193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4864 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0071  alpha/beta fold family hydrolase  62.91 
 
 		 539 aa  662    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0074  TAP domain-containing protein  65.4 
 
 		 535 aa  662    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.523955 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0072  TAP domain-containing protein  64.18 
 
 		 535 aa  660    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0076  TAP domain-containing protein  62.53 
 
 		 539 aa  661    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000458817 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4278  TAP domain-containing protein  66.67 
 
 		 540 aa  665    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3780  TAP domain-containing protein  65.42 
 
 		 517 aa  670    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0057  TAP domain-containing protein  63.92 
 
 		 546 aa  664    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0071  TAP domain-containing protein  66.31 
 
 		 538 aa  665    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4460  TAP domain-containing protein  72.67 
 
 		 533 aa  781    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.726615 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4190  TAP domain-containing protein  67.75 
 
 		 519 aa  719    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0076  TAP domain-containing protein  66.74 
 
 		 549 aa  663    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4864  TAP domain-containing protein  100 
 
 		 527 aa  1098    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0073  TAP domain protein  66.09 
 
 		 545 aa  667    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3977  TAP domain-containing protein  61.64 
 
 		 532 aa  609  1e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.692071  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0068  peptidase S33, prolyl aminopeptidase  58.96 
 
 		 521 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3575  alpha/beta fold family hydrolase  55.38 
 
 		 507 aa  556  1e-157  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0722  alpha/beta fold family hydrolase  36.66 
 
 		 480 aa  333  5e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3874  TAP domain protein  33.26 
 
 		 508 aa  231  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02798  cysteine proteinase  34.4 
 
 		 533 aa  226  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1502  proteinase  32.45 
 
 		 513 aa  219  1e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1447  TAP domain-containing protein  32.07 
 
 		 511 aa  215  9.999999999999999e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3801  cysteine proteinase  32.22 
 
 		 502 aa  210  6e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184346 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2826  TAP domain-containing protein  27.52 
 
 		 688 aa  193  7e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000578424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2538  TAP domain-containing protein  28.1 
 
 		 693 aa  192  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112565 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0270  TAP domain-containing protein  28.3 
 
 		 670 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.948991  hitchhiker  0.000175368 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0265  TAP domain-containing protein  27.87 
 
 		 669 aa  176  9e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0441544  normal  0.0338675 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2103  alpha/beta hydrolase fold  25.83 
 
 		 645 aa  140  4.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418615  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0079  TAP domain-containing protein  26.42 
 
 		 485 aa  136  9e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0123  TAP domain protein  32.17 
 
 		 656 aa  126  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3206  TAP domain-containing protein  24.74 
 
 		 475 aa  121  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3647  alpha/beta fold family hydrolase  25.87 
 
 		 680 aa  114  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0147  alpha/beta fold family hydrolase  25.47 
 
 		 668 aa  111  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.557879  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4546  beta-lactamase  28.46 
 
 		 740 aa  107  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2436  alpha/beta hydrolase fold protein  24.18 
 
 		 484 aa  107  8e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.425173  normal  0.0661487 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1183  TAP domain-containing protein  23.86 
 
 		 495 aa  104  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2904  TAP domain-containing protein  24.17 
 
 		 495 aa  103  9e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411145  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12253  exported protease  23.26 
 
 		 520 aa  102  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.499354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24850  alpha/beta hydrolase family protein  23.98 
 
 		 515 aa  101  3e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0998  alpha/beta hydrolase fold protein  25.28 
 
 		 675 aa  100  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3351  alpha/beta hydrolase fold protein  23.28 
 
 		 489 aa  100  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172382  normal  0.0371725 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7044  hypothetical protein  22.51 
 
 		 522 aa  100  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6275  TAP domain-containing protein  24.19 
 
 		 476 aa  100  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3600  TAP domain-containing protein  24.89 
 
 		 516 aa  98.6  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601455 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2780  tripeptidyl-peptidase B  24.35 
 
 		 500 aa  97.1  7e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834234  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2321  TAP domain-containing protein  24.32 
 
 		 612 aa  94.7  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279811  normal  0.349466 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4956  TAP domain protein  24.32 
 
 		 507 aa  92.8  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.30314 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0577  TAP domain protein  26.38 
 
 		 508 aa  92.4  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1652  hypothetical protein  27.43 
 
 		 494 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.916188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07410  alpha/beta hydrolase family protein  24.52 
 
 		 525 aa  89.7  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0663  TAP domain protein  23.18 
 
 		 525 aa  89.7  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2979  alpha/beta hydrolase fold protein  21.51 
 
 		 480 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.171473 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0118  alpha/beta hydrolase fold  24.44 
 
 		 503 aa  89  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742968  normal  0.120342 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2767  TAP domain-containing protein  23.19 
 
 		 546 aa  88.2  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3330  tripeptidyl-peptidase B  23.75 
 
 		 511 aa  87.8  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3392  tripeptidyl-peptidase B  23.75 
 
 		 511 aa  87.8  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3341  tripeptidyl-peptidase B  23.75 
 
 		 511 aa  87.8  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175683  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0715  TAP domain-containing protein  23.57 
 
 		 524 aa  86.7  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0464  TAP domain-containing protein  22.8 
 
 		 499 aa  86.3  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000978752 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3329  tripeptidyl-peptidase B  23.47 
 
 		 533 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224727  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3391  tripeptidyl-peptidase B  23.47 
 
 		 508 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3340  tripeptidyl-peptidase B  23.47 
 
 		 508 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478437  normal  0.109915 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2416  TAP domain-containing protein  25.37 
 
 		 505 aa  85.5  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000258971  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2192  TAP domain protein  22.35 
 
 		 518 aa  85.1  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2145  alpha/beta hydrolase fold protein  20.62 
 
 		 477 aa  85.1  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2254  TAP domain-containing protein  23.64 
 
 		 486 aa  84.3  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.267716 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2980  TAP domain protein  27.27 
 
 		 557 aa  84.7  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.085257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25020  alpha/beta hydrolase family protein  26.34 
 
 		 542 aa  84.7  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6091  TAP domain-containing protein  25.84 
 
 		 504 aa  83.2  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3650  TAP domain-containing protein  27.78 
 
 		 475 aa  83.2  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0804319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2906  alpha/beta hydrolase fold  26.01 
 
 		 505 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.834545 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2970  TAP domain protein  22.98 
 
 		 542 aa  82  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32712  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4537  TAP domain protein  23.88 
 
 		 506 aa  80.9  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3599  TAP domain-containing protein  26.46 
 
 		 505 aa  80.1  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4728  TAP domain-containing protein  22.69 
 
 		 506 aa  80.1  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3160  TAP domain protein  23.58 
 
 		 527 aa  79.7  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0881  TAP domain protein  29.47 
 
 		 545 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.478786  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0388  TAP domain-containing protein  21.79 
 
 		 521 aa  79.3  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0491  TAP domain protein  23.36 
 
 		 515 aa  79.3  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32570  alpha/beta hydrolase family protein  24.1 
 
 		 541 aa  78.2  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2523  TAP domain protein  23.8 
 
 		 564 aa  77.4  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7303  hypothetical protein  30.9 
 
 		 532 aa  76.6  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  24.68 
 
 		 750 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0907  TAP domain protein  26.79 
 
 		 521 aa  75.1  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3369  TAP domain protein  23.31 
 
 		 547 aa  75.5  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0557447  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0356  TAP domain protein  22.54 
 
 		 523 aa  75.1  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4117  TAP domain-containing protein  26.4 
 
 		 556 aa  74.7  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0841  TAP domain protein  22.24 
 
 		 521 aa  74.3  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127306 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4357  TAP domain-containing protein  23.3 
 
 		 504 aa  73.9  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619924  normal  0.129935 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2729  TAP domain protein  25 
 
 		 515 aa  73.9  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196617  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3464  TAP domain-containing protein  26.22 
 
 		 527 aa  73.6  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.660985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6093  TAP domain-containing protein  25.33 
 
 		 505 aa  73.2  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2687  TAP domain protein  26.37 
 
 		 643 aa  72.8  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0472  alpha/beta hydrolase fold protein  25.24 
 
 		 525 aa  72.8  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5024  TAP domain protein  23.5 
 
 		 571 aa  71.2  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412323  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2955  alpha/beta hydrolase fold  26.05 
 
 		 431 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8392  TAP domain protein  21.76 
 
 		 537 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258609  normal  0.179275 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3267  TAP domain protein  24.68 
 
 		 538 aa  68.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000317549  decreased coverage  0.0000157542 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0066  tripeptidyl-peptidase B  23 
 
 		 540 aa  69.3  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.974168 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2750  TAP domain-containing protein  23.39 
 
 		 490 aa  67.8  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.51195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2331  putative protease  24.69 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>