188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2904 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3330  tripeptidyl-peptidase B  73.78 
 
 
511 aa  766    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3392  tripeptidyl-peptidase B  73.78 
 
 
511 aa  766    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3600  TAP domain-containing protein  82.79 
 
 
516 aa  850    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.601455 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3341  tripeptidyl-peptidase B  73.78 
 
 
511 aa  766    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175683  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2904  TAP domain-containing protein  100 
 
 
495 aa  1003    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411145  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12253  exported protease  64.44 
 
 
520 aa  678    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.499354  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3329  tripeptidyl-peptidase B  55.04 
 
 
533 aa  512  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224727  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3391  tripeptidyl-peptidase B  55.04 
 
 
508 aa  511  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3340  tripeptidyl-peptidase B  55.04 
 
 
508 aa  511  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478437  normal  0.109915 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12252  exported protease  52.29 
 
 
520 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.212366  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2906  alpha/beta hydrolase fold  50.11 
 
 
505 aa  462  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.834545 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0907  TAP domain protein  52.3 
 
 
521 aa  460  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3599  TAP domain-containing protein  50.96 
 
 
505 aa  458  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07410  alpha/beta hydrolase family protein  48.02 
 
 
525 aa  421  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3267  TAP domain protein  46.47 
 
 
538 aa  388  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000317549  decreased coverage  0.0000157542 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2780  tripeptidyl-peptidase B  39.92 
 
 
500 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834234  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9211  hypothetical protein  41.89 
 
 
485 aa  302  7.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0841  TAP domain protein  38.74 
 
 
521 aa  303  7.000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127306 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4537  TAP domain protein  39.75 
 
 
506 aa  302  9e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32570  alpha/beta hydrolase family protein  39.71 
 
 
541 aa  299  8e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0715  TAP domain-containing protein  39.58 
 
 
524 aa  298  1e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4956  TAP domain protein  39.38 
 
 
507 aa  298  2e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.30314 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0356  TAP domain protein  39.49 
 
 
523 aa  296  7e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0881  TAP domain protein  37.58 
 
 
545 aa  292  8e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.478786  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0066  tripeptidyl-peptidase B  42.51 
 
 
540 aa  289  1e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.974168 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2192  TAP domain protein  36.84 
 
 
518 aa  287  2e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3464  TAP domain-containing protein  38.99 
 
 
527 aa  286  5.999999999999999e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.660985  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0491  TAP domain protein  41.72 
 
 
515 aa  286  8e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25020  alpha/beta hydrolase family protein  38.53 
 
 
542 aa  281  2e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0388  TAP domain-containing protein  38.8 
 
 
521 aa  272  1e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0577  TAP domain protein  37.7 
 
 
508 aa  272  1e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1488  TAP domain-containing protein  39.61 
 
 
522 aa  272  1e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026814 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8392  TAP domain protein  37.96 
 
 
537 aa  271  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258609  normal  0.179275 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1946  TAP domain protein  39.11 
 
 
518 aa  270  5.9999999999999995e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0350254  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24850  alpha/beta hydrolase family protein  38.03 
 
 
515 aa  269  7e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7044  hypothetical protein  36.38 
 
 
522 aa  269  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393484  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1545  TAP domain-containing protein  37.26 
 
 
542 aa  266  8.999999999999999e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1183  TAP domain-containing protein  38.04 
 
 
495 aa  261  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2416  TAP domain-containing protein  32.38 
 
 
505 aa  240  5e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000258971  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0663  TAP domain protein  36.12 
 
 
525 aa  234  4.0000000000000004e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419459  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2767  TAP domain-containing protein  32.29 
 
 
546 aa  232  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1042  TAP domain-containing protein  34.74 
 
 
535 aa  229  7e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0225624 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0185  TAP domain protein  34.54 
 
 
551 aa  225  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.696189  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6275  TAP domain-containing protein  34.23 
 
 
476 aa  213  9e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1966  hypothetical protein  31.03 
 
 
530 aa  207  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52219  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2656  TAP domain protein  34.3 
 
 
535 aa  207  5e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0201051  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1652  hypothetical protein  30.47 
 
 
494 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.916188  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0464  TAP domain-containing protein  32.57 
 
 
499 aa  201  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000978752 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3616  TAP domain protein  33.2 
 
 
546 aa  199  7e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.812667  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3369  TAP domain protein  32.27 
 
 
547 aa  194  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0557447  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2523  TAP domain protein  31.03 
 
 
564 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6093  TAP domain-containing protein  32.43 
 
 
505 aa  190  4e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2980  TAP domain protein  32.86 
 
 
557 aa  190  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.085257  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6091  TAP domain-containing protein  28.99 
 
 
504 aa  181  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2729  TAP domain protein  32.39 
 
 
515 aa  176  7e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196617  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4357  TAP domain-containing protein  31.25 
 
 
504 aa  176  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619924  normal  0.129935 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1065  TAP domain protein  31.63 
 
 
544 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0750  putative secreted peptidase  31.98 
 
 
521 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2254  TAP domain-containing protein  31.39 
 
 
486 aa  173  7.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.267716 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2970  TAP domain protein  30.54 
 
 
542 aa  166  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32712  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4414  hypothetical protein  30.26 
 
 
505 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.694835  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3345  TAP domain-containing protein  29.94 
 
 
532 aa  163  6e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0319674  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4710  TAP domain protein  29.61 
 
 
504 aa  158  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3160  TAP domain protein  30.58 
 
 
527 aa  158  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2687  TAP domain protein  30.83 
 
 
643 aa  158  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589968  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6092  TAP domain-containing protein  28.16 
 
 
478 aa  156  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3316  TAP domain protein  30.63 
 
 
484 aa  156  8e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0266981  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5935  TAP domain protein  32.55 
 
 
518 aa  155  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235476  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4882  TAP domain-containing protein  29.65 
 
 
493 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7303  hypothetical protein  30.33 
 
 
532 aa  155  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  30.02 
 
 
750 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6090  TAP domain-containing protein  28.43 
 
 
508 aa  152  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3257  TAP domain-containing protein  28.48 
 
 
499 aa  152  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.590122  normal  0.324088 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11121  conserved hypothetical protein  29.98 
 
 
555 aa  151  3e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0230414 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1723  TAP domain protein  30.16 
 
 
536 aa  150  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00370292  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0220  TAP domain protein  38.38 
 
 
551 aa  148  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712779 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4728  TAP domain-containing protein  28.37 
 
 
506 aa  147  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0481  TAP domain protein  28.75 
 
 
539 aa  147  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.223264  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4117  TAP domain-containing protein  30.16 
 
 
556 aa  147  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2442  TAP domain protein  43.18 
 
 
597 aa  146  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000431609  normal  0.057711 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24000  alpha/beta hydrolase family protein  28.95 
 
 
514 aa  145  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0638812 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2331  putative protease  38.02 
 
 
300 aa  144  4e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5024  TAP domain protein  30 
 
 
571 aa  144  5e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412323  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2212  TAP domain-containing protein  28.6 
 
 
520 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.544179  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2839  TAP domain protein  28.46 
 
 
517 aa  141  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350131  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6097  TAP domain protein  30.49 
 
 
559 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3650  TAP domain-containing protein  27.74 
 
 
475 aa  131  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0804319  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4973  TAP domain protein  33.9 
 
 
522 aa  130  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39691  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2276  putative protease  30.91 
 
 
524 aa  129  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.494839 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3544  TAP domain protein  30.1 
 
 
524 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000370838  hitchhiker  0.00997148 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1310  TAP domain protein  27.13 
 
 
566 aa  125  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.330733  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4219  alpha/beta hydrolase fold protein  28.39 
 
 
486 aa  124  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6096  TAP domain protein  31.22 
 
 
557 aa  123  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02580  alpha/beta hydrolase family protein  28.05 
 
 
623 aa  123  9e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.978734  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0644  hypothetical protein  27.27 
 
 
597 aa  118  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3059  hypothetical protein  28.09 
 
 
459 aa  117  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7397  TAP domain-containing protein  25.51 
 
 
613 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312183  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0071  alpha/beta fold family hydrolase  26.62 
 
 
539 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08498  proteinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01350)  24.16 
 
 
678 aa  105  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.726549  normal  0.616517 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2750  TAP domain-containing protein  26.68 
 
 
490 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.51195  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>