142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3994 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3994  TAP domain protein  100 
 
 		 557 aa  1110    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1310  TAP domain protein  36.22 
 
 		 566 aa  222  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.330733  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2839  TAP domain protein  32.72 
 
 		 517 aa  185  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350131  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6097  TAP domain protein  34.61 
 
 		 559 aa  182  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0481  TAP domain protein  32.01 
 
 		 539 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.223264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3316  TAP domain protein  32.02 
 
 		 484 aa  165  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0266981  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02580  alpha/beta hydrolase family protein  29.27 
 
 		 623 aa  160  6e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.978734  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4710  TAP domain protein  31.05 
 
 		 504 aa  159  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7303  hypothetical protein  31.09 
 
 		 532 aa  159  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25020  alpha/beta hydrolase family protein  29.42 
 
 		 542 aa  155  2.9999999999999998e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1042  TAP domain-containing protein  32.32 
 
 		 535 aa  152  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0225624 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3345  TAP domain-containing protein  30.51 
 
 		 532 aa  152  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0319674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4117  TAP domain-containing protein  30.83 
 
 		 556 aa  151  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4414  hypothetical protein  31 
 
 		 505 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.694835  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1966  hypothetical protein  30.48 
 
 		 530 aa  146  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52219  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1183  TAP domain-containing protein  31.58 
 
 		 495 aa  145  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8392  TAP domain protein  29.76 
 
 		 537 aa  144  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258609  normal  0.179275 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4956  TAP domain protein  31.72 
 
 		 507 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.30314 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1723  TAP domain protein  30.58 
 
 		 536 aa  141  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00370292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2780  tripeptidyl-peptidase B  28.2 
 
 		 500 aa  139  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834234  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1545  TAP domain-containing protein  29.02 
 
 		 542 aa  139  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2523  TAP domain protein  30.32 
 
 		 564 aa  137  7.000000000000001e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2192  TAP domain protein  38.03 
 
 		 518 aa  136  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6096  TAP domain protein  32.89 
 
 		 557 aa  135  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3616  TAP domain protein  31.32 
 
 		 546 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.812667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0715  TAP domain-containing protein  34.96 
 
 		 524 aa  134  5e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4728  TAP domain-containing protein  27.52 
 
 		 506 aa  133  7.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0841  TAP domain protein  34.18 
 
 		 521 aa  132  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127306 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0750  putative secreted peptidase  29.66 
 
 		 521 aa  131  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4973  TAP domain protein  40.78 
 
 		 522 aa  131  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39691  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2906  alpha/beta hydrolase fold  28.8 
 
 		 505 aa  131  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.834545 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4537  TAP domain protein  29.88 
 
 		 506 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3464  TAP domain-containing protein  38.89 
 
 		 527 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.660985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2212  TAP domain-containing protein  30.46 
 
 		 520 aa  130  9.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.544179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0066  tripeptidyl-peptidase B  29.55 
 
 		 540 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.974168 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24850  alpha/beta hydrolase family protein  29.31 
 
 		 515 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3369  TAP domain protein  30.21 
 
 		 547 aa  126  9e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0557447  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7044  hypothetical protein  27.81 
 
 		 522 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3329  tripeptidyl-peptidase B  30.55 
 
 		 533 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224727  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3391  tripeptidyl-peptidase B  30.55 
 
 		 508 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3340  tripeptidyl-peptidase B  30.55 
 
 		 508 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478437  normal  0.109915 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7397  TAP domain-containing protein  27.37 
 
 		 613 aa  124  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32570  alpha/beta hydrolase family protein  32.93 
 
 		 541 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3160  TAP domain protein  29.28 
 
 		 527 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0663  TAP domain protein  36.44 
 
 		 525 aa  121  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0356  TAP domain protein  36.89 
 
 		 523 aa  120  4.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2687  TAP domain protein  27.72 
 
 		 643 aa  119  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589968  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2980  TAP domain protein  30.22 
 
 		 557 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.085257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3330  tripeptidyl-peptidase B  27.54 
 
 		 511 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0388  TAP domain-containing protein  28.46 
 
 		 521 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3392  tripeptidyl-peptidase B  27.54 
 
 		 511 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3341  tripeptidyl-peptidase B  27.54 
 
 		 511 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175683  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3599  TAP domain-containing protein  27.78 
 
 		 505 aa  118  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1488  TAP domain-containing protein  28.57 
 
 		 522 aa  118  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00026814 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0907  TAP domain protein  31.14 
 
 		 521 aa  117  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1946  TAP domain protein  30.06 
 
 		 518 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0350254  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0464  TAP domain-containing protein  26.49 
 
 		 499 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000978752 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6275  TAP domain-containing protein  39.81 
 
 		 476 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2904  TAP domain-containing protein  28.33 
 
 		 495 aa  114  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411145  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3267  TAP domain protein  26.31 
 
 		 538 aa  114  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000317549  decreased coverage  0.0000157542 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07410  alpha/beta hydrolase family protein  27.66 
 
 		 525 aa  114  7.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0577  TAP domain protein  36.67 
 
 		 508 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0491  TAP domain protein  29.69 
 
 		 515 aa  112  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0881  TAP domain protein  32.61 
 
 		 545 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.478786  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2785  TAP domain protein  30.89 
 
 		 480 aa  110  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000127217  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5935  TAP domain protein  29.12 
 
 		 518 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235476  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4357  TAP domain-containing protein  30.92 
 
 		 504 aa  107  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619924  normal  0.129935 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3600  TAP domain-containing protein  30.05 
 
 		 516 aa  107  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9211  hypothetical protein  30.17 
 
 		 485 aa  107  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12252  exported protease  35.9 
 
 		 520 aa  105  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.212366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0185  TAP domain protein  27.95 
 
 		 551 aa  105  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.696189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6091  TAP domain-containing protein  26.54 
 
 		 504 aa  104  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2767  TAP domain-containing protein  28.16 
 
 		 546 aa  103  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2656  TAP domain protein  35.32 
 
 		 535 aa  99.4  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0201051  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12253  exported protease  27.37 
 
 		 520 aa  98.6  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.499354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5024  TAP domain protein  27.86 
 
 		 571 aa  98.6  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412323  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3412  TAP domain protein  30.97 
 
 		 766 aa  97.8  5e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3257  TAP domain-containing protein  27.25 
 
 		 499 aa  97.4  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.590122  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2331  putative protease  36.79 
 
 		 300 aa  96.7  9e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0438  TAP domain protein  32.89 
 
 		 542 aa  97.1  9e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.574551  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0220  TAP domain protein  32.23 
 
 		 551 aa  96.3  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712779 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4219  alpha/beta hydrolase fold protein  27.47 
 
 		 486 aa  95.9  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2729  TAP domain protein  31.6 
 
 		 515 aa  94  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196617  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0644  hypothetical protein  22.68 
 
 		 597 aa  93.2  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11121  conserved hypothetical protein  32.91 
 
 		 555 aa  92.8  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0230414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2970  TAP domain protein  31.14 
 
 		 542 aa  90.1  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32712  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0472  alpha/beta hydrolase fold protein  32.64 
 
 		 525 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6093  TAP domain-containing protein  28.78 
 
 		 505 aa  88.2  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2416  TAP domain-containing protein  29.96 
 
 		 505 aa  87.4  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000258971  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1652  hypothetical protein  22.74 
 
 		 494 aa  87.4  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.916188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2276  putative protease  26.97 
 
 		 524 aa  86.3  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.494839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  33.81 
 
 		 750 aa  85.1  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4882  TAP domain-containing protein  29.3 
 
 		 493 aa  84.7  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2442  TAP domain protein  33.65 
 
 		 597 aa  84.3  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000431609  normal  0.057711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3059  hypothetical protein  27.57 
 
 		 459 aa  83.6  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6092  TAP domain-containing protein  28.11 
 
 		 478 aa  79.3  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05429  conserved hypothetical protein  26.99 
 
 		 600 aa  78.2  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00467317  normal  0.0133715 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0057  TAP domain-containing protein  25.21 
 
 		 546 aa  77.4  0.0000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1065  TAP domain protein  29.41 
 
 		 544 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2254  TAP domain-containing protein  28.3 
 
 		 486 aa  75.5  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.267716 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>