162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0481 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0481  TAP domain protein  100 
 
 		 539 aa  1083    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.223264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2785  TAP domain protein  41.56 
 
 		 480 aa  278  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000127217  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3316  TAP domain protein  36.12 
 
 		 484 aa  240  4e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0266981  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3345  TAP domain-containing protein  34 
 
 		 532 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0319674  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1042  TAP domain-containing protein  37.64 
 
 		 535 aa  234  3e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0225624 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2212  TAP domain-containing protein  33.46 
 
 		 520 aa  229  8e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.544179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3369  TAP domain protein  35.19 
 
 		 547 aa  224  4e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0557447  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4117  TAP domain-containing protein  36.31 
 
 		 556 aa  222  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4710  TAP domain protein  35.28 
 
 		 504 aa  222  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7303  hypothetical protein  34.87 
 
 		 532 aa  219  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4728  TAP domain-containing protein  33.67 
 
 		 506 aa  218  2.9999999999999998e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1966  hypothetical protein  32.81 
 
 		 530 aa  216  8e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4973  TAP domain protein  34.57 
 
 		 522 aa  216  9e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39691  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1723  TAP domain protein  36.31 
 
 		 536 aa  209  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00370292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3160  TAP domain protein  33.68 
 
 		 527 aa  194  3e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07410  alpha/beta hydrolase family protein  29.1 
 
 		 525 aa  194  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0750  putative secreted peptidase  34.75 
 
 		 521 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0663  TAP domain protein  34.48 
 
 		 525 aa  190  5.999999999999999e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419459  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3616  TAP domain protein  33.52 
 
 		 546 aa  190  7e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.812667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6097  TAP domain protein  32.86 
 
 		 559 aa  186  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4414  hypothetical protein  32.71 
 
 		 505 aa  183  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.694835  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2780  tripeptidyl-peptidase B  30.86 
 
 		 500 aa  183  7e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834234  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4956  TAP domain protein  32.92 
 
 		 507 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.30314 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4537  TAP domain protein  32.29 
 
 		 506 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2839  TAP domain protein  32.71 
 
 		 517 aa  180  7e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350131  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1310  TAP domain protein  32.51 
 
 		 566 aa  179  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.330733  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0388  TAP domain-containing protein  31.48 
 
 		 521 aa  179  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6096  TAP domain protein  32.58 
 
 		 557 aa  178  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1183  TAP domain-containing protein  30.6 
 
 		 495 aa  177  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2767  TAP domain-containing protein  30.82 
 
 		 546 aa  177  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0464  TAP domain-containing protein  30.26 
 
 		 499 aa  177  6e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000978752 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0907  TAP domain protein  30.83 
 
 		 521 aa  172  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24850  alpha/beta hydrolase family protein  31.19 
 
 		 515 aa  172  2e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0577  TAP domain protein  31.88 
 
 		 508 aa  164  3e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25020  alpha/beta hydrolase family protein  31.08 
 
 		 542 aa  164  3e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7044  hypothetical protein  28.57 
 
 		 522 aa  164  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2192  TAP domain protein  28.66 
 
 		 518 aa  162  1e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0438  TAP domain protein  28.29 
 
 		 542 aa  162  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.574551  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6091  TAP domain-containing protein  26.86 
 
 		 504 aa  161  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0491  TAP domain protein  33.13 
 
 		 515 aa  160  5e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0715  TAP domain-containing protein  29.32 
 
 		 524 aa  160  8e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2523  TAP domain protein  31.01 
 
 		 564 aa  157  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8392  TAP domain protein  29.51 
 
 		 537 aa  157  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258609  normal  0.179275 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0472  alpha/beta hydrolase fold protein  36.47 
 
 		 525 aa  157  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7397  TAP domain-containing protein  35.59 
 
 		 613 aa  156  9e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0881  TAP domain protein  27.59 
 
 		 545 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.478786  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3330  tripeptidyl-peptidase B  29.86 
 
 		 511 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3392  tripeptidyl-peptidase B  29.86 
 
 		 511 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3341  tripeptidyl-peptidase B  29.86 
 
 		 511 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175683  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3994  TAP domain protein  32.26 
 
 		 557 aa  152  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32570  alpha/beta hydrolase family protein  29.66 
 
 		 541 aa  150  5e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1065  TAP domain protein  27.45 
 
 		 544 aa  150  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1946  TAP domain protein  30.71 
 
 		 518 aa  149  9e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0350254  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2656  TAP domain protein  30.45 
 
 		 535 aa  149  9e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0201051  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0185  TAP domain protein  28.8 
 
 		 551 aa  149  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.696189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3267  TAP domain protein  27.22 
 
 		 538 aa  147  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000317549  decreased coverage  0.0000157542 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2904  TAP domain-containing protein  28.51 
 
 		 495 aa  147  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411145  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0841  TAP domain protein  27.31 
 
 		 521 aa  147  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127306 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3257  TAP domain-containing protein  30.02 
 
 		 499 aa  147  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.590122  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6275  TAP domain-containing protein  28.12 
 
 		 476 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4357  TAP domain-containing protein  27.23 
 
 		 504 aa  145  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619924  normal  0.129935 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2906  alpha/beta hydrolase fold  29.42 
 
 		 505 aa  145  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.834545 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6092  TAP domain-containing protein  28.18 
 
 		 478 aa  145  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2254  TAP domain-containing protein  28.36 
 
 		 486 aa  142  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.267716 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6093  TAP domain-containing protein  26.53 
 
 		 505 aa  141  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0356  TAP domain protein  28.18 
 
 		 523 aa  139  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2687  TAP domain protein  39.25 
 
 		 643 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12253  exported protease  26.48 
 
 		 520 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.499354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0220  TAP domain protein  39.15 
 
 		 551 aa  138  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712779 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1652  hypothetical protein  25 
 
 		 494 aa  137  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.916188  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2980  TAP domain protein  29.15 
 
 		 557 aa  137  6.0000000000000005e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.085257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9211  hypothetical protein  30.29 
 
 		 485 aa  136  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3464  TAP domain-containing protein  28 
 
 		 527 aa  134  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.660985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0066  tripeptidyl-peptidase B  28.54 
 
 		 540 aa  134  5e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.974168 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1488  TAP domain-containing protein  30.47 
 
 		 522 aa  133  6e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00026814 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3600  TAP domain-containing protein  27.08 
 
 		 516 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601455 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0644  hypothetical protein  26.41 
 
 		 597 aa  132  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1545  TAP domain-containing protein  30.19 
 
 		 542 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3329  tripeptidyl-peptidase B  28.25 
 
 		 533 aa  131  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224727  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3391  tripeptidyl-peptidase B  28.25 
 
 		 508 aa  131  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3340  tripeptidyl-peptidase B  28.25 
 
 		 508 aa  131  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478437  normal  0.109915 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2729  TAP domain protein  33.75 
 
 		 515 aa  131  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196617  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3599  TAP domain-containing protein  27.37 
 
 		 505 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2442  TAP domain protein  42.66 
 
 		 597 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000431609  normal  0.057711 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5935  TAP domain protein  29.01 
 
 		 518 aa  129  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235476  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11121  conserved hypothetical protein  26.97 
 
 		 555 aa  127  4.0000000000000003e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0230414 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2416  TAP domain-containing protein  25.14 
 
 		 505 aa  125  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000258971  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4219  alpha/beta hydrolase fold protein  35.46 
 
 		 486 aa  125  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12252  exported protease  26.97 
 
 		 520 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.212366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4882  TAP domain-containing protein  26.36 
 
 		 493 aa  121  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2331  putative protease  34.91 
 
 		 300 aa  121  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2970  TAP domain protein  28.69 
 
 		 542 aa  120  9e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32712  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5024  TAP domain protein  30.2 
 
 		 571 aa  117  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412323  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6090  TAP domain-containing protein  25 
 
 		 508 aa  116  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2276  putative protease  27.27 
 
 		 524 aa  113  9e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.494839 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02580  alpha/beta hydrolase family protein  34.59 
 
 		 623 aa  108  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.978734  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  28.92 
 
 		 750 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3412  TAP domain protein  31.02 
 
 		 766 aa  102  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3059  hypothetical protein  29.64 
 
 		 459 aa  98.6  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.253596 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05429  conserved hypothetical protein  32.05 
 
 		 600 aa  95.5  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00467317  normal  0.0133715 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>