166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4710 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4710  TAP domain protein  100 
 
 		 504 aa  1019    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3316  TAP domain protein  56.42 
 
 		 484 aa  519  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0266981  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3345  TAP domain-containing protein  45.88 
 
 		 532 aa  415  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0319674  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1723  TAP domain protein  45.78 
 
 		 536 aa  380  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00370292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3160  TAP domain protein  40.88 
 
 		 527 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4973  TAP domain protein  39.34 
 
 		 522 aa  303  7.000000000000001e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39691  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0481  TAP domain protein  35.74 
 
 		 539 aa  238  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.223264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4414  hypothetical protein  34.49 
 
 		 505 aa  226  5.0000000000000005e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.694835  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7303  hypothetical protein  36.44 
 
 		 532 aa  222  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4117  TAP domain-containing protein  34.07 
 
 		 556 aa  218  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1042  TAP domain-containing protein  36.06 
 
 		 535 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0225624 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4728  TAP domain-containing protein  32.12 
 
 		 506 aa  211  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2212  TAP domain-containing protein  32.54 
 
 		 520 aa  209  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.544179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1966  hypothetical protein  35.48 
 
 		 530 aa  203  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3369  TAP domain protein  33.33 
 
 		 547 aa  189  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0557447  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2523  TAP domain protein  31.24 
 
 		 564 aa  187  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4537  TAP domain protein  32.77 
 
 		 506 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2780  tripeptidyl-peptidase B  31.13 
 
 		 500 aa  181  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834234  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3616  TAP domain protein  33.4 
 
 		 546 aa  181  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.812667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3330  tripeptidyl-peptidase B  32.02 
 
 		 511 aa  179  7e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3392  tripeptidyl-peptidase B  32.02 
 
 		 511 aa  179  7e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3341  tripeptidyl-peptidase B  32.02 
 
 		 511 aa  179  7e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175683  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4956  TAP domain protein  31.5 
 
 		 507 aa  179  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.30314 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0388  TAP domain-containing protein  32.06 
 
 		 521 aa  179  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1183  TAP domain-containing protein  31.39 
 
 		 495 aa  178  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0663  TAP domain protein  32.75 
 
 		 525 aa  178  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7044  hypothetical protein  30.78 
 
 		 522 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0841  TAP domain protein  31.78 
 
 		 521 aa  176  9e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127306 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0715  TAP domain-containing protein  29.85 
 
 		 524 aa  175  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25020  alpha/beta hydrolase family protein  33.54 
 
 		 542 aa  173  5.999999999999999e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24850  alpha/beta hydrolase family protein  31.48 
 
 		 515 aa  173  6.999999999999999e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07410  alpha/beta hydrolase family protein  29.21 
 
 		 525 aa  173  7.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6091  TAP domain-containing protein  28.82 
 
 		 504 aa  171  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1065  TAP domain protein  29.69 
 
 		 544 aa  171  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2980  TAP domain protein  31.83 
 
 		 557 aa  169  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.085257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1545  TAP domain-containing protein  31.87 
 
 		 542 aa  168  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2656  TAP domain protein  31.06 
 
 		 535 aa  169  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0201051  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9211  hypothetical protein  30 
 
 		 485 aa  168  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0464  TAP domain-containing protein  30.69 
 
 		 499 aa  167  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000978752 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5935  TAP domain protein  30.62 
 
 		 518 aa  167  5e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235476  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0220  TAP domain protein  33.6 
 
 		 551 aa  166  5.9999999999999996e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712779 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0750  putative secreted peptidase  32.83 
 
 		 521 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2785  TAP domain protein  32.84 
 
 		 480 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000127217  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8392  TAP domain protein  33.54 
 
 		 537 aa  164  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258609  normal  0.179275 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2970  TAP domain protein  29.38 
 
 		 542 aa  164  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32712  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0907  TAP domain protein  31.9 
 
 		 521 aa  163  6e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3329  tripeptidyl-peptidase B  31.14 
 
 		 533 aa  163  9e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224727  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3391  tripeptidyl-peptidase B  31.14 
 
 		 508 aa  163  9e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3340  tripeptidyl-peptidase B  31.14 
 
 		 508 aa  163  9e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478437  normal  0.109915 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12253  exported protease  29.69 
 
 		 520 aa  162  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.499354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2904  TAP domain-containing protein  29.18 
 
 		 495 aa  161  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411145  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0577  TAP domain protein  32.45 
 
 		 508 aa  161  3e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6097  TAP domain protein  31.6 
 
 		 559 aa  161  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0066  tripeptidyl-peptidase B  30.85 
 
 		 540 aa  158  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.974168 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32570  alpha/beta hydrolase family protein  28.45 
 
 		 541 aa  158  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2729  TAP domain protein  30.14 
 
 		 515 aa  158  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196617  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5024  TAP domain protein  33.6 
 
 		 571 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412323  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3464  TAP domain-containing protein  31.03 
 
 		 527 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.660985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2767  TAP domain-containing protein  28.63 
 
 		 546 aa  156  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2906  alpha/beta hydrolase fold  29.54 
 
 		 505 aa  156  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.834545 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1488  TAP domain-containing protein  31.9 
 
 		 522 aa  155  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00026814 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12252  exported protease  30.15 
 
 		 520 aa  154  4e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.212366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3257  TAP domain-containing protein  31.89 
 
 		 499 aa  154  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.590122  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2192  TAP domain protein  29.38 
 
 		 518 aa  154  5e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3599  TAP domain-containing protein  31.07 
 
 		 505 aa  153  7e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4357  TAP domain-containing protein  28.97 
 
 		 504 aa  152  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619924  normal  0.129935 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3994  TAP domain protein  31.75 
 
 		 557 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0491  TAP domain protein  31.4 
 
 		 515 aa  152  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0472  alpha/beta hydrolase fold protein  30.51 
 
 		 525 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6275  TAP domain-containing protein  29.25 
 
 		 476 aa  151  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1310  TAP domain protein  30.47 
 
 		 566 aa  150  4e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.330733  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3267  TAP domain protein  30.49 
 
 		 538 aa  150  5e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000317549  decreased coverage  0.0000157542 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1946  TAP domain protein  30.98 
 
 		 518 aa  150  5e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0350254  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0881  TAP domain protein  27.64 
 
 		 545 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.478786  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2687  TAP domain protein  35.26 
 
 		 643 aa  145  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0644  hypothetical protein  26.09 
 
 		 597 aa  142  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4219  alpha/beta hydrolase fold protein  28.91 
 
 		 486 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0185  TAP domain protein  29.2 
 
 		 551 aa  142  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.696189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6096  TAP domain protein  30.14 
 
 		 557 aa  139  7.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2839  TAP domain protein  30.32 
 
 		 517 aa  137  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350131  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3600  TAP domain-containing protein  27.03 
 
 		 516 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601455 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0438  TAP domain protein  27.81 
 
 		 542 aa  133  9e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.574551  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6093  TAP domain-containing protein  28.66 
 
 		 505 aa  132  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0356  TAP domain protein  29.32 
 
 		 523 aa  131  3e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2331  putative protease  35.04 
 
 		 300 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2442  TAP domain protein  33.57 
 
 		 597 aa  127  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000431609  normal  0.057711 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6092  TAP domain-containing protein  29.28 
 
 		 478 aa  127  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1652  hypothetical protein  25.79 
 
 		 494 aa  125  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.916188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2416  TAP domain-containing protein  26.43 
 
 		 505 aa  121  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000258971  normal  0.152884 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11121  conserved hypothetical protein  34.23 
 
 		 555 aa  120  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0230414 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2276  putative protease  26.53 
 
 		 524 aa  115  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.494839 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7397  TAP domain-containing protein  32.38 
 
 		 613 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  31.03 
 
 		 750 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2254  TAP domain-containing protein  24.85 
 
 		 486 aa  110  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.267716 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3412  TAP domain protein  30.53 
 
 		 766 aa  110  9.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05429  conserved hypothetical protein  36.77 
 
 		 600 aa  107  6e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00467317  normal  0.0133715 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3059  hypothetical protein  27.02 
 
 		 459 aa  107  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6090  TAP domain-containing protein  29.45 
 
 		 508 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4882  TAP domain-containing protein  25.73 
 
 		 493 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0722  alpha/beta fold family hydrolase  31.68 
 
 		 480 aa  101  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>