162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0220 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0220  TAP domain protein  100 
 
 
551 aa  1088    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712779 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5024  TAP domain protein  39.3 
 
 
571 aa  298  2e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412323  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2687  TAP domain protein  38.07 
 
 
643 aa  294  4e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589968  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2970  TAP domain protein  39.25 
 
 
542 aa  292  1e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32712  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2523  TAP domain protein  37.82 
 
 
564 aa  291  2e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4537  TAP domain protein  37.68 
 
 
506 aa  244  3e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2442  TAP domain protein  34.41 
 
 
597 aa  234  4.0000000000000004e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000431609  normal  0.057711 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0644  hypothetical protein  28.1 
 
 
597 aa  233  7.000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2656  TAP domain protein  36.84 
 
 
535 aa  232  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0201051  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2780  tripeptidyl-peptidase B  35.44 
 
 
500 aa  220  6e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834234  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0715  TAP domain-containing protein  34.12 
 
 
524 aa  219  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0185  TAP domain protein  34.84 
 
 
551 aa  218  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.696189  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0663  TAP domain protein  35.91 
 
 
525 aa  218  2e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419459  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32570  alpha/beta hydrolase family protein  33.39 
 
 
541 aa  216  9.999999999999999e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4956  TAP domain protein  35.94 
 
 
507 aa  216  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.30314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1065  TAP domain protein  34 
 
 
544 aa  214  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2192  TAP domain protein  32.83 
 
 
518 aa  212  1e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0491  TAP domain protein  35.63 
 
 
515 aa  207  5e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0577  TAP domain protein  35.05 
 
 
508 aa  207  6e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1183  TAP domain-containing protein  34.56 
 
 
495 aa  206  8e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3464  TAP domain-containing protein  34 
 
 
527 aa  206  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.660985  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0841  TAP domain protein  32.87 
 
 
521 aa  204  3e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127306 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1946  TAP domain protein  34.91 
 
 
518 aa  204  5e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0350254  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9211  hypothetical protein  35.12 
 
 
485 aa  204  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6091  TAP domain-containing protein  28.62 
 
 
504 aa  202  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3267  TAP domain protein  35.45 
 
 
538 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000317549  decreased coverage  0.0000157542 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1545  TAP domain-containing protein  34.39 
 
 
542 aa  196  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07410  alpha/beta hydrolase family protein  35.33 
 
 
525 aa  194  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0388  TAP domain-containing protein  31.41 
 
 
521 aa  194  4e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0464  TAP domain-containing protein  31.59 
 
 
499 aa  192  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000978752 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0356  TAP domain protein  34.62 
 
 
523 aa  192  1e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7044  hypothetical protein  32.32 
 
 
522 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393484  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1488  TAP domain-containing protein  34.68 
 
 
522 aa  190  5e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026814 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6275  TAP domain-containing protein  32.48 
 
 
476 aa  190  5e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24850  alpha/beta hydrolase family protein  33.4 
 
 
515 aa  190  5e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0907  TAP domain protein  36.58 
 
 
521 aa  190  5.999999999999999e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0066  tripeptidyl-peptidase B  33.96 
 
 
540 aa  186  7e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.974168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8392  TAP domain protein  33.4 
 
 
537 aa  186  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258609  normal  0.179275 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3391  tripeptidyl-peptidase B  34.47 
 
 
508 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3340  tripeptidyl-peptidase B  34.47 
 
 
508 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478437  normal  0.109915 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3329  tripeptidyl-peptidase B  34.47 
 
 
533 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224727  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2729  TAP domain protein  31.53 
 
 
515 aa  185  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196617  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2767  TAP domain-containing protein  31.18 
 
 
546 aa  184  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4357  TAP domain-containing protein  31.68 
 
 
504 aa  184  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619924  normal  0.129935 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5935  TAP domain protein  32.83 
 
 
518 aa  180  5.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235476  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6093  TAP domain-containing protein  28.06 
 
 
505 aa  177  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12253  exported protease  32.62 
 
 
520 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.499354  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12252  exported protease  33.53 
 
 
520 aa  173  9e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.212366  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0881  TAP domain protein  37.31 
 
 
545 aa  171  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.478786  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3330  tripeptidyl-peptidase B  32.68 
 
 
511 aa  169  9e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3392  tripeptidyl-peptidase B  32.68 
 
 
511 aa  169  9e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3341  tripeptidyl-peptidase B  32.68 
 
 
511 aa  169  9e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175683  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6090  TAP domain-containing protein  30.31 
 
 
508 aa  169  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2904  TAP domain-containing protein  33.76 
 
 
495 aa  168  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411145  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2906  alpha/beta hydrolase fold  31.56 
 
 
505 aa  169  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.834545 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4710  TAP domain protein  32.7 
 
 
504 aa  169  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2254  TAP domain-containing protein  30.16 
 
 
486 aa  167  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.267716 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3599  TAP domain-containing protein  32.01 
 
 
505 aa  166  9e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4728  TAP domain-containing protein  30.8 
 
 
506 aa  165  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2980  TAP domain protein  32.94 
 
 
557 aa  162  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.085257  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7303  hypothetical protein  30.75 
 
 
532 aa  157  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25020  alpha/beta hydrolase family protein  31.83 
 
 
542 aa  157  6e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3600  TAP domain-containing protein  32.98 
 
 
516 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.601455 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2331  putative protease  39.08 
 
 
300 aa  155  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3316  TAP domain protein  32.57 
 
 
484 aa  154  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0266981  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2416  TAP domain-containing protein  26.82 
 
 
505 aa  152  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000258971  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6092  TAP domain-containing protein  25.74 
 
 
478 aa  151  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1042  TAP domain-containing protein  31.02 
 
 
535 aa  151  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0225624 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11121  conserved hypothetical protein  29.75 
 
 
555 aa  150  4e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0230414 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3345  TAP domain-containing protein  30.08 
 
 
532 aa  150  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0319674  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4414  hypothetical protein  31.1 
 
 
505 aa  147  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.694835  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2212  TAP domain-containing protein  33.65 
 
 
520 aa  141  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.544179  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4973  TAP domain protein  31.9 
 
 
522 aa  140  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39691  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0481  TAP domain protein  31.11 
 
 
539 aa  140  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.223264  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1966  hypothetical protein  29.96 
 
 
530 aa  140  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52219  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3616  TAP domain protein  31.54 
 
 
546 aa  140  7e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.812667  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1652  hypothetical protein  26.27 
 
 
494 aa  139  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.916188  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  29.41 
 
 
750 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3160  TAP domain protein  31.14 
 
 
527 aa  133  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4219  alpha/beta hydrolase fold protein  30.21 
 
 
486 aa  131  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3369  TAP domain protein  26.95 
 
 
547 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0557447  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0750  putative secreted peptidase  31.21 
 
 
521 aa  128  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4117  TAP domain-containing protein  29.49 
 
 
556 aa  127  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08498  proteinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01350)  27.85 
 
 
678 aa  127  5e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.726549  normal  0.616517 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1723  TAP domain protein  31.53 
 
 
536 aa  126  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00370292  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0472  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 
525 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05429  conserved hypothetical protein  27.2 
 
 
600 aa  119  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00467317  normal  0.0133715 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4882  TAP domain-containing protein  30.45 
 
 
493 aa  119  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2276  putative protease  29.3 
 
 
524 aa  117  5e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.494839 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3257  TAP domain-containing protein  26.5 
 
 
499 aa  113  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.590122  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3059  hypothetical protein  35.71 
 
 
459 aa  113  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1310  TAP domain protein  28.22 
 
 
566 aa  110  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.330733  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2785  TAP domain protein  33.47 
 
 
480 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000127217  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0438  TAP domain protein  34.45 
 
 
542 aa  108  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.574551  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3650  TAP domain-containing protein  30.12 
 
 
475 aa  108  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0804319  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2750  TAP domain-containing protein  28.17 
 
 
490 aa  106  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.51195  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0722  alpha/beta fold family hydrolase  26 
 
 
480 aa  105  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2839  TAP domain protein  33.7 
 
 
517 aa  104  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350131  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7397  TAP domain-containing protein  30.87 
 
 
613 aa  104  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312183  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6097  TAP domain protein  30.93 
 
 
559 aa  100  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>