213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0907 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0907  TAP domain protein  100 
 
 
521 aa  1034    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07410  alpha/beta hydrolase family protein  54.14 
 
 
525 aa  526  1e-148  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3330  tripeptidyl-peptidase B  51.88 
 
 
511 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3392  tripeptidyl-peptidase B  51.88 
 
 
511 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3341  tripeptidyl-peptidase B  51.88 
 
 
511 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175683  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3600  TAP domain-containing protein  52.09 
 
 
516 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.601455 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2904  TAP domain-containing protein  52.3 
 
 
495 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411145  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3267  TAP domain protein  49.8 
 
 
538 aa  451  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000317549  decreased coverage  0.0000157542 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3329  tripeptidyl-peptidase B  49.69 
 
 
533 aa  445  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224727  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3391  tripeptidyl-peptidase B  49.69 
 
 
508 aa  444  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3340  tripeptidyl-peptidase B  49.69 
 
 
508 aa  444  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478437  normal  0.109915 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12253  exported protease  50.44 
 
 
520 aa  437  1e-121  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.499354  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12252  exported protease  46.95 
 
 
520 aa  410  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.212366  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2906  alpha/beta hydrolase fold  46.72 
 
 
505 aa  395  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.834545 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3599  TAP domain-containing protein  48.67 
 
 
505 aa  387  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4537  TAP domain protein  41.57 
 
 
506 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0841  TAP domain protein  37.94 
 
 
521 aa  316  6e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127306 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0715  TAP domain-containing protein  38.27 
 
 
524 aa  308  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0881  TAP domain protein  39.53 
 
 
545 aa  306  7e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.478786  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8392  TAP domain protein  40.12 
 
 
537 aa  305  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258609  normal  0.179275 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7044  hypothetical protein  39.24 
 
 
522 aa  291  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393484  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3464  TAP domain-containing protein  40.04 
 
 
527 aa  292  1e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.660985  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4956  TAP domain protein  40.68 
 
 
507 aa  288  1e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.30314 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0356  TAP domain protein  37.68 
 
 
523 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0577  TAP domain protein  39.28 
 
 
508 aa  283  6.000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0066  tripeptidyl-peptidase B  41.72 
 
 
540 aa  282  9e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.974168 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1183  TAP domain-containing protein  39.38 
 
 
495 aa  282  1e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2780  tripeptidyl-peptidase B  38.79 
 
 
500 aa  281  2e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834234  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0491  TAP domain protein  40.08 
 
 
515 aa  281  2e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1545  TAP domain-containing protein  37.04 
 
 
542 aa  280  5e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32570  alpha/beta hydrolase family protein  38.13 
 
 
541 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9211  hypothetical protein  41.63 
 
 
485 aa  274  4.0000000000000004e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2192  TAP domain protein  34.17 
 
 
518 aa  271  2e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1488  TAP domain-containing protein  38.41 
 
 
522 aa  271  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026814 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24850  alpha/beta hydrolase family protein  35.65 
 
 
515 aa  268  1e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0388  TAP domain-containing protein  37.5 
 
 
521 aa  256  7e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25020  alpha/beta hydrolase family protein  37.73 
 
 
542 aa  255  2.0000000000000002e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1946  TAP domain protein  37.21 
 
 
518 aa  254  3e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0350254  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0663  TAP domain protein  35.81 
 
 
525 aa  243  5e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419459  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2767  TAP domain-containing protein  34.15 
 
 
546 aa  241  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2416  TAP domain-containing protein  32.75 
 
 
505 aa  232  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000258971  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0185  TAP domain protein  35.83 
 
 
551 aa  229  8e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.696189  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1042  TAP domain-containing protein  36.92 
 
 
535 aa  229  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0225624 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6091  TAP domain-containing protein  32.97 
 
 
504 aa  213  7e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2980  TAP domain protein  34.74 
 
 
557 aa  210  5e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.085257  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1966  hypothetical protein  32.87 
 
 
530 aa  208  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52219  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6093  TAP domain-containing protein  33.62 
 
 
505 aa  206  6e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1652  hypothetical protein  29.71 
 
 
494 aa  204  4e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.916188  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2523  TAP domain protein  34.69 
 
 
564 aa  204  4e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6275  TAP domain-containing protein  31.39 
 
 
476 aa  203  7e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0464  TAP domain-containing protein  31.91 
 
 
499 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000978752 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2656  TAP domain protein  35.03 
 
 
535 aa  197  5.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0201051  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4357  TAP domain-containing protein  33.77 
 
 
504 aa  197  5.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619924  normal  0.129935 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3369  TAP domain protein  32.28 
 
 
547 aa  196  7e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0557447  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5935  TAP domain protein  33.6 
 
 
518 aa  186  8e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235476  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7303  hypothetical protein  31.68 
 
 
532 aa  186  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0750  putative secreted peptidase  33.04 
 
 
521 aa  182  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2970  TAP domain protein  32.5 
 
 
542 aa  182  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32712  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1065  TAP domain protein  30.11 
 
 
544 aa  182  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3616  TAP domain protein  33.84 
 
 
546 aa  179  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.812667  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2729  TAP domain protein  32.08 
 
 
515 aa  179  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196617  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4728  TAP domain-containing protein  30.77 
 
 
506 aa  176  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4414  hypothetical protein  32.13 
 
 
505 aa  175  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.694835  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2687  TAP domain protein  31.94 
 
 
643 aa  173  7.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589968  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0481  TAP domain protein  30.83 
 
 
539 aa  172  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.223264  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0220  TAP domain protein  36.31 
 
 
551 aa  171  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712779 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5024  TAP domain protein  33.4 
 
 
571 aa  171  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412323  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6090  TAP domain-containing protein  32.17 
 
 
508 aa  169  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3160  TAP domain protein  32.79 
 
 
527 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6092  TAP domain-containing protein  29.85 
 
 
478 aa  167  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4710  TAP domain protein  32.32 
 
 
504 aa  165  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2254  TAP domain-containing protein  30.32 
 
 
486 aa  161  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.267716 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3345  TAP domain-containing protein  30.79 
 
 
532 aa  161  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0319674  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4117  TAP domain-containing protein  30.77 
 
 
556 aa  159  8e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4973  TAP domain protein  30.83 
 
 
522 aa  158  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39691  normal  0.167078 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11121  conserved hypothetical protein  29.74 
 
 
555 aa  156  9e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0230414 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1310  TAP domain protein  29.8 
 
 
566 aa  151  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.330733  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0644  hypothetical protein  27.04 
 
 
597 aa  150  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3316  TAP domain protein  29.66 
 
 
484 aa  149  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0266981  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2212  TAP domain-containing protein  29.78 
 
 
520 aa  145  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.544179  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4219  alpha/beta hydrolase fold protein  30.36 
 
 
486 aa  145  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2839  TAP domain protein  30.16 
 
 
517 aa  143  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350131  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2442  TAP domain protein  30.12 
 
 
597 aa  142  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000431609  normal  0.057711 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2331  putative protease  39.58 
 
 
300 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  29.55 
 
 
750 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4882  TAP domain-containing protein  29.5 
 
 
493 aa  141  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24000  alpha/beta hydrolase family protein  29.69 
 
 
514 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0638812 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2785  TAP domain protein  29.83 
 
 
480 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000127217  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7397  TAP domain-containing protein  27.84 
 
 
613 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312183  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3257  TAP domain-containing protein  28.17 
 
 
499 aa  129  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.590122  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2276  putative protease  29.6 
 
 
524 aa  126  8.000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.494839 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3650  TAP domain-containing protein  26.36 
 
 
475 aa  126  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0804319  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1723  TAP domain protein  30.79 
 
 
536 aa  125  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00370292  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0472  alpha/beta hydrolase fold protein  33.46 
 
 
525 aa  123  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3059  hypothetical protein  28.92 
 
 
459 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6096  TAP domain protein  28.93 
 
 
557 aa  117  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2750  TAP domain-containing protein  28.36 
 
 
490 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.51195  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0265  TAP domain-containing protein  27.03 
 
 
669 aa  113  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0441544  normal  0.0338675 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6097  TAP domain protein  28.54 
 
 
559 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3544  TAP domain protein  27.22 
 
 
524 aa  103  7e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000370838  hitchhiker  0.00997148 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>