268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0057 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4460  TAP domain-containing protein  62.72 
 
 		 533 aa  666    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.726615 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4190  TAP domain-containing protein  65.36 
 
 		 519 aa  657    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0071  alpha/beta fold family hydrolase  71.94 
 
 		 539 aa  816    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0076  TAP domain-containing protein  78.92 
 
 		 549 aa  915    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4864  TAP domain-containing protein  65.87 
 
 		 527 aa  662    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0074  TAP domain-containing protein  72.26 
 
 		 535 aa  817    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.523955 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0072  TAP domain-containing protein  72.23 
 
 		 535 aa  827    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3977  TAP domain-containing protein  60.59 
 
 		 532 aa  645    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.692071  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0076  TAP domain-containing protein  72.56 
 
 		 539 aa  832    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000458817 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0073  TAP domain protein  79.46 
 
 		 545 aa  924    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4278  TAP domain-containing protein  79.24 
 
 		 540 aa  915    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0071  TAP domain-containing protein  79.67 
 
 		 538 aa  918    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3780  TAP domain-containing protein  61.79 
 
 		 517 aa  637    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0057  TAP domain-containing protein  100 
 
 		 546 aa  1142    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0068  peptidase S33, prolyl aminopeptidase  59.83 
 
 		 521 aa  616  1e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3575  alpha/beta fold family hydrolase  58.42 
 
 		 507 aa  592  1e-168  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0722  alpha/beta fold family hydrolase  35.96 
 
 		 480 aa  325  1e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02798  cysteine proteinase  33.41 
 
 		 533 aa  225  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3874  TAP domain protein  30.67 
 
 		 508 aa  214  3.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1447  TAP domain-containing protein  31.58 
 
 		 511 aa  211  2e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1502  proteinase  31.74 
 
 		 513 aa  210  4e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3801  cysteine proteinase  32.33 
 
 		 502 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184346 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2826  TAP domain-containing protein  28.67 
 
 		 688 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000578424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0270  TAP domain-containing protein  31.68 
 
 		 670 aa  185  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.948991  hitchhiker  0.000175368 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2538  TAP domain-containing protein  29.28 
 
 		 693 aa  184  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112565 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0265  TAP domain-containing protein  30.97 
 
 		 669 aa  182  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0441544  normal  0.0338675 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0123  TAP domain protein  32.67 
 
 		 656 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2103  alpha/beta hydrolase fold  25.97 
 
 		 645 aa  131  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418615  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3206  TAP domain-containing protein  25.82 
 
 		 475 aa  129  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0079  TAP domain-containing protein  24.88 
 
 		 485 aa  127  7e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2145  alpha/beta hydrolase fold protein  25.78 
 
 		 477 aa  117  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2436  alpha/beta hydrolase fold protein  24.22 
 
 		 484 aa  115  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.425173  normal  0.0661487 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0663  TAP domain protein  26.54 
 
 		 525 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6275  TAP domain-containing protein  26.62 
 
 		 476 aa  111  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3329  tripeptidyl-peptidase B  27.4 
 
 		 533 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224727  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3391  tripeptidyl-peptidase B  27.4 
 
 		 508 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3340  tripeptidyl-peptidase B  27.4 
 
 		 508 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478437  normal  0.109915 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1183  TAP domain-containing protein  25.06 
 
 		 495 aa  110  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4546  beta-lactamase  30 
 
 		 740 aa  110  8.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0118  alpha/beta hydrolase fold  25.74 
 
 		 503 aa  110  9.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742968  normal  0.120342 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12253  exported protease  26.83 
 
 		 520 aa  107  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.499354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0998  alpha/beta hydrolase fold protein  23.93 
 
 		 675 aa  107  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2979  alpha/beta hydrolase fold protein  22.72 
 
 		 480 aa  107  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.171473 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24850  alpha/beta hydrolase family protein  26.04 
 
 		 515 aa  106  9e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3647  alpha/beta fold family hydrolase  24.51 
 
 		 680 aa  105  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7044  hypothetical protein  25.45 
 
 		 522 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2904  TAP domain-containing protein  26.12 
 
 		 495 aa  103  8e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411145  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2906  alpha/beta hydrolase fold  26.46 
 
 		 505 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.834545 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3330  tripeptidyl-peptidase B  25.11 
 
 		 511 aa  101  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3392  tripeptidyl-peptidase B  25.11 
 
 		 511 aa  101  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3341  tripeptidyl-peptidase B  25.11 
 
 		 511 aa  101  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175683  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0577  TAP domain protein  25.3 
 
 		 508 aa  100  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3351  alpha/beta hydrolase fold protein  23.48 
 
 		 489 aa  99.8  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172382  normal  0.0371725 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2780  tripeptidyl-peptidase B  25.88 
 
 		 500 aa  99  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834234  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0464  TAP domain-containing protein  27.52 
 
 		 499 aa  97.1  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000978752 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3599  TAP domain-containing protein  29.15 
 
 		 505 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0147  alpha/beta fold family hydrolase  24.27 
 
 		 668 aa  94.7  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.557879  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0715  TAP domain-containing protein  23.91 
 
 		 524 aa  95.1  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4956  TAP domain protein  24.64 
 
 		 507 aa  94  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.30314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0881  TAP domain protein  33.17 
 
 		 545 aa  93.6  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.478786  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0388  TAP domain-containing protein  23.88 
 
 		 521 aa  93.6  9e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1652  hypothetical protein  30.09 
 
 		 494 aa  92  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.916188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2192  TAP domain protein  23.53 
 
 		 518 aa  91.7  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2767  TAP domain-containing protein  28.25 
 
 		 546 aa  91.7  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0356  TAP domain protein  22.54 
 
 		 523 aa  90.9  6e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2254  TAP domain-containing protein  24.77 
 
 		 486 aa  89  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.267716 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2523  TAP domain protein  24.67 
 
 		 564 aa  87.8  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3600  TAP domain-containing protein  26.23 
 
 		 516 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601455 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0841  TAP domain protein  23.6 
 
 		 521 aa  87  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127306 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3464  TAP domain-containing protein  28.44 
 
 		 527 aa  87  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.660985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2970  TAP domain protein  21.74 
 
 		 542 aa  86.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32712  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0491  TAP domain protein  23.09 
 
 		 515 aa  86.3  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2416  TAP domain-containing protein  29.15 
 
 		 505 aa  85.9  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000258971  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6091  TAP domain-containing protein  25.66 
 
 		 504 aa  85.9  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9211  hypothetical protein  25.48 
 
 		 485 aa  85.9  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6093  TAP domain-containing protein  28.31 
 
 		 505 aa  85.5  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0907  TAP domain protein  27.16 
 
 		 521 aa  84  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0066  tripeptidyl-peptidase B  24.1 
 
 		 540 aa  83.6  0.000000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.974168 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5024  TAP domain protein  25.27 
 
 		 571 aa  83.2  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412323  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2321  TAP domain-containing protein  22.22 
 
 		 612 aa  83.6  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279811  normal  0.349466 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4117  TAP domain-containing protein  28.8 
 
 		 556 aa  82.4  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25020  alpha/beta hydrolase family protein  25.53 
 
 		 542 aa  82.4  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1545  TAP domain-containing protein  25.85 
 
 		 542 aa  82  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1042  TAP domain-containing protein  27.71 
 
 		 535 aa  81.3  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0225624 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2729  TAP domain protein  24.38 
 
 		 515 aa  81.3  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196617  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4537  TAP domain protein  23.04 
 
 		 506 aa  80.5  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07410  alpha/beta hydrolase family protein  25.12 
 
 		 525 aa  80.1  0.00000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4710  TAP domain protein  26.38 
 
 		 504 aa  80.1  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3267  TAP domain protein  28.88 
 
 		 538 aa  79.3  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000317549  decreased coverage  0.0000157542 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3345  TAP domain-containing protein  23 
 
 		 532 aa  79.3  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0319674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3160  TAP domain protein  32.65 
 
 		 527 aa  78.6  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1488  TAP domain-containing protein  25.68 
 
 		 522 aa  78.6  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00026814 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2331  putative protease  27.43 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8392  TAP domain protein  25.61 
 
 		 537 aa  77.8  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258609  normal  0.179275 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2980  TAP domain protein  21.91 
 
 		 557 aa  77.8  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.085257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4728  TAP domain-containing protein  27.22 
 
 		 506 aa  77.8  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3369  TAP domain protein  24.56 
 
 		 547 aa  77  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0557447  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4357  TAP domain-containing protein  24.32 
 
 		 504 aa  76.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619924  normal  0.129935 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32570  alpha/beta hydrolase family protein  23.93 
 
 		 541 aa  76.6  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  25.42 
 
 		 750 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.689132 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>