189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1946 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1946  TAP domain protein  100 
 
 		 518 aa  1022    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0350254  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1488  TAP domain-containing protein  46.79 
 
 		 522 aa  403  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00026814 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1545  TAP domain-containing protein  43.39 
 
 		 542 aa  394  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0066  tripeptidyl-peptidase B  45.1 
 
 		 540 aa  385  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.974168 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2780  tripeptidyl-peptidase B  39.65 
 
 		 500 aa  309  6.999999999999999e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834234  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1183  TAP domain-containing protein  41.41 
 
 		 495 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4537  TAP domain protein  39.08 
 
 		 506 aa  301  2e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3330  tripeptidyl-peptidase B  38.07 
 
 		 511 aa  296  5e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3392  tripeptidyl-peptidase B  38.07 
 
 		 511 aa  296  5e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3341  tripeptidyl-peptidase B  38.07 
 
 		 511 aa  296  5e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175683  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0388  TAP domain-containing protein  38.98 
 
 		 521 aa  293  4e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0577  TAP domain protein  40.41 
 
 		 508 aa  290  4e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0356  TAP domain protein  37.91 
 
 		 523 aa  288  1e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2904  TAP domain-containing protein  39.11 
 
 		 495 aa  287  4e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411145  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2767  TAP domain-containing protein  37.07 
 
 		 546 aa  285  1.0000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4956  TAP domain protein  38.32 
 
 		 507 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.30314 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25020  alpha/beta hydrolase family protein  41.24 
 
 		 542 aa  283  6.000000000000001e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07410  alpha/beta hydrolase family protein  38.1 
 
 		 525 aa  283  6.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0715  TAP domain-containing protein  36.86 
 
 		 524 aa  283  8.000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9211  hypothetical protein  41.33 
 
 		 485 aa  283  8.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12253  exported protease  38.55 
 
 		 520 aa  282  1e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.499354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0491  TAP domain protein  39.16 
 
 		 515 aa  282  1e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8392  TAP domain protein  38.76 
 
 		 537 aa  280  4e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258609  normal  0.179275 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24850  alpha/beta hydrolase family protein  37.07 
 
 		 515 aa  278  1e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3600  TAP domain-containing protein  37.28 
 
 		 516 aa  278  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601455 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32570  alpha/beta hydrolase family protein  39.09 
 
 		 541 aa  276  5e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7044  hypothetical protein  36.83 
 
 		 522 aa  276  7e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393484  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3464  TAP domain-containing protein  39.56 
 
 		 527 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.660985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3267  TAP domain protein  39.19 
 
 		 538 aa  273  6e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000317549  decreased coverage  0.0000157542 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0841  TAP domain protein  36.11 
 
 		 521 aa  265  1e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127306 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0907  TAP domain protein  37.45 
 
 		 521 aa  265  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0663  TAP domain protein  39.69 
 
 		 525 aa  260  5.0000000000000005e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3329  tripeptidyl-peptidase B  38.48 
 
 		 533 aa  257  4e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224727  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3391  tripeptidyl-peptidase B  38.48 
 
 		 508 aa  256  7e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3340  tripeptidyl-peptidase B  38.48 
 
 		 508 aa  256  7e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478437  normal  0.109915 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2192  TAP domain protein  36.6 
 
 		 518 aa  256  8e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0881  TAP domain protein  35.5 
 
 		 545 aa  251  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.478786  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24000  alpha/beta hydrolase family protein  35.96 
 
 		 514 aa  249  1e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0638812 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12252  exported protease  37.39 
 
 		 520 aa  239  9e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.212366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2906  alpha/beta hydrolase fold  36.02 
 
 		 505 aa  234  3e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.834545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1065  TAP domain protein  31.39 
 
 		 544 aa  232  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3599  TAP domain-containing protein  35.38 
 
 		 505 aa  231  3e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0185  TAP domain protein  34.76 
 
 		 551 aa  218  2.9999999999999998e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.696189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2523  TAP domain protein  33.47 
 
 		 564 aa  213  7.999999999999999e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2656  TAP domain protein  34.66 
 
 		 535 aa  208  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0201051  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2980  TAP domain protein  37.8 
 
 		 557 aa  206  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.085257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0220  TAP domain protein  35.41 
 
 		 551 aa  203  5e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712779 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6275  TAP domain-containing protein  32.75 
 
 		 476 aa  198  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0464  TAP domain-containing protein  31.6 
 
 		 499 aa  197  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000978752 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5024  TAP domain protein  34.73 
 
 		 571 aa  196  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412323  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4357  TAP domain-containing protein  31.17 
 
 		 504 aa  195  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619924  normal  0.129935 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5935  TAP domain protein  33.98 
 
 		 518 aa  193  8e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235476  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6091  TAP domain-containing protein  27.74 
 
 		 504 aa  190  7e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1042  TAP domain-containing protein  33.33 
 
 		 535 aa  189  9e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0225624 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6093  TAP domain-containing protein  28.72 
 
 		 505 aa  189  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2970  TAP domain protein  33.4 
 
 		 542 aa  188  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32712  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3544  TAP domain protein  34.31 
 
 		 524 aa  179  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000370838  hitchhiker  0.00997148 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2729  TAP domain protein  32.08 
 
 		 515 aa  179  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196617  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1966  hypothetical protein  32.45 
 
 		 530 aa  176  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52219  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11121  conserved hypothetical protein  31.84 
 
 		 555 aa  176  9e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0230414 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4728  TAP domain-containing protein  31.75 
 
 		 506 aa  170  5e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4414  hypothetical protein  33.48 
 
 		 505 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.694835  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1577  TAP domain protein  32.65 
 
 		 514 aa  165  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6090  TAP domain-containing protein  29.65 
 
 		 508 aa  162  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7303  hypothetical protein  33.4 
 
 		 532 aa  160  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3316  TAP domain protein  32.75 
 
 		 484 aa  160  6e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0266981  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3369  TAP domain protein  31.35 
 
 		 547 aa  160  7e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0557447  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2254  TAP domain-containing protein  29.87 
 
 		 486 aa  159  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.267716 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2687  TAP domain protein  44.79 
 
 		 643 aa  157  4e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2212  TAP domain-containing protein  29.62 
 
 		 520 aa  156  9e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.544179  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0481  TAP domain protein  30.39 
 
 		 539 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.223264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3345  TAP domain-containing protein  29.89 
 
 		 532 aa  154  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0319674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0750  putative secreted peptidase  31.61 
 
 		 521 aa  151  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4710  TAP domain protein  31.22 
 
 		 504 aa  150  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4117  TAP domain-containing protein  32.68 
 
 		 556 aa  150  6e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1652  hypothetical protein  30.3 
 
 		 494 aa  150  6e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.916188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0644  hypothetical protein  24.95 
 
 		 597 aa  150  7e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4973  TAP domain protein  30.34 
 
 		 522 aa  148  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39691  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3160  TAP domain protein  30.62 
 
 		 527 aa  147  6e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2416  TAP domain-containing protein  29.07 
 
 		 505 aa  142  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000258971  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3257  TAP domain-containing protein  28.89 
 
 		 499 aa  139  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.590122  normal  0.324088 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08498  proteinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01350)  26.64 
 
 		 678 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.726549  normal  0.616517 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2442  TAP domain protein  40.84 
 
 		 597 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000431609  normal  0.057711 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2331  putative protease  37.77 
 
 		 300 aa  134  5e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2276  putative protease  30.34 
 
 		 524 aa  133  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.494839 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3616  TAP domain protein  31.83 
 
 		 546 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.812667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2839  TAP domain protein  28.32 
 
 		 517 aa  131  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350131  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3914  TAP domain-containing protein  27.97 
 
 		 519 aa  130  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.527163  normal  0.822119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6092  TAP domain-containing protein  25.36 
 
 		 478 aa  126  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1723  TAP domain protein  28.88 
 
 		 536 aa  125  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00370292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2489  TAP domain-containing protein  27.59 
 
 		 519 aa  124  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.322289 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12687  protease  27.05 
 
 		 525 aa  125  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.68e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  28.38 
 
 		 750 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4219  alpha/beta hydrolase fold protein  27.31 
 
 		 486 aa  124  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1310  TAP domain protein  29.04 
 
 		 566 aa  123  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.330733  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0472  alpha/beta hydrolase fold protein  31.33 
 
 		 525 aa  121  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2218  TAP-like protein  26.98 
 
 		 520 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2264  TAP domain-containing protein  26.98 
 
 		 520 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.149819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2207  TAP domain-containing protein  26.79 
 
 		 520 aa  117  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4882  TAP domain-containing protein  27.66 
 
 		 493 aa  117  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>