155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4728 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4728  TAP domain-containing protein  100 
 
 
506 aa  1036    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4414  hypothetical protein  53.33 
 
 
505 aa  520  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.694835  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7303  hypothetical protein  46.64 
 
 
532 aa  450  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4117  TAP domain-containing protein  46.04 
 
 
556 aa  419  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4973  TAP domain protein  36.78 
 
 
522 aa  238  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39691  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3345  TAP domain-containing protein  33.27 
 
 
532 aa  234  4.0000000000000004e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0319674  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3316  TAP domain protein  33.33 
 
 
484 aa  218  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0266981  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0481  TAP domain protein  33.67 
 
 
539 aa  218  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.223264  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25020  alpha/beta hydrolase family protein  35.4 
 
 
542 aa  214  3.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4710  TAP domain protein  32.11 
 
 
504 aa  211  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4537  TAP domain protein  32.4 
 
 
506 aa  209  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0841  TAP domain protein  31.12 
 
 
521 aa  207  3e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127306 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2780  tripeptidyl-peptidase B  32.89 
 
 
500 aa  206  6e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834234  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1183  TAP domain-containing protein  31.65 
 
 
495 aa  204  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0715  TAP domain-containing protein  30.94 
 
 
524 aa  203  6e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07410  alpha/beta hydrolase family protein  32.28 
 
 
525 aa  203  6e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4956  TAP domain protein  33.07 
 
 
507 aa  203  7e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.30314 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1042  TAP domain-containing protein  34.35 
 
 
535 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0225624 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0663  TAP domain protein  32.11 
 
 
525 aa  198  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419459  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3464  TAP domain-containing protein  32.85 
 
 
527 aa  196  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.660985  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7044  hypothetical protein  31.86 
 
 
522 aa  195  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393484  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24850  alpha/beta hydrolase family protein  31.2 
 
 
515 aa  194  4e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2767  TAP domain-containing protein  32.83 
 
 
546 aa  192  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8392  TAP domain protein  31.88 
 
 
537 aa  189  7e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258609  normal  0.179275 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0577  TAP domain protein  31.55 
 
 
508 aa  188  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0388  TAP domain-containing protein  31.03 
 
 
521 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3369  TAP domain protein  32.43 
 
 
547 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0557447  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0881  TAP domain protein  43.64 
 
 
545 aa  183  8.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.478786  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3160  TAP domain protein  32.71 
 
 
527 aa  180  5.999999999999999e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0491  TAP domain protein  31.07 
 
 
515 aa  179  7e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1966  hypothetical protein  32.67 
 
 
530 aa  179  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52219  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6097  TAP domain protein  31.78 
 
 
559 aa  177  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2523  TAP domain protein  29 
 
 
564 aa  177  4e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12253  exported protease  31.97 
 
 
520 aa  177  5e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.499354  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32570  alpha/beta hydrolase family protein  30.43 
 
 
541 aa  176  7e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2687  TAP domain protein  29.25 
 
 
643 aa  176  9e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589968  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6275  TAP domain-containing protein  28.89 
 
 
476 aa  176  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0907  TAP domain protein  30.77 
 
 
521 aa  175  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3267  TAP domain protein  30.91 
 
 
538 aa  176  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000317549  decreased coverage  0.0000157542 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0185  TAP domain protein  31.4 
 
 
551 aa  174  5e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.696189  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1723  TAP domain protein  29.19 
 
 
536 aa  172  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00370292  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2212  TAP domain-containing protein  32.3 
 
 
520 aa  171  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.544179  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2656  TAP domain protein  29.37 
 
 
535 aa  171  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0201051  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0464  TAP domain-containing protein  29.55 
 
 
499 aa  168  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000978752 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1488  TAP domain-containing protein  29.52 
 
 
522 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026814 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3330  tripeptidyl-peptidase B  29.5 
 
 
511 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3392  tripeptidyl-peptidase B  29.5 
 
 
511 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3341  tripeptidyl-peptidase B  29.5 
 
 
511 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175683  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3391  tripeptidyl-peptidase B  29 
 
 
508 aa  167  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3340  tripeptidyl-peptidase B  29 
 
 
508 aa  167  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478437  normal  0.109915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0472  alpha/beta hydrolase fold protein  29.57 
 
 
525 aa  167  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2192  TAP domain protein  27.33 
 
 
518 aa  166  6.9999999999999995e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3329  tripeptidyl-peptidase B  29 
 
 
533 aa  166  8e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224727  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3616  TAP domain protein  31.95 
 
 
546 aa  166  8e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.812667  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2785  TAP domain protein  32.3 
 
 
480 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000127217  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9211  hypothetical protein  30.39 
 
 
485 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1545  TAP domain-containing protein  28.87 
 
 
542 aa  161  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6091  TAP domain-containing protein  25.67 
 
 
504 aa  161  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1065  TAP domain protein  28.27 
 
 
544 aa  160  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5024  TAP domain protein  30.33 
 
 
571 aa  159  8e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412323  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0750  putative secreted peptidase  30.96 
 
 
521 aa  158  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6096  TAP domain protein  31.47 
 
 
557 aa  158  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1310  TAP domain protein  28.6 
 
 
566 aa  157  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.330733  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0356  TAP domain protein  28.83 
 
 
523 aa  157  4e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2839  TAP domain protein  29.35 
 
 
517 aa  157  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350131  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1946  TAP domain protein  31.75 
 
 
518 aa  156  7e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0350254  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0220  TAP domain protein  30.59 
 
 
551 aa  155  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712779 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2906  alpha/beta hydrolase fold  29.57 
 
 
505 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.834545 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0066  tripeptidyl-peptidase B  28.54 
 
 
540 aa  153  7e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.974168 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2729  TAP domain protein  27.67 
 
 
515 aa  153  7e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196617  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2980  TAP domain protein  31.33 
 
 
557 aa  152  8.999999999999999e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.085257  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6093  TAP domain-containing protein  26.8 
 
 
505 aa  149  8e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2904  TAP domain-containing protein  28.37 
 
 
495 aa  147  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411145  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7397  TAP domain-containing protein  27.17 
 
 
613 aa  146  9e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312183  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3599  TAP domain-containing protein  28.69 
 
 
505 aa  145  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4357  TAP domain-containing protein  26.93 
 
 
504 aa  143  7e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619924  normal  0.129935 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4219  alpha/beta hydrolase fold protein  28.83 
 
 
486 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2254  TAP domain-containing protein  27.08 
 
 
486 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.267716 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02580  alpha/beta hydrolase family protein  27.47 
 
 
623 aa  142  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.978734  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12252  exported protease  27.37 
 
 
520 aa  141  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.212366  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0438  TAP domain protein  26.82 
 
 
542 aa  141  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.574551  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3257  TAP domain-containing protein  28.9 
 
 
499 aa  140  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.590122  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6092  TAP domain-containing protein  28.82 
 
 
478 aa  139  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5935  TAP domain protein  28.03 
 
 
518 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235476  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2970  TAP domain protein  30.88 
 
 
542 aa  135  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32712  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11121  conserved hypothetical protein  26.36 
 
 
555 aa  134  3e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0230414 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3600  TAP domain-containing protein  26.33 
 
 
516 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.601455 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2442  TAP domain protein  36.05 
 
 
597 aa  131  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000431609  normal  0.057711 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2331  putative protease  34.98 
 
 
300 aa  127  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0644  hypothetical protein  30.32 
 
 
597 aa  127  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6090  TAP domain-containing protein  26.2 
 
 
508 aa  126  9e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1652  hypothetical protein  27.22 
 
 
494 aa  124  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.916188  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3650  TAP domain-containing protein  24.9 
 
 
475 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0804319  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3994  TAP domain protein  27.61 
 
 
557 aa  118  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4882  TAP domain-containing protein  26.7 
 
 
493 aa  116  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24000  alpha/beta hydrolase family protein  25.97 
 
 
514 aa  114  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0638812 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2276  putative protease  24.69 
 
 
524 aa  108  2e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.494839 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2416  TAP domain-containing protein  26.08 
 
 
505 aa  108  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000258971  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  25.15 
 
 
750 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0068  peptidase S33, prolyl aminopeptidase  23.9 
 
 
521 aa  102  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>