170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2980 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2980  TAP domain protein  100 
 
 		 557 aa  1089    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.085257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2780  tripeptidyl-peptidase B  41.44 
 
 		 500 aa  302  9e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834234  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4956  TAP domain protein  40.71 
 
 		 507 aa  281  2e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.30314 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4537  TAP domain protein  37.84 
 
 		 506 aa  272  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3464  TAP domain-containing protein  39.92 
 
 		 527 aa  267  4e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.660985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0663  TAP domain protein  38.49 
 
 		 525 aa  261  3e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0491  TAP domain protein  40.37 
 
 		 515 aa  260  4e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25020  alpha/beta hydrolase family protein  38.96 
 
 		 542 aa  252  1e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9211  hypothetical protein  38.01 
 
 		 485 aa  248  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0577  TAP domain protein  38.32 
 
 		 508 aa  242  1e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1183  TAP domain-containing protein  37.75 
 
 		 495 aa  241  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7044  hypothetical protein  37.01 
 
 		 522 aa  240  5.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8392  TAP domain protein  36.23 
 
 		 537 aa  234  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258609  normal  0.179275 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0715  TAP domain-containing protein  33.45 
 
 		 524 aa  232  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12253  exported protease  32.61 
 
 		 520 aa  230  4e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.499354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32570  alpha/beta hydrolase family protein  34.02 
 
 		 541 aa  229  9e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0907  TAP domain protein  36.19 
 
 		 521 aa  225  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0841  TAP domain protein  32.64 
 
 		 521 aa  224  3e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127306 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3329  tripeptidyl-peptidase B  35.29 
 
 		 533 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224727  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3391  tripeptidyl-peptidase B  35.29 
 
 		 508 aa  222  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3340  tripeptidyl-peptidase B  35.29 
 
 		 508 aa  222  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478437  normal  0.109915 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0388  TAP domain-containing protein  35.28 
 
 		 521 aa  217  5e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12252  exported protease  35.01 
 
 		 520 aa  216  7e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.212366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3330  tripeptidyl-peptidase B  31.82 
 
 		 511 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3392  tripeptidyl-peptidase B  31.82 
 
 		 511 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3341  tripeptidyl-peptidase B  31.82 
 
 		 511 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175683  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3599  TAP domain-containing protein  35.18 
 
 		 505 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2192  TAP domain protein  32.16 
 
 		 518 aa  214  3.9999999999999995e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24850  alpha/beta hydrolase family protein  36.08 
 
 		 515 aa  213  4.9999999999999996e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1946  TAP domain protein  37.8 
 
 		 518 aa  213  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0350254  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2906  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 		 505 aa  211  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.834545 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2767  TAP domain-containing protein  33.21 
 
 		 546 aa  211  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0356  TAP domain protein  34.99 
 
 		 523 aa  211  3e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2687  TAP domain protein  35.23 
 
 		 643 aa  210  5e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07410  alpha/beta hydrolase family protein  34.56 
 
 		 525 aa  209  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0881  TAP domain protein  31.53 
 
 		 545 aa  205  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.478786  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1488  TAP domain-containing protein  35.08 
 
 		 522 aa  203  8e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00026814 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3267  TAP domain protein  34.76 
 
 		 538 aa  202  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000317549  decreased coverage  0.0000157542 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1042  TAP domain-containing protein  34.15 
 
 		 535 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0225624 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2904  TAP domain-containing protein  33.98 
 
 		 495 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411145  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2656  TAP domain protein  36.01 
 
 		 535 aa  202  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0201051  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1545  TAP domain-containing protein  34.27 
 
 		 542 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3600  TAP domain-containing protein  33.2 
 
 		 516 aa  198  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601455 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2523  TAP domain protein  35.08 
 
 		 564 aa  197  3e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0464  TAP domain-containing protein  32.31 
 
 		 499 aa  197  5.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000978752 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6091  TAP domain-containing protein  30.6 
 
 		 504 aa  194  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6275  TAP domain-containing protein  33.67 
 
 		 476 aa  194  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0066  tripeptidyl-peptidase B  34.3 
 
 		 540 aa  189  8e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.974168 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4357  TAP domain-containing protein  31.82 
 
 		 504 aa  189  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619924  normal  0.129935 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7303  hypothetical protein  35.22 
 
 		 532 aa  182  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1065  TAP domain protein  31.99 
 
 		 544 aa  182  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6093  TAP domain-containing protein  30.71 
 
 		 505 aa  179  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1966  hypothetical protein  30.42 
 
 		 530 aa  176  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3369  TAP domain protein  31.05 
 
 		 547 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0557447  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4710  TAP domain protein  30.91 
 
 		 504 aa  173  7.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4414  hypothetical protein  32.3 
 
 		 505 aa  173  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.694835  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3160  TAP domain protein  33.96 
 
 		 527 aa  171  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2970  TAP domain protein  31.78 
 
 		 542 aa  172  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32712  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3616  TAP domain protein  34.12 
 
 		 546 aa  171  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.812667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4117  TAP domain-containing protein  33.21 
 
 		 556 aa  167  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2416  TAP domain-containing protein  27.76 
 
 		 505 aa  166  8e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000258971  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4728  TAP domain-containing protein  31.88 
 
 		 506 aa  163  6e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3345  TAP domain-containing protein  29.68 
 
 		 532 aa  162  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0319674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6090  TAP domain-containing protein  30.6 
 
 		 508 aa  160  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2212  TAP domain-containing protein  29.02 
 
 		 520 aa  158  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.544179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0185  TAP domain protein  32.86 
 
 		 551 aa  157  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.696189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2254  TAP domain-containing protein  31.06 
 
 		 486 aa  157  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.267716 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1723  TAP domain protein  28.84 
 
 		 536 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00370292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3316  TAP domain protein  31.24 
 
 		 484 aa  154  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0266981  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0750  putative secreted peptidase  34.03 
 
 		 521 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11121  conserved hypothetical protein  30.55 
 
 		 555 aa  153  8e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0230414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2729  TAP domain protein  29.19 
 
 		 515 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196617  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  30.04 
 
 		 750 aa  151  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5024  TAP domain protein  32.02 
 
 		 571 aa  150  5e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412323  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2442  TAP domain protein  30.23 
 
 		 597 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000431609  normal  0.057711 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4973  TAP domain protein  30.42 
 
 		 522 aa  147  7.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39691  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0481  TAP domain protein  29.4 
 
 		 539 aa  146  8.000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.223264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1310  TAP domain protein  30.45 
 
 		 566 aa  144  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.330733  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1652  hypothetical protein  26.96 
 
 		 494 aa  144  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.916188  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4219  alpha/beta hydrolase fold protein  31.28 
 
 		 486 aa  143  9e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3257  TAP domain-containing protein  29.61 
 
 		 499 aa  142  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.590122  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2276  putative protease  30.42 
 
 		 524 aa  139  1e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.494839 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2331  putative protease  39.27 
 
 		 300 aa  139  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7397  TAP domain-containing protein  29.28 
 
 		 613 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5935  TAP domain protein  30.59 
 
 		 518 aa  138  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235476  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0644  hypothetical protein  26.31 
 
 		 597 aa  137  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0220  TAP domain protein  40.17 
 
 		 551 aa  135  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712779 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24000  alpha/beta hydrolase family protein  30.17 
 
 		 514 aa  131  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0638812 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2750  TAP domain-containing protein  27.42 
 
 		 490 aa  118  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.51195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3059  hypothetical protein  26.95 
 
 		 459 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2839  TAP domain protein  28.48 
 
 		 517 aa  116  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350131  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6097  TAP domain protein  30.32 
 
 		 559 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3994  TAP domain protein  30.65 
 
 		 557 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3650  TAP domain-containing protein  28.57 
 
 		 475 aa  110  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0804319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0472  alpha/beta hydrolase fold protein  33.2 
 
 		 525 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3544  TAP domain protein  30.73 
 
 		 524 aa  108  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000370838  hitchhiker  0.00997148 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6092  TAP domain-containing protein  29.74 
 
 		 478 aa  106  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0438  TAP domain protein  27.38 
 
 		 542 aa  105  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.574551  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08498  proteinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01350)  24.1 
 
 		 678 aa  99.4  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.726549  normal  0.616517 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3351  alpha/beta hydrolase fold protein  38.62 
 
 		 489 aa  99  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172382  normal  0.0371725 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>