147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0472 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0472  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
525 aa  1077    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4219  alpha/beta hydrolase fold protein  35.65 
 
 
486 aa  269  8.999999999999999e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4728  TAP domain-containing protein  30.46 
 
 
506 aa  170  7e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3345  TAP domain-containing protein  29.78 
 
 
532 aa  169  8e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0319674  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4973  TAP domain protein  36.43 
 
 
522 aa  165  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39691  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4414  hypothetical protein  29.91 
 
 
505 aa  163  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.694835  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3316  TAP domain protein  33.19 
 
 
484 aa  157  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0266981  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0481  TAP domain protein  36.47 
 
 
539 aa  157  6e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.223264  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3160  TAP domain protein  32.72 
 
 
527 aa  156  7e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4117  TAP domain-containing protein  28.57 
 
 
556 aa  155  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1042  TAP domain-containing protein  36.91 
 
 
535 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0225624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1966  hypothetical protein  36.08 
 
 
530 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52219  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7303  hypothetical protein  30.9 
 
 
532 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4710  TAP domain protein  37.31 
 
 
504 aa  145  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2212  TAP domain-containing protein  31.95 
 
 
520 aa  138  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.544179  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0438  TAP domain protein  33.75 
 
 
542 aa  137  5e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.574551  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1723  TAP domain protein  37.33 
 
 
536 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00370292  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0750  putative secreted peptidase  35.99 
 
 
521 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3369  TAP domain protein  31.52 
 
 
547 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0557447  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0881  TAP domain protein  32.71 
 
 
545 aa  134  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.478786  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0388  TAP domain-containing protein  32.65 
 
 
521 aa  131  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2767  TAP domain-containing protein  32.84 
 
 
546 aa  131  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0663  TAP domain protein  33.99 
 
 
525 aa  130  6e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419459  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4537  TAP domain protein  34.7 
 
 
506 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2687  TAP domain protein  35.89 
 
 
643 aa  128  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589968  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2523  TAP domain protein  32.03 
 
 
564 aa  128  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1183  TAP domain-containing protein  26.78 
 
 
495 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6091  TAP domain-containing protein  26.06 
 
 
504 aa  127  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0715  TAP domain-containing protein  26.33 
 
 
524 aa  127  7e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1545  TAP domain-containing protein  28.12 
 
 
542 aa  126  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0464  TAP domain-containing protein  23.97 
 
 
499 aa  125  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000978752 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0220  TAP domain protein  37.5 
 
 
551 aa  125  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712779 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07410  alpha/beta hydrolase family protein  29.26 
 
 
525 aa  125  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0907  TAP domain protein  33.58 
 
 
521 aa  124  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2780  tripeptidyl-peptidase B  34.18 
 
 
500 aa  124  5e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834234  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7397  TAP domain-containing protein  33.43 
 
 
613 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312183  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2192  TAP domain protein  36.65 
 
 
518 aa  121  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1946  TAP domain protein  32.96 
 
 
518 aa  121  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0350254  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6275  TAP domain-containing protein  32.57 
 
 
476 aa  120  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1065  TAP domain protein  31.39 
 
 
544 aa  119  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1488  TAP domain-containing protein  28.15 
 
 
522 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026814 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2970  TAP domain protein  37.89 
 
 
542 aa  119  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32712  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4956  TAP domain protein  35.18 
 
 
507 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.30314 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3267  TAP domain protein  33.72 
 
 
538 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000317549  decreased coverage  0.0000157542 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2906  alpha/beta hydrolase fold  33.7 
 
 
505 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.834545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7044  hypothetical protein  37.56 
 
 
522 aa  116  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393484  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24850  alpha/beta hydrolase family protein  30.46 
 
 
515 aa  114  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3616  TAP domain protein  28.84 
 
 
546 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.812667  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2656  TAP domain protein  32.91 
 
 
535 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0201051  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0644  hypothetical protein  33.5 
 
 
597 aa  114  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3412  TAP domain protein  30.8 
 
 
766 aa  113  7.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4882  TAP domain-containing protein  31.74 
 
 
493 aa  113  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0841  TAP domain protein  34.92 
 
 
521 aa  111  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127306 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3464  TAP domain-containing protein  33.82 
 
 
527 aa  110  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.660985  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3599  TAP domain-containing protein  34.14 
 
 
505 aa  110  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2729  TAP domain protein  27.99 
 
 
515 aa  110  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196617  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0185  TAP domain protein  32.61 
 
 
551 aa  110  9.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.696189  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32570  alpha/beta hydrolase family protein  29.01 
 
 
541 aa  110  9.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6093  TAP domain-containing protein  25.22 
 
 
505 aa  109  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3330  tripeptidyl-peptidase B  34.31 
 
 
511 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0380101  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4357  TAP domain-containing protein  26.79 
 
 
504 aa  109  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619924  normal  0.129935 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3392  tripeptidyl-peptidase B  34.31 
 
 
511 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3341  tripeptidyl-peptidase B  34.31 
 
 
511 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175683  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12252  exported protease  35.9 
 
 
520 aa  109  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.212366  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2980  TAP domain protein  33.2 
 
 
557 aa  108  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.085257  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25020  alpha/beta hydrolase family protein  29.85 
 
 
542 aa  107  4e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3329  tripeptidyl-peptidase B  34.2 
 
 
533 aa  107  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224727  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0066  tripeptidyl-peptidase B  34.03 
 
 
540 aa  107  6e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.974168 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3391  tripeptidyl-peptidase B  34.2 
 
 
508 aa  107  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3340  tripeptidyl-peptidase B  34.2 
 
 
508 aa  107  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478437  normal  0.109915 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2785  TAP domain protein  36.95 
 
 
480 aa  107  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000127217  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02580  alpha/beta hydrolase family protein  36.55 
 
 
623 aa  107  8e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.978734  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0491  TAP domain protein  26.91 
 
 
515 aa  105  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5024  TAP domain protein  28.78 
 
 
571 aa  105  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412323  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0356  TAP domain protein  33.81 
 
 
523 aa  105  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  29.43 
 
 
750 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2254  TAP domain-containing protein  24.04 
 
 
486 aa  104  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.267716 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2442  TAP domain protein  34.06 
 
 
597 aa  103  8e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000431609  normal  0.057711 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6097  TAP domain protein  33.73 
 
 
559 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12253  exported protease  32.65 
 
 
520 aa  101  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.499354  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0577  TAP domain protein  32.16 
 
 
508 aa  99.8  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3600  TAP domain-containing protein  30.25 
 
 
516 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.601455 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2416  TAP domain-containing protein  30.77 
 
 
505 aa  98.6  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000258971  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2904  TAP domain-containing protein  29.83 
 
 
495 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411145  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3257  TAP domain-containing protein  28.34 
 
 
499 aa  97.8  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.590122  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2839  TAP domain protein  29.37 
 
 
517 aa  97.4  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350131  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1310  TAP domain protein  27.21 
 
 
566 aa  96.7  8e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.330733  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9211  hypothetical protein  35.29 
 
 
485 aa  96.3  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5935  TAP domain protein  31.2 
 
 
518 aa  95.9  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235476  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11121  conserved hypothetical protein  31.05 
 
 
555 aa  91.7  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0230414 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1652  hypothetical protein  29.2 
 
 
494 aa  91.3  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.916188  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6092  TAP domain-containing protein  23.46 
 
 
478 aa  90.9  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6090  TAP domain-containing protein  23.82 
 
 
508 aa  90.5  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8392  TAP domain protein  29.52 
 
 
537 aa  90.1  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258609  normal  0.179275 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3059  hypothetical protein  26.58 
 
 
459 aa  87.4  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3650  TAP domain-containing protein  26.32 
 
 
475 aa  87.4  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0804319  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05429  conserved hypothetical protein  32.72 
 
 
600 aa  83.6  0.000000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00467317  normal  0.0133715 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1133  putative hydrolase  28.29 
 
 
200 aa  81.6  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.146654  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0123  TAP domain protein  32.47 
 
 
656 aa  80.1  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0722  alpha/beta fold family hydrolase  28.12 
 
 
480 aa  80.1  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>