165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0464 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0464  TAP domain-containing protein  100 
 
 
499 aa  1032    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000978752 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4357  TAP domain-containing protein  55.05 
 
 
504 aa  523  1e-147  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619924  normal  0.129935 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6091  TAP domain-containing protein  50.62 
 
 
504 aa  486  1e-136  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6093  TAP domain-containing protein  53.02 
 
 
505 aa  463  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6092  TAP domain-containing protein  49.45 
 
 
478 aa  440  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6090  TAP domain-containing protein  49.36 
 
 
508 aa  437  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2729  TAP domain protein  40.33 
 
 
515 aa  348  1e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196617  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5935  TAP domain protein  40.2 
 
 
518 aa  342  1e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235476  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2254  TAP domain-containing protein  39.91 
 
 
486 aa  317  2e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.267716 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6275  TAP domain-containing protein  32.97 
 
 
476 aa  251  3e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4537  TAP domain protein  31.99 
 
 
506 aa  227  4e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0577  TAP domain protein  33.69 
 
 
508 aa  224  2e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0715  TAP domain-containing protein  33.19 
 
 
524 aa  224  4e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0663  TAP domain protein  33.84 
 
 
525 aa  223  9e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419459  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11121  conserved hypothetical protein  33.12 
 
 
555 aa  221  1.9999999999999999e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0230414 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2523  TAP domain protein  33.78 
 
 
564 aa  219  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2780  tripeptidyl-peptidase B  33.68 
 
 
500 aa  216  8e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834234  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  31.68 
 
 
750 aa  216  8e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3329  tripeptidyl-peptidase B  33.33 
 
 
533 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224727  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3391  tripeptidyl-peptidase B  33.33 
 
 
508 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3340  tripeptidyl-peptidase B  33.33 
 
 
508 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478437  normal  0.109915 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1488  TAP domain-containing protein  32.52 
 
 
522 aa  216  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026814 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1545  TAP domain-containing protein  31.97 
 
 
542 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07410  alpha/beta hydrolase family protein  34.12 
 
 
525 aa  211  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0388  TAP domain-containing protein  32.03 
 
 
521 aa  209  8e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25020  alpha/beta hydrolase family protein  33.12 
 
 
542 aa  209  9e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1183  TAP domain-containing protein  29.4 
 
 
495 aa  206  6e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0356  TAP domain protein  32.35 
 
 
523 aa  206  6e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0841  TAP domain protein  30.79 
 
 
521 aa  206  9e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127306 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7044  hypothetical protein  30.94 
 
 
522 aa  202  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393484  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2904  TAP domain-containing protein  32.57 
 
 
495 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411145  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0907  TAP domain protein  31.91 
 
 
521 aa  201  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3330  tripeptidyl-peptidase B  31.61 
 
 
511 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3392  tripeptidyl-peptidase B  31.61 
 
 
511 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3341  tripeptidyl-peptidase B  31.61 
 
 
511 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175683  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12252  exported protease  31.88 
 
 
520 aa  199  7e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.212366  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3600  TAP domain-containing protein  31.87 
 
 
516 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.601455 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4956  TAP domain protein  32.63 
 
 
507 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.30314 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32570  alpha/beta hydrolase family protein  32.55 
 
 
541 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2192  TAP domain protein  31.14 
 
 
518 aa  198  2.0000000000000003e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1946  TAP domain protein  30.94 
 
 
518 aa  197  5.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0350254  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0491  TAP domain protein  32.13 
 
 
515 aa  195  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2767  TAP domain-containing protein  29.25 
 
 
546 aa  195  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3257  TAP domain-containing protein  30.38 
 
 
499 aa  194  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.590122  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2906  alpha/beta hydrolase fold  32.03 
 
 
505 aa  189  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.834545 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3345  TAP domain-containing protein  30.36 
 
 
532 aa  188  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0319674  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3464  TAP domain-containing protein  31.03 
 
 
527 aa  187  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.660985  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24850  alpha/beta hydrolase family protein  30.56 
 
 
515 aa  186  6e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12253  exported protease  31.26 
 
 
520 aa  186  8e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.499354  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2656  TAP domain protein  30.52 
 
 
535 aa  186  8e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0201051  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4882  TAP domain-containing protein  28.91 
 
 
493 aa  186  9e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0066  tripeptidyl-peptidase B  31.25 
 
 
540 aa  186  1.0000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.974168 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3599  TAP domain-containing protein  31.97 
 
 
505 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2980  TAP domain protein  32.03 
 
 
557 aa  183  7e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.085257  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3267  TAP domain protein  29.84 
 
 
538 aa  182  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000317549  decreased coverage  0.0000157542 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7303  hypothetical protein  29.62 
 
 
532 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0481  TAP domain protein  30.33 
 
 
539 aa  178  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.223264  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0220  TAP domain protein  30.57 
 
 
551 aa  178  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712779 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2970  TAP domain protein  27.73 
 
 
542 aa  176  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32712  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0185  TAP domain protein  30.14 
 
 
551 aa  174  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.696189  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2750  TAP domain-containing protein  28.77 
 
 
490 aa  173  7.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.51195  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0881  TAP domain protein  27.52 
 
 
545 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.478786  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3059  hypothetical protein  29.57 
 
 
459 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8392  TAP domain protein  29.79 
 
 
537 aa  169  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258609  normal  0.179275 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4728  TAP domain-containing protein  29.82 
 
 
506 aa  168  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4414  hypothetical protein  29.65 
 
 
505 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.694835  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1042  TAP domain-containing protein  29.87 
 
 
535 aa  167  5.9999999999999996e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0225624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9211  hypothetical protein  42.03 
 
 
485 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3316  TAP domain protein  30.18 
 
 
484 aa  166  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0266981  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3650  TAP domain-containing protein  30.3 
 
 
475 aa  165  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0804319  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2212  TAP domain-containing protein  29.48 
 
 
520 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.544179  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4973  TAP domain protein  30.02 
 
 
522 aa  163  8.000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39691  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5024  TAP domain protein  29.76 
 
 
571 aa  160  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412323  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4219  alpha/beta hydrolase fold protein  31.42 
 
 
486 aa  160  5e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2442  TAP domain protein  28.54 
 
 
597 aa  160  6e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000431609  normal  0.057711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1966  hypothetical protein  29.47 
 
 
530 aa  159  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52219  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1065  TAP domain protein  27.19 
 
 
544 aa  159  9e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3369  TAP domain protein  30.33 
 
 
547 aa  159  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0557447  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3616  TAP domain protein  29.57 
 
 
546 aa  157  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.812667  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4117  TAP domain-containing protein  29.92 
 
 
556 aa  156  7e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4710  TAP domain protein  30.02 
 
 
504 aa  156  8e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2687  TAP domain protein  38.54 
 
 
643 aa  154  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589968  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2331  putative protease  34.12 
 
 
300 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2416  TAP domain-containing protein  26.28 
 
 
505 aa  147  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000258971  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0750  putative secreted peptidase  29.5 
 
 
521 aa  147  6e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3160  TAP domain protein  27.14 
 
 
527 aa  144  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1723  TAP domain protein  27.78 
 
 
536 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00370292  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2276  putative protease  29.36 
 
 
524 aa  140  3.9999999999999997e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.494839 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1310  TAP domain protein  28.06 
 
 
566 aa  133  6.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.330733  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1652  hypothetical protein  27.85 
 
 
494 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.916188  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2839  TAP domain protein  26.01 
 
 
517 aa  132  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350131  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0472  alpha/beta hydrolase fold protein  23.97 
 
 
525 aa  123  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0644  hypothetical protein  31.42 
 
 
597 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4190  TAP domain-containing protein  24.59 
 
 
519 aa  118  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6097  TAP domain protein  27.29 
 
 
559 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7397  TAP domain-containing protein  24.57 
 
 
613 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312183  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4460  TAP domain-containing protein  27.36 
 
 
533 aa  104  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.726615 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0071  alpha/beta fold family hydrolase  29.34 
 
 
539 aa  104  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05429  conserved hypothetical protein  24.38 
 
 
600 aa  103  6e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00467317  normal  0.0133715 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24000  alpha/beta hydrolase family protein  26.36 
 
 
514 aa  103  6e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0638812 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>