210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4956 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_4956  TAP domain protein  100 
 
 		 507 aa  1006    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.30314 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2780  tripeptidyl-peptidase B  58.87 
 
 		 500 aa  536  1e-151  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834234  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4537  TAP domain protein  48.95 
 
 		 506 aa  432  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9211  hypothetical protein  52.12 
 
 		 485 aa  419  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3464  TAP domain-containing protein  47.71 
 
 		 527 aa  415  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.660985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0388  TAP domain-containing protein  44.77 
 
 		 521 aa  363  3e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0491  TAP domain protein  45.4 
 
 		 515 aa  361  1e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32570  alpha/beta hydrolase family protein  42.03 
 
 		 541 aa  350  2e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0577  TAP domain protein  44.38 
 
 		 508 aa  348  1e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2192  TAP domain protein  40.34 
 
 		 518 aa  347  4e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0663  TAP domain protein  43.37 
 
 		 525 aa  340  4e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25020  alpha/beta hydrolase family protein  43.93 
 
 		 542 aa  340  5e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0841  TAP domain protein  40.46 
 
 		 521 aa  336  5.999999999999999e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127306 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0715  TAP domain-containing protein  40.62 
 
 		 524 aa  333  6e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8392  TAP domain protein  39.75 
 
 		 537 aa  332  1e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258609  normal  0.179275 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24850  alpha/beta hydrolase family protein  41.75 
 
 		 515 aa  317  4e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0356  TAP domain protein  43.64 
 
 		 523 aa  315  9.999999999999999e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3330  tripeptidyl-peptidase B  39.09 
 
 		 511 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3392  tripeptidyl-peptidase B  39.09 
 
 		 511 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3341  tripeptidyl-peptidase B  39.09 
 
 		 511 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175683  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1183  TAP domain-containing protein  40.33 
 
 		 495 aa  309  8e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7044  hypothetical protein  38.6 
 
 		 522 aa  308  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0881  TAP domain protein  36.88 
 
 		 545 aa  306  4.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.478786  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2904  TAP domain-containing protein  39.38 
 
 		 495 aa  298  2e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411145  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12253  exported protease  37.89 
 
 		 520 aa  295  2e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.499354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07410  alpha/beta hydrolase family protein  37.69 
 
 		 525 aa  293  4e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3600  TAP domain-containing protein  38.25 
 
 		 516 aa  292  9e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601455 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0907  TAP domain protein  40.15 
 
 		 521 aa  286  4e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3391  tripeptidyl-peptidase B  38.98 
 
 		 508 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3340  tripeptidyl-peptidase B  38.98 
 
 		 508 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478437  normal  0.109915 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3329  tripeptidyl-peptidase B  38.98 
 
 		 533 aa  281  3e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224727  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2767  TAP domain-containing protein  36.47 
 
 		 546 aa  272  9e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1946  TAP domain protein  38.52 
 
 		 518 aa  272  1e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0350254  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1488  TAP domain-containing protein  38.67 
 
 		 522 aa  271  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00026814 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0066  tripeptidyl-peptidase B  38.86 
 
 		 540 aa  269  7e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.974168 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3267  TAP domain protein  37.99 
 
 		 538 aa  269  8e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000317549  decreased coverage  0.0000157542 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1545  TAP domain-containing protein  37.45 
 
 		 542 aa  266  5e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2980  TAP domain protein  40.5 
 
 		 557 aa  264  3e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.085257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12252  exported protease  37.89 
 
 		 520 aa  262  8.999999999999999e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.212366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2906  alpha/beta hydrolase fold  37.06 
 
 		 505 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.834545 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2656  TAP domain protein  35.61 
 
 		 535 aa  243  5e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0201051  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3599  TAP domain-containing protein  35.91 
 
 		 505 aa  243  5e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0185  TAP domain protein  34.84 
 
 		 551 aa  230  4e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.696189  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1042  TAP domain-containing protein  34.79 
 
 		 535 aa  219  7e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0225624 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2523  TAP domain protein  34.18 
 
 		 564 aa  219  7e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3616  TAP domain protein  34.55 
 
 		 546 aa  207  4e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.812667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1966  hypothetical protein  31.17 
 
 		 530 aa  207  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6093  TAP domain-containing protein  32.98 
 
 		 505 aa  206  6e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2687  TAP domain protein  34.11 
 
 		 643 aa  206  7e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4728  TAP domain-containing protein  33.07 
 
 		 506 aa  202  8e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0220  TAP domain protein  34.94 
 
 		 551 aa  202  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712779 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6091  TAP domain-containing protein  30.29 
 
 		 504 aa  201  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0464  TAP domain-containing protein  32.63 
 
 		 499 aa  198  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000978752 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3345  TAP domain-containing protein  33.27 
 
 		 532 aa  197  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0319674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6275  TAP domain-containing protein  31.66 
 
 		 476 aa  197  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2729  TAP domain protein  33.13 
 
 		 515 aa  196  8.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196617  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0750  putative secreted peptidase  33.96 
 
 		 521 aa  195  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4357  TAP domain-containing protein  32.33 
 
 		 504 aa  189  7e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619924  normal  0.129935 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3369  TAP domain protein  30.19 
 
 		 547 aa  187  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0557447  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2970  TAP domain protein  31.24 
 
 		 542 aa  182  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32712  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6092  TAP domain-containing protein  30.61 
 
 		 478 aa  182  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0481  TAP domain protein  32.92 
 
 		 539 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.223264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7303  hypothetical protein  32.35 
 
 		 532 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4414  hypothetical protein  31.24 
 
 		 505 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.694835  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1065  TAP domain protein  28.94 
 
 		 544 aa  178  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5935  TAP domain protein  32.55 
 
 		 518 aa  177  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235476  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3316  TAP domain protein  32.84 
 
 		 484 aa  177  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0266981  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1723  TAP domain protein  32.79 
 
 		 536 aa  177  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00370292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3160  TAP domain protein  29.82 
 
 		 527 aa  172  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4710  TAP domain protein  31.33 
 
 		 504 aa  172  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2254  TAP domain-containing protein  30.54 
 
 		 486 aa  171  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.267716 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11121  conserved hypothetical protein  29.18 
 
 		 555 aa  169  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0230414 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  29.86 
 
 		 750 aa  167  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2416  TAP domain-containing protein  28.02 
 
 		 505 aa  164  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000258971  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3257  TAP domain-containing protein  28.81 
 
 		 499 aa  164  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.590122  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5024  TAP domain protein  30.7 
 
 		 571 aa  163  7e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412323  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2331  putative protease  40.87 
 
 		 300 aa  161  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4882  TAP domain-containing protein  31.93 
 
 		 493 aa  158  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6090  TAP domain-containing protein  30 
 
 		 508 aa  156  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4219  alpha/beta hydrolase fold protein  31.59 
 
 		 486 aa  154  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3650  TAP domain-containing protein  29.36 
 
 		 475 aa  152  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0804319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2212  TAP domain-containing protein  29.77 
 
 		 520 aa  150  7e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.544179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1652  hypothetical protein  26.81 
 
 		 494 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.916188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24000  alpha/beta hydrolase family protein  28.4 
 
 		 514 aa  145  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0638812 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2276  putative protease  30.51 
 
 		 524 aa  144  3e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.494839 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7397  TAP domain-containing protein  27.59 
 
 		 613 aa  140  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2442  TAP domain protein  43.35 
 
 		 597 aa  134  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000431609  normal  0.057711 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2750  TAP domain-containing protein  27.89 
 
 		 490 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.51195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1310  TAP domain protein  28.46 
 
 		 566 aa  132  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.330733  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3059  hypothetical protein  26.87 
 
 		 459 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2839  TAP domain protein  34.33 
 
 		 517 aa  130  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350131  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6097  TAP domain protein  30.63 
 
 		 559 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4973  TAP domain protein  36.45 
 
 		 522 aa  129  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39691  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4117  TAP domain-containing protein  36.64 
 
 		 556 aa  127  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3994  TAP domain protein  31.25 
 
 		 557 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3544  TAP domain protein  30.97 
 
 		 524 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000370838  hitchhiker  0.00997148 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0644  hypothetical protein  32.59 
 
 		 597 aa  120  9e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0472  alpha/beta hydrolase fold protein  35.18 
 
 		 525 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0438  TAP domain protein  31.49 
 
 		 542 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.574551  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02580  alpha/beta hydrolase family protein  26.85 
 
 		 623 aa  115  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.978734  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>