183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6091 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_6091  TAP domain-containing protein  100 
 
 
504 aa  1041    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6093  TAP domain-containing protein  65.94 
 
 
505 aa  633  1e-180  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6090  TAP domain-containing protein  60.98 
 
 
508 aa  608  1e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6092  TAP domain-containing protein  61.77 
 
 
478 aa  595  1e-169  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4357  TAP domain-containing protein  52.92 
 
 
504 aa  484  1e-135  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619924  normal  0.129935 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0464  TAP domain-containing protein  51.89 
 
 
499 aa  476  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000978752 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2729  TAP domain protein  37.35 
 
 
515 aa  309  6.999999999999999e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196617  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5935  TAP domain protein  36.22 
 
 
518 aa  297  3e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235476  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2254  TAP domain-containing protein  35.38 
 
 
486 aa  278  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.267716 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6275  TAP domain-containing protein  33.19 
 
 
476 aa  268  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  31.98 
 
 
750 aa  230  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0663  TAP domain protein  33.05 
 
 
525 aa  229  7e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419459  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0715  TAP domain-containing protein  31.32 
 
 
524 aa  227  3e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2523  TAP domain protein  30.08 
 
 
564 aa  223  8e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0841  TAP domain protein  32.43 
 
 
521 aa  222  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127306 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0907  TAP domain protein  32.97 
 
 
521 aa  213  9e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25020  alpha/beta hydrolase family protein  32.91 
 
 
542 aa  211  2e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1183  TAP domain-containing protein  28.86 
 
 
495 aa  208  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11121  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 
555 aa  206  9e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0230414 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4956  TAP domain protein  30.29 
 
 
507 aa  201  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.30314 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2780  tripeptidyl-peptidase B  31.31 
 
 
500 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834234  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3329  tripeptidyl-peptidase B  30.4 
 
 
533 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224727  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3391  tripeptidyl-peptidase B  30.4 
 
 
508 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3340  tripeptidyl-peptidase B  30.4 
 
 
508 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478437  normal  0.109915 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3464  TAP domain-containing protein  31.34 
 
 
527 aa  197  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.660985  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3330  tripeptidyl-peptidase B  28.71 
 
 
511 aa  196  6e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3392  tripeptidyl-peptidase B  28.71 
 
 
511 aa  196  6e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3341  tripeptidyl-peptidase B  28.71 
 
 
511 aa  196  6e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175683  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2767  TAP domain-containing protein  28.74 
 
 
546 aa  196  7e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0388  TAP domain-containing protein  30.69 
 
 
521 aa  196  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0491  TAP domain protein  28.43 
 
 
515 aa  195  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32570  alpha/beta hydrolase family protein  31.13 
 
 
541 aa  193  5e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1545  TAP domain-containing protein  29.16 
 
 
542 aa  192  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1488  TAP domain-containing protein  30.5 
 
 
522 aa  189  9e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026814 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0356  TAP domain protein  29.45 
 
 
523 aa  189  1e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07410  alpha/beta hydrolase family protein  29.72 
 
 
525 aa  187  5e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12252  exported protease  30.68 
 
 
520 aa  186  9e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.212366  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4537  TAP domain protein  28.51 
 
 
506 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3267  TAP domain protein  30.84 
 
 
538 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000317549  decreased coverage  0.0000157542 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0577  TAP domain protein  28.52 
 
 
508 aa  184  3e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2906  alpha/beta hydrolase fold  29.31 
 
 
505 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.834545 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0220  TAP domain protein  27.06 
 
 
551 aa  184  4.0000000000000006e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712779 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24850  alpha/beta hydrolase family protein  29.75 
 
 
515 aa  183  5.0000000000000004e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1946  TAP domain protein  27.54 
 
 
518 aa  183  7e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0350254  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2904  TAP domain-containing protein  28.99 
 
 
495 aa  181  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411145  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4882  TAP domain-containing protein  28.38 
 
 
493 aa  181  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2656  TAP domain protein  29.49 
 
 
535 aa  181  4e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0201051  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8392  TAP domain protein  30.41 
 
 
537 aa  180  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258609  normal  0.179275 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3257  TAP domain-containing protein  28.79 
 
 
499 aa  179  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.590122  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2687  TAP domain protein  27.43 
 
 
643 aa  178  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589968  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3650  TAP domain-containing protein  29.13 
 
 
475 aa  178  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0804319  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0066  tripeptidyl-peptidase B  30.09 
 
 
540 aa  177  5e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.974168 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3600  TAP domain-containing protein  28.75 
 
 
516 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.601455 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2192  TAP domain protein  28.3 
 
 
518 aa  174  3.9999999999999995e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0881  TAP domain protein  27.33 
 
 
545 aa  173  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.478786  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4414  hypothetical protein  27.08 
 
 
505 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.694835  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12253  exported protease  27.74 
 
 
520 aa  169  9e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.499354  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3599  TAP domain-containing protein  26.89 
 
 
505 aa  162  9e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1966  hypothetical protein  27.31 
 
 
530 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52219  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1065  TAP domain protein  26.89 
 
 
544 aa  162  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3059  hypothetical protein  28.43 
 
 
459 aa  159  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0185  TAP domain protein  27.27 
 
 
551 aa  159  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.696189  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7303  hypothetical protein  27 
 
 
532 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0481  TAP domain protein  27.62 
 
 
539 aa  158  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.223264  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4728  TAP domain-containing protein  25.79 
 
 
506 aa  157  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4710  TAP domain protein  28.82 
 
 
504 aa  157  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2970  TAP domain protein  32.26 
 
 
542 aa  157  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32712  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7044  hypothetical protein  31.5 
 
 
522 aa  155  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393484  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1042  TAP domain-containing protein  27.25 
 
 
535 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0225624 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3345  TAP domain-containing protein  28.79 
 
 
532 aa  151  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0319674  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2750  TAP domain-containing protein  27.87 
 
 
490 aa  150  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.51195  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1652  hypothetical protein  27.25 
 
 
494 aa  146  8.000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.916188  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2980  TAP domain protein  34.5 
 
 
557 aa  146  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.085257  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9211  hypothetical protein  33.93 
 
 
485 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3369  TAP domain protein  28.63 
 
 
547 aa  143  8e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0557447  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2416  TAP domain-containing protein  26.74 
 
 
505 aa  142  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000258971  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4973  TAP domain protein  32.73 
 
 
522 aa  142  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39691  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2331  putative protease  33.64 
 
 
300 aa  139  8.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5024  TAP domain protein  26.32 
 
 
571 aa  136  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412323  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2442  TAP domain protein  33.93 
 
 
597 aa  135  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000431609  normal  0.057711 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3316  TAP domain protein  27.49 
 
 
484 aa  135  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0266981  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4219  alpha/beta hydrolase fold protein  26.34 
 
 
486 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3616  TAP domain protein  26.76 
 
 
546 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.812667  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2212  TAP domain-containing protein  24.23 
 
 
520 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.544179  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3160  TAP domain protein  26.38 
 
 
527 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7397  TAP domain-containing protein  39.02 
 
 
613 aa  126  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312183  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0472  alpha/beta hydrolase fold protein  25.87 
 
 
525 aa  123  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4117  TAP domain-containing protein  24.7 
 
 
556 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6097  TAP domain protein  25.98 
 
 
559 aa  117  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0750  putative secreted peptidase  28.3 
 
 
521 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0644  hypothetical protein  28.46 
 
 
597 aa  114  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1310  TAP domain protein  24.54 
 
 
566 aa  110  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.330733  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1723  TAP domain protein  27.01 
 
 
536 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00370292  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2785  TAP domain protein  32.42 
 
 
480 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000127217  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0438  TAP domain protein  31.84 
 
 
542 aa  105  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.574551  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2839  TAP domain protein  28.15 
 
 
517 aa  104  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350131  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4190  TAP domain-containing protein  27.15 
 
 
519 aa  101  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05429  conserved hypothetical protein  30 
 
 
600 aa  97.8  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00467317  normal  0.0133715 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3412  TAP domain protein  29.64 
 
 
766 aa  97.1  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02580  alpha/beta hydrolase family protein  23.87 
 
 
623 aa  97.1  7e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.978734  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>