 
 
506 aa  54.3  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2776  proline iminopeptidase  25.83 
 
 
313 aa  53.9  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00879626  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>