169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1042 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1042  TAP domain-containing protein  100 
 
 
535 aa  1059    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0225624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1966  hypothetical protein  56.95 
 
 
530 aa  557  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52219  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3369  TAP domain protein  49.37 
 
 
547 aa  422  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0557447  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0750  putative secreted peptidase  46.78 
 
 
521 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2212  TAP domain-containing protein  43.8 
 
 
520 aa  385  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.544179  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3616  TAP domain protein  46.23 
 
 
546 aa  369  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.812667  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3329  tripeptidyl-peptidase B  36.92 
 
 
533 aa  244  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224727  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3391  tripeptidyl-peptidase B  36.92 
 
 
508 aa  243  5e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3340  tripeptidyl-peptidase B  36.92 
 
 
508 aa  243  5e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478437  normal  0.109915 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3330  tripeptidyl-peptidase B  34.88 
 
 
511 aa  239  8e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3392  tripeptidyl-peptidase B  34.88 
 
 
511 aa  239  8e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3341  tripeptidyl-peptidase B  34.88 
 
 
511 aa  239  8e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175683  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0481  TAP domain protein  37.64 
 
 
539 aa  234  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.223264  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2904  TAP domain-containing protein  34.43 
 
 
495 aa  234  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411145  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7303  hypothetical protein  37.28 
 
 
532 aa  233  6e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3345  TAP domain-containing protein  35.31 
 
 
532 aa  231  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0319674  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2780  tripeptidyl-peptidase B  33.77 
 
 
500 aa  231  3e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834234  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4973  TAP domain protein  37.58 
 
 
522 aa  231  3e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39691  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12253  exported protease  33.86 
 
 
520 aa  231  3e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.499354  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4537  TAP domain protein  36.05 
 
 
506 aa  231  4e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0907  TAP domain protein  36.92 
 
 
521 aa  229  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2906  alpha/beta hydrolase fold  37.39 
 
 
505 aa  228  3e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.834545 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3464  TAP domain-containing protein  37.12 
 
 
527 aa  227  3e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.660985  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1183  TAP domain-containing protein  34.68 
 
 
495 aa  224  4e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4956  TAP domain protein  34.79 
 
 
507 aa  220  6e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.30314 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07410  alpha/beta hydrolase family protein  34.07 
 
 
525 aa  217  4e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0841  TAP domain protein  31.48 
 
 
521 aa  217  5e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127306 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3599  TAP domain-containing protein  36.5 
 
 
505 aa  216  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3600  TAP domain-containing protein  33.66 
 
 
516 aa  216  7e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.601455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7044  hypothetical protein  32.94 
 
 
522 aa  216  9e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393484  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0663  TAP domain protein  33.93 
 
 
525 aa  215  9.999999999999999e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419459  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4710  TAP domain protein  36.85 
 
 
504 aa  216  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2192  TAP domain protein  31.89 
 
 
518 aa  214  2.9999999999999995e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2523  TAP domain protein  33.47 
 
 
564 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3316  TAP domain protein  39.26 
 
 
484 aa  213  4.9999999999999996e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0266981  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12252  exported protease  34.37 
 
 
520 aa  213  9e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.212366  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9211  hypothetical protein  35.61 
 
 
485 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4414  hypothetical protein  34.69 
 
 
505 aa  211  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.694835  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1723  TAP domain protein  36.14 
 
 
536 aa  206  9e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00370292  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0491  TAP domain protein  35.95 
 
 
515 aa  205  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4117  TAP domain-containing protein  35.35 
 
 
556 aa  205  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0715  TAP domain-containing protein  31.64 
 
 
524 aa  202  9e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32570  alpha/beta hydrolase family protein  30.87 
 
 
541 aa  202  9e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3160  TAP domain protein  33.92 
 
 
527 aa  202  9.999999999999999e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4728  TAP domain-containing protein  34.51 
 
 
506 aa  202  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25020  alpha/beta hydrolase family protein  33.77 
 
 
542 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0577  TAP domain protein  33.91 
 
 
508 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2767  TAP domain-containing protein  31.95 
 
 
546 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8392  TAP domain protein  33.7 
 
 
537 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258609  normal  0.179275 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0881  TAP domain protein  31.29 
 
 
545 aa  197  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.478786  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1488  TAP domain-containing protein  33.98 
 
 
522 aa  196  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026814 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24850  alpha/beta hydrolase family protein  32.74 
 
 
515 aa  195  1e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6096  TAP domain protein  36.17 
 
 
557 aa  196  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3267  TAP domain protein  32.41 
 
 
538 aa  195  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000317549  decreased coverage  0.0000157542 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0066  tripeptidyl-peptidase B  33.47 
 
 
540 aa  195  2e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.974168 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2839  TAP domain protein  32.01 
 
 
517 aa  195  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350131  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6097  TAP domain protein  34.53 
 
 
559 aa  195  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0388  TAP domain-containing protein  33.85 
 
 
521 aa  189  9e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1545  TAP domain-containing protein  31.14 
 
 
542 aa  189  9e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2980  TAP domain protein  33.58 
 
 
557 aa  189  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.085257  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1310  TAP domain protein  34.06 
 
 
566 aa  187  4e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.330733  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1946  TAP domain protein  33.4 
 
 
518 aa  182  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0350254  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2416  TAP domain-containing protein  28.28 
 
 
505 aa  181  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000258971  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0356  TAP domain protein  33.11 
 
 
523 aa  181  2.9999999999999997e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4219  alpha/beta hydrolase fold protein  33.12 
 
 
486 aa  172  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0185  TAP domain protein  31.69 
 
 
551 aa  171  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.696189  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2656  TAP domain protein  32.24 
 
 
535 aa  171  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0201051  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1065  TAP domain protein  29.92 
 
 
544 aa  169  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0464  TAP domain-containing protein  29.76 
 
 
499 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000978752 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02580  alpha/beta hydrolase family protein  32.8 
 
 
623 aa  167  2.9999999999999998e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.978734  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6275  TAP domain-containing protein  29.49 
 
 
476 aa  166  9e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2729  TAP domain protein  29.66 
 
 
515 aa  165  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196617  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2687  TAP domain protein  30.36 
 
 
643 aa  163  7e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589968  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5024  TAP domain protein  32.13 
 
 
571 aa  163  9e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412323  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7397  TAP domain-containing protein  28.65 
 
 
613 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312183  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6091  TAP domain-containing protein  27.66 
 
 
504 aa  160  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0438  TAP domain protein  32.36 
 
 
542 aa  161  4e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.574551  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4357  TAP domain-containing protein  29.46 
 
 
504 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619924  normal  0.129935 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0472  alpha/beta hydrolase fold protein  38.46 
 
 
525 aa  154  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2970  TAP domain protein  29.88 
 
 
542 aa  154  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32712  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0644  hypothetical protein  26.57 
 
 
597 aa  152  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6093  TAP domain-containing protein  28.6 
 
 
505 aa  145  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0220  TAP domain protein  42.56 
 
 
551 aa  144  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712779 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5935  TAP domain protein  31.08 
 
 
518 aa  144  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235476  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2785  TAP domain protein  31.38 
 
 
480 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000127217  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11121  conserved hypothetical protein  28.6 
 
 
555 aa  140  6e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0230414 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2331  putative protease  41.56 
 
 
300 aa  138  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3994  TAP domain protein  32.09 
 
 
557 aa  135  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3257  TAP domain-containing protein  28.86 
 
 
499 aa  134  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.590122  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2276  putative protease  30.46 
 
 
524 aa  130  4.0000000000000003e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.494839 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1652  hypothetical protein  25.56 
 
 
494 aa  127  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.916188  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2442  TAP domain protein  38.17 
 
 
597 aa  125  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000431609  normal  0.057711 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6092  TAP domain-containing protein  27.46 
 
 
478 aa  124  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4882  TAP domain-containing protein  27.87 
 
 
493 aa  119  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2254  TAP domain-containing protein  28.79 
 
 
486 aa  119  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.267716 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3412  TAP domain protein  37.05 
 
 
766 aa  117  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6090  TAP domain-containing protein  27.89 
 
 
508 aa  117  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3059  hypothetical protein  28.27 
 
 
459 aa  117  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  27.55 
 
 
750 aa  113  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0998  alpha/beta hydrolase fold protein  29.35 
 
 
675 aa  100  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>