122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6096 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6096  TAP domain protein  100 
 
 		 557 aa  1122    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6097  TAP domain protein  63.69 
 
 		 559 aa  614  9.999999999999999e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2839  TAP domain protein  46.17 
 
 		 517 aa  390  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350131  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1310  TAP domain protein  43.35 
 
 		 566 aa  353  5.9999999999999994e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.330733  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1042  TAP domain-containing protein  36.38 
 
 		 535 aa  221  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0225624 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0481  TAP domain protein  33.13 
 
 		 539 aa  216  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.223264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1966  hypothetical protein  34.03 
 
 		 530 aa  200  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3369  TAP domain protein  35.67 
 
 		 547 aa  199  9e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0557447  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4728  TAP domain-containing protein  32.09 
 
 		 506 aa  195  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7303  hypothetical protein  31.86 
 
 		 532 aa  180  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3316  TAP domain protein  33.96 
 
 		 484 aa  177  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0266981  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4414  hypothetical protein  32.38 
 
 		 505 aa  177  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.694835  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2212  TAP domain-containing protein  32.87 
 
 		 520 aa  172  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.544179  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02580  alpha/beta hydrolase family protein  29.27 
 
 		 623 aa  171  2e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.978734  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0841  TAP domain protein  30.27 
 
 		 521 aa  171  4e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127306 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3345  TAP domain-containing protein  29.92 
 
 		 532 aa  171  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0319674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0750  putative secreted peptidase  31.77 
 
 		 521 aa  169  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3616  TAP domain protein  30.28 
 
 		 546 aa  168  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.812667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4710  TAP domain protein  30 
 
 		 504 aa  168  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0663  TAP domain protein  30.47 
 
 		 525 aa  167  5e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32570  alpha/beta hydrolase family protein  29.75 
 
 		 541 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25020  alpha/beta hydrolase family protein  29.61 
 
 		 542 aa  164  4.0000000000000004e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4117  TAP domain-containing protein  29.13 
 
 		 556 aa  161  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4973  TAP domain protein  32.99 
 
 		 522 aa  160  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39691  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1723  TAP domain protein  33.13 
 
 		 536 aa  159  9e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00370292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2192  TAP domain protein  28.48 
 
 		 518 aa  158  3e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3464  TAP domain-containing protein  31.67 
 
 		 527 aa  156  8e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.660985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2904  TAP domain-containing protein  31.31 
 
 		 495 aa  156  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411145  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1183  TAP domain-containing protein  30.08 
 
 		 495 aa  155  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3994  TAP domain protein  32.7 
 
 		 557 aa  154  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4956  TAP domain protein  30.11 
 
 		 507 aa  153  8e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.30314 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3330  tripeptidyl-peptidase B  29.39 
 
 		 511 aa  153  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3392  tripeptidyl-peptidase B  29.39 
 
 		 511 aa  153  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3341  tripeptidyl-peptidase B  29.39 
 
 		 511 aa  153  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175683  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2780  tripeptidyl-peptidase B  31.71 
 
 		 500 aa  151  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834234  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0715  TAP domain-containing protein  28.02 
 
 		 524 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3600  TAP domain-containing protein  30.46 
 
 		 516 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601455 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0577  TAP domain protein  29.09 
 
 		 508 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0907  TAP domain protein  29.81 
 
 		 521 aa  149  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0356  TAP domain protein  30.69 
 
 		 523 aa  148  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3160  TAP domain protein  29.14 
 
 		 527 aa  147  6e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0881  TAP domain protein  28.77 
 
 		 545 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.478786  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0388  TAP domain-containing protein  31.08 
 
 		 521 aa  145  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07410  alpha/beta hydrolase family protein  28.77 
 
 		 525 aa  143  6e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2767  TAP domain-containing protein  28.77 
 
 		 546 aa  143  8e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7044  hypothetical protein  29.39 
 
 		 522 aa  141  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0491  TAP domain protein  30.08 
 
 		 515 aa  140  3.9999999999999997e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6275  TAP domain-containing protein  29.08 
 
 		 476 aa  138  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4537  TAP domain protein  28.19 
 
 		 506 aa  137  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0464  TAP domain-containing protein  27.95 
 
 		 499 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000978752 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7397  TAP domain-containing protein  25.05 
 
 		 613 aa  134  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0066  tripeptidyl-peptidase B  28.16 
 
 		 540 aa  133  9e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.974168 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3267  TAP domain protein  27.89 
 
 		 538 aa  131  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000317549  decreased coverage  0.0000157542 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24850  alpha/beta hydrolase family protein  27.62 
 
 		 515 aa  131  4.0000000000000003e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1545  TAP domain-containing protein  29.02 
 
 		 542 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1488  TAP domain-containing protein  27.93 
 
 		 522 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00026814 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1946  TAP domain protein  29.86 
 
 		 518 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0350254  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12253  exported protease  28.46 
 
 		 520 aa  128  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.499354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2523  TAP domain protein  28.65 
 
 		 564 aa  125  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2687  TAP domain protein  26.45 
 
 		 643 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3329  tripeptidyl-peptidase B  29.79 
 
 		 533 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224727  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3391  tripeptidyl-peptidase B  29.79 
 
 		 508 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3340  tripeptidyl-peptidase B  29.79 
 
 		 508 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478437  normal  0.109915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8392  TAP domain protein  27.42 
 
 		 537 aa  118  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258609  normal  0.179275 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9211  hypothetical protein  29.85 
 
 		 485 aa  118  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4219  alpha/beta hydrolase fold protein  27.19 
 
 		 486 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0472  alpha/beta hydrolase fold protein  28.28 
 
 		 525 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2970  TAP domain protein  26.89 
 
 		 542 aa  111  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32712  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2729  TAP domain protein  27.48 
 
 		 515 aa  110  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196617  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1065  TAP domain protein  24.14 
 
 		 544 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6093  TAP domain-containing protein  26.02 
 
 		 505 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2906  alpha/beta hydrolase fold  30.29 
 
 		 505 aa  108  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.834545 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12252  exported protease  27.11 
 
 		 520 aa  106  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.212366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2416  TAP domain-containing protein  27.06 
 
 		 505 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000258971  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0185  TAP domain protein  26.17 
 
 		 551 aa  106  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.696189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0644  hypothetical protein  24.72 
 
 		 597 aa  105  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2785  TAP domain protein  28.69 
 
 		 480 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000127217  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24000  alpha/beta hydrolase family protein  26.55 
 
 		 514 aa  104  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0638812 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2656  TAP domain protein  27.25 
 
 		 535 aa  103  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0201051  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4357  TAP domain-containing protein  25.26 
 
 		 504 aa  101  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619924  normal  0.129935 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0438  TAP domain protein  29.62 
 
 		 542 aa  99.8  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.574551  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6091  TAP domain-containing protein  22.82 
 
 		 504 aa  99  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3257  TAP domain-containing protein  24.84 
 
 		 499 aa  96.3  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.590122  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2980  TAP domain protein  29.07 
 
 		 557 aa  91.3  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.085257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5024  TAP domain protein  37.06 
 
 		 571 aa  91.3  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412323  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3412  TAP domain protein  30 
 
 		 766 aa  90.9  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3059  hypothetical protein  26.14 
 
 		 459 aa  90.5  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3599  TAP domain-containing protein  27.58 
 
 		 505 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2276  putative protease  26.79 
 
 		 524 aa  87  7e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.494839 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0220  TAP domain protein  33.76 
 
 		 551 aa  85.5  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712779 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1652  hypothetical protein  24.39 
 
 		 494 aa  84.3  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.916188  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11121  conserved hypothetical protein  23.27 
 
 		 555 aa  83.2  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0230414 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3650  TAP domain-containing protein  25.25 
 
 		 475 aa  83.2  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0804319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5935  TAP domain protein  35.19 
 
 		 518 aa  80.5  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235476  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6090  TAP domain-containing protein  23.53 
 
 		 508 aa  77  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1577  TAP domain protein  26.13 
 
 		 514 aa  75.1  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2254  TAP domain-containing protein  24.65 
 
 		 486 aa  73.9  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.267716 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6092  TAP domain-containing protein  28.77 
 
 		 478 aa  71.6  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2442  TAP domain protein  34.43 
 
 		 597 aa  70.1  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000431609  normal  0.057711 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2331  putative protease  32.26 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>