136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2955 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3055  proline iminopeptidase  74.12 
 
 		 424 aa  670    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2227  alpha/beta hydrolase fold  70.07 
 
 		 429 aa  643    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1434  prolyl aminopeptidase 2  74.94 
 
 		 429 aa  690    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1499  prolyl aminopeptidase 2  74.71 
 
 		 429 aa  689    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1492  prolyl aminopeptidase 2  73.55 
 
 		 429 aa  679    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2735  alpha/beta hydrolase fold  74.48 
 
 		 429 aa  676    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2270  alpha/beta hydrolase fold  76.71 
 
 		 429 aa  678    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.201892 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2429  alpha/beta hydrolase fold  74.01 
 
 		 429 aa  672    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2752  alpha/beta hydrolase fold  74.48 
 
 		 429 aa  675    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1661  alpha/beta hydrolase fold  83.29 
 
 		 429 aa  755    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.485679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1634  alpha/beta hydrolase fold  76.81 
 
 		 433 aa  691    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.16021  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2828  alpha/beta hydrolase fold  74.48 
 
 		 429 aa  677    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0236539 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2955  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 431 aa  899    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1624  alpha/beta hydrolase fold protein  74.71 
 
 		 429 aa  677    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.610603  normal  0.321544 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1410  alpha/beta hydrolase fold  69.37 
 
 		 454 aa  628  1e-179  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2143  alpha/beta hydrolase fold  64.32 
 
 		 439 aa  566  1e-160  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001130  putative prolyl aminopeptidase  54.68 
 
 		 431 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.047339  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3689  putative prolyl aminopeptidase  45.58 
 
 		 430 aa  372  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.798401  normal  0.360636 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2072  alpha/beta hydrolase fold  45.84 
 
 		 463 aa  367  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.612042  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2021  putative proline iminopeptidase  44.47 
 
 		 419 aa  365  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.198655 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7145  alpha/beta hydrolase fold protein  43.84 
 
 		 423 aa  365  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152071 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0398  alpha/beta hydrolase fold protein  43.6 
 
 		 428 aa  359  4e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.167053  normal  0.0238108 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1813  alpha/beta hydrolase fold protein  45 
 
 		 439 aa  355  7.999999999999999e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000430652 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3642  alpha/beta hydrolase fold protein  42.92 
 
 		 412 aa  347  2e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4559  prolyl aminopeptidase 2  41.79 
 
 		 421 aa  338  9e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.371108  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6521  alpha/beta hydrolase fold protein  39.63 
 
 		 432 aa  334  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.17034 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2460  alpha/beta hydrolase fold  40.72 
 
 		 453 aa  328  1.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3903  alpha/beta hydrolase fold  43.91 
 
 		 426 aa  328  2.0000000000000001e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0642789 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06790  prolyl aminopeptidase 2  40.8 
 
 		 441 aa  311  1e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02092  Putative prolyl aminopeptidase Fragment (EC 3.4.11.5) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96VT1]  40.76 
 
 		 443 aa  306  4.0000000000000004e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.707401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05870  prolyl aminopeptidase 2  39.13 
 
 		 424 aa  302  8.000000000000001e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.208476  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11240  hypothetical protein with alpha/beta hydrolase fold  37.84 
 
 		 488 aa  291  1e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.163814  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4714  alpha/beta hydrolase fold protein  37.16 
 
 		 439 aa  282  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0134  alpha/beta hydrolase fold protein  37.59 
 
 		 420 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33188  predicted protein  37.23 
 
 		 510 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.860325  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0646  hydrolase, alpha/beta domain protein  34.89 
 
 		 460 aa  252  8.000000000000001e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.291247 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00350  prolyl aminopeptidase 2  35.49 
 
 		 443 aa  251  3e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.358137 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0669  putative hydrolse  35.75 
 
 		 447 aa  248  2e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.272037  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48996  prolyl aminopeptidase  34.9 
 
 		 478 aa  233  4.0000000000000004e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.750097  normal  0.224061 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47448  predicted protein  32.67 
 
 		 692 aa  187  4e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.445648  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4864  TAP domain-containing protein  26.05 
 
 		 527 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3780  TAP domain-containing protein  24.92 
 
 		 517 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0722  alpha/beta fold family hydrolase  31.74 
 
 		 480 aa  61.6  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0076  TAP domain-containing protein  29.68 
 
 		 539 aa  60.1  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000458817 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0057  TAP domain-containing protein  29.22 
 
 		 546 aa  60.1  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0071  alpha/beta fold family hydrolase  28.44 
 
 		 539 aa  58.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0072  TAP domain-containing protein  28.31 
 
 		 535 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4278  TAP domain-containing protein  30 
 
 		 540 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0073  TAP domain protein  30 
 
 		 545 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0074  TAP domain-containing protein  28.31 
 
 		 535 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.523955 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0076  TAP domain-containing protein  29.52 
 
 		 549 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1623  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4190  TAP domain-containing protein  29.05 
 
 		 519 aa  57.4  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0071  TAP domain-containing protein  29.52 
 
 		 538 aa  57  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2000  proline iminopeptidase  21.62 
 
 		 301 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118293  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0068  peptidase S33, prolyl aminopeptidase  27.17 
 
 		 521 aa  52.8  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0894  proline iminopeptidase  31.82 
 
 		 311 aa  52.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4357  TAP domain-containing protein  25 
 
 		 504 aa  52.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619924  normal  0.129935 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2262  proline iminopeptidase  33.85 
 
 		 335 aa  51.2  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.181325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1180  proline iminopeptidase  29.26 
 
 		 320 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270645  normal  0.812597 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3977  TAP domain-containing protein  30.77 
 
 		 532 aa  51.2  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.692071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2245  hydrolase, alpha/beta fold family  21.62 
 
 		 301 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1528899999999994e-27 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2466  prolyl aminopeptidase  39.13 
 
 		 346 aa  50.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.186961 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1033  proline iminopeptidase  30 
 
 		 320 aa  50.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2217  alpha/beta fold family hydrolase  21.62 
 
 		 303 aa  50.1  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.716655  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2061  alpha/beta fold family hydrolase  21.62 
 
 		 301 aa  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6091  TAP domain-containing protein  24.43 
 
 		 504 aa  50.1  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4460  TAP domain-containing protein  29.61 
 
 		 533 aa  50.1  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.726615 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2780  tripeptidyl-peptidase B  24 
 
 		 500 aa  49.7  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834234  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3575  alpha/beta fold family hydrolase  27.05 
 
 		 507 aa  49.7  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2329  hydrolase, alpha/beta fold family  26.49 
 
 		 291 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000968473  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3126  hydrolase, alpha/beta fold family  27.21 
 
 		 301 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.83373  normal  0.0124269 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3160  TAP domain protein  29.57 
 
 		 527 aa  48.9  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2001  proline iminopeptidase  27.7 
 
 		 301 aa  48.9  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000475333  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0375  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  29.71 
 
 		 323 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4027  prolyl aminopeptidase  32.06 
 
 		 318 aa  48.5  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0825  alpha/beta hydrolase fold protein  31.06 
 
 		 287 aa  48.9  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.135627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0208  proline iminopeptidase  27.98 
 
 		 316 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1352  proline iminopeptidase  31.72 
 
 		 312 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.800954 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2776  proline iminopeptidase  28.06 
 
 		 313 aa  48.5  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00879626  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1402  proline iminopeptidase  27.94 
 
 		 322 aa  48.5  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0193  alpha/beta hydrolase fold  33.62 
 
 		 305 aa  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.306421 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4916  proline iminopeptidase  33.86 
 
 		 312 aa  48.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0066  tripeptidyl-peptidase B  25.89 
 
 		 540 aa  47.8  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.974168 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5164  proline iminopeptidase  28.99 
 
 		 323 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3874  TAP domain protein  25.63 
 
 		 508 aa  47.4  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2199  hydrolase, alpha/beta fold family  28.33 
 
 		 291 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2581  proline iminopeptidase  28.87 
 
 		 328 aa  47.4  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0630978 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0431  proline iminopeptidase  30.25 
 
 		 318 aa  47.4  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1122  proline iminopeptidase  36.96 
 
 		 339 aa  47  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.29642  normal  0.0858208 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2835  proline iminopeptidase  32.59 
 
 		 337 aa  47  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32570  alpha/beta hydrolase family protein  29.35 
 
 		 541 aa  46.2  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4956  TAP domain protein  24.76 
 
 		 507 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.30314 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0771  proline iminopeptidase  31.82 
 
 		 320 aa  46.2  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.270138  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1183  TAP domain-containing protein  26.01 
 
 		 495 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07350  prolyl aminopeptidase  27.59 
 
 		 332 aa  46.2  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3345  TAP domain-containing protein  32.35 
 
 		 532 aa  46.2  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0319674  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2247  alpha/beta fold family hydrolase  26.5 
 
 		 291 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371226  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2191  prolyl aminopeptidase  29.52 
 
 		 321 aa  45.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.73475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7303  hypothetical protein  25.25 
 
 		 532 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>