165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3160 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_3160  TAP domain protein  100 
 
 
527 aa  1064    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3345  TAP domain-containing protein  39.18 
 
 
532 aa  347  3e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0319674  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4973  TAP domain protein  43.88 
 
 
522 aa  337  2.9999999999999997e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39691  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3316  TAP domain protein  41.35 
 
 
484 aa  313  4.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0266981  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4710  TAP domain protein  39.78 
 
 
504 aa  304  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1723  TAP domain protein  41.53 
 
 
536 aa  301  1e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00370292  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4117  TAP domain-containing protein  35.21 
 
 
556 aa  213  9e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7303  hypothetical protein  34.67 
 
 
532 aa  210  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1042  TAP domain-containing protein  33.92 
 
 
535 aa  206  8e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0225624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4414  hypothetical protein  33.47 
 
 
505 aa  203  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.694835  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0481  TAP domain protein  33.47 
 
 
539 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.223264  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1966  hypothetical protein  31.41 
 
 
530 aa  197  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52219  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0663  TAP domain protein  31.83 
 
 
525 aa  192  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419459  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4728  TAP domain-containing protein  32.53 
 
 
506 aa  185  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3369  TAP domain protein  32.19 
 
 
547 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0557447  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3329  tripeptidyl-peptidase B  32.57 
 
 
533 aa  179  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224727  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3391  tripeptidyl-peptidase B  32.57 
 
 
508 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3340  tripeptidyl-peptidase B  32.57 
 
 
508 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478437  normal  0.109915 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1183  TAP domain-containing protein  30.66 
 
 
495 aa  178  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4956  TAP domain protein  29.73 
 
 
507 aa  176  9e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.30314 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0907  TAP domain protein  32.79 
 
 
521 aa  172  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4537  TAP domain protein  31.39 
 
 
506 aa  170  5e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7397  TAP domain-containing protein  31.2 
 
 
613 aa  170  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312183  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0577  TAP domain protein  31.17 
 
 
508 aa  167  4e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2980  TAP domain protein  33.61 
 
 
557 aa  167  5e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.085257  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3616  TAP domain protein  31.53 
 
 
546 aa  167  5e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.812667  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25020  alpha/beta hydrolase family protein  30.06 
 
 
542 aa  166  8e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07410  alpha/beta hydrolase family protein  30.61 
 
 
525 aa  166  8e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2780  tripeptidyl-peptidase B  28.27 
 
 
500 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834234  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1310  TAP domain protein  30.99 
 
 
566 aa  166  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.330733  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12252  exported protease  31.55 
 
 
520 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.212366  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2906  alpha/beta hydrolase fold  32.67 
 
 
505 aa  163  7e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.834545 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3267  TAP domain protein  30.65 
 
 
538 aa  163  8.000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000317549  decreased coverage  0.0000157542 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3464  TAP domain-containing protein  29.18 
 
 
527 aa  163  8.000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.660985  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2904  TAP domain-containing protein  30.58 
 
 
495 aa  162  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411145  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3330  tripeptidyl-peptidase B  29.39 
 
 
511 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3392  tripeptidyl-peptidase B  29.39 
 
 
511 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3341  tripeptidyl-peptidase B  29.39 
 
 
511 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175683  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2767  TAP domain-containing protein  29.28 
 
 
546 aa  161  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24850  alpha/beta hydrolase family protein  30.06 
 
 
515 aa  160  4e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2523  TAP domain protein  30.18 
 
 
564 aa  160  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9211  hypothetical protein  29.96 
 
 
485 aa  160  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0388  TAP domain-containing protein  30.33 
 
 
521 aa  160  6e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0356  TAP domain protein  29.92 
 
 
523 aa  159  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2970  TAP domain protein  29.88 
 
 
542 aa  159  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32712  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32570  alpha/beta hydrolase family protein  28.57 
 
 
541 aa  158  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7044  hypothetical protein  30.46 
 
 
522 aa  157  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393484  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0491  TAP domain protein  31.27 
 
 
515 aa  157  6e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0472  alpha/beta hydrolase fold protein  38.02 
 
 
525 aa  157  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1065  TAP domain protein  28.63 
 
 
544 aa  157  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6275  TAP domain-containing protein  29.74 
 
 
476 aa  156  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2212  TAP domain-containing protein  30.68 
 
 
520 aa  156  8e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.544179  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3599  TAP domain-containing protein  31.02 
 
 
505 aa  156  9e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0750  putative secreted peptidase  31.59 
 
 
521 aa  155  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0715  TAP domain-containing protein  28.69 
 
 
524 aa  155  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2192  TAP domain protein  29.25 
 
 
518 aa  156  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3600  TAP domain-containing protein  30.91 
 
 
516 aa  155  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.601455 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0841  TAP domain protein  28.78 
 
 
521 aa  155  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127306 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8392  TAP domain protein  31.63 
 
 
537 aa  154  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258609  normal  0.179275 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2687  TAP domain protein  38.05 
 
 
643 aa  153  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589968  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5024  TAP domain protein  32.37 
 
 
571 aa  151  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412323  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1946  TAP domain protein  31.2 
 
 
518 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0350254  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0881  TAP domain protein  27.14 
 
 
545 aa  148  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.478786  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2656  TAP domain protein  30.8 
 
 
535 aa  148  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0201051  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4219  alpha/beta hydrolase fold protein  30.88 
 
 
486 aa  148  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0464  TAP domain-containing protein  26.51 
 
 
499 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000978752 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1545  TAP domain-containing protein  28.16 
 
 
542 aa  145  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6097  TAP domain protein  30.8 
 
 
559 aa  145  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12253  exported protease  26.65 
 
 
520 aa  141  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.499354  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2442  TAP domain protein  28.6 
 
 
597 aa  140  4.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000431609  normal  0.057711 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0066  tripeptidyl-peptidase B  29.3 
 
 
540 aa  138  3.0000000000000003e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.974168 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2729  TAP domain protein  29.11 
 
 
515 aa  138  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196617  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0644  hypothetical protein  27.27 
 
 
597 aa  137  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0220  TAP domain protein  35.79 
 
 
551 aa  135  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712779 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5935  TAP domain protein  29.38 
 
 
518 aa  135  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235476  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6093  TAP domain-containing protein  26.03 
 
 
505 aa  134  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6091  TAP domain-containing protein  26.32 
 
 
504 aa  133  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4357  TAP domain-containing protein  25.96 
 
 
504 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619924  normal  0.129935 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0185  TAP domain protein  28.77 
 
 
551 aa  131  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.696189  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2785  TAP domain protein  31.14 
 
 
480 aa  131  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000127217  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0438  TAP domain protein  34.36 
 
 
542 aa  130  6e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.574551  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3257  TAP domain-containing protein  30.06 
 
 
499 aa  130  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.590122  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1488  TAP domain-containing protein  26.42 
 
 
522 aa  127  5e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026814 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02580  alpha/beta hydrolase family protein  28.88 
 
 
623 aa  127  6e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.978734  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3412  TAP domain protein  34.65 
 
 
766 aa  125  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6092  TAP domain-containing protein  26.46 
 
 
478 aa  121  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6096  TAP domain protein  28.81 
 
 
557 aa  117  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2331  putative protease  36.44 
 
 
300 aa  116  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2839  TAP domain protein  27.37 
 
 
517 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350131  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3994  TAP domain protein  29.2 
 
 
557 aa  114  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11121  conserved hypothetical protein  25.42 
 
 
555 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0230414 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2254  TAP domain-containing protein  25.96 
 
 
486 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.267716 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6090  TAP domain-containing protein  26.64 
 
 
508 aa  110  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.305153 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08498  proteinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01350)  24.34 
 
 
678 aa  107  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.726549  normal  0.616517 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2416  TAP domain-containing protein  25.15 
 
 
505 aa  107  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000258971  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4882  TAP domain-containing protein  24.55 
 
 
493 aa  100  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2276  putative protease  33.17 
 
 
524 aa  98.2  3e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.494839 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1652  hypothetical protein  22.69 
 
 
494 aa  96.7  9e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.916188  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3059  hypothetical protein  28.12 
 
 
459 aa  94  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0722  alpha/beta fold family hydrolase  26.06 
 
 
480 aa  93.6  9e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>