65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2143 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_2143  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
439 aa  911    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22944  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1410  alpha/beta hydrolase fold  68.63 
 
 
454 aa  620  1e-176  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2227  alpha/beta hydrolase fold  66.98 
 
 
429 aa  599  1e-170  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1492  prolyl aminopeptidase 2  65.96 
 
 
429 aa  589  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2828  alpha/beta hydrolase fold  66.67 
 
 
429 aa  585  1e-166  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0236539 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3055  proline iminopeptidase  65.72 
 
 
424 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2735  alpha/beta hydrolase fold  66.19 
 
 
429 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2752  alpha/beta hydrolase fold  66.43 
 
 
429 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1624  alpha/beta hydrolase fold protein  65.96 
 
 
429 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.610603  normal  0.321544 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1434  prolyl aminopeptidase 2  65.48 
 
 
429 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1499  prolyl aminopeptidase 2  65.25 
 
 
429 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2429  alpha/beta hydrolase fold  65.57 
 
 
429 aa  580  1e-164  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1634  alpha/beta hydrolase fold  64.39 
 
 
433 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.16021  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2955  alpha/beta hydrolase fold  64.32 
 
 
431 aa  566  1e-160  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2270  alpha/beta hydrolase fold  66.91 
 
 
429 aa  565  1e-160  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.201892 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1661  alpha/beta hydrolase fold  64.15 
 
 
429 aa  567  1e-160  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.485679  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001130  putative prolyl aminopeptidase  51.84 
 
 
431 aa  444  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.047339  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3689  putative prolyl aminopeptidase  47.95 
 
 
430 aa  379  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.798401  normal  0.360636 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2072  alpha/beta hydrolase fold  45.39 
 
 
463 aa  377  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.612042  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2021  putative proline iminopeptidase  46.06 
 
 
419 aa  364  2e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.198655 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1813  alpha/beta hydrolase fold protein  47.34 
 
 
439 aa  358  9.999999999999999e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000430652 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7145  alpha/beta hydrolase fold protein  44.1 
 
 
423 aa  336  3.9999999999999995e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.152071 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0398  alpha/beta hydrolase fold protein  43.23 
 
 
428 aa  334  2e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.167053  normal  0.0238108 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3642  alpha/beta hydrolase fold protein  43.26 
 
 
412 aa  329  6e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4559  prolyl aminopeptidase 2  43.87 
 
 
421 aa  327  3e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.371108  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6521  alpha/beta hydrolase fold protein  41.13 
 
 
432 aa  327  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.17034 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2460  alpha/beta hydrolase fold  41.69 
 
 
453 aa  325  8.000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02092  Putative prolyl aminopeptidase Fragment (EC 3.4.11.5) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96VT1]  41.4 
 
 
443 aa  321  1.9999999999999998e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.707401  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11240  hypothetical protein with alpha/beta hydrolase fold  42.27 
 
 
488 aa  320  3e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.163814  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3903  alpha/beta hydrolase fold  44.15 
 
 
426 aa  319  6e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0642789 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06790  prolyl aminopeptidase 2  42.22 
 
 
441 aa  315  9e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4714  alpha/beta hydrolase fold protein  38.95 
 
 
439 aa  278  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05870  prolyl aminopeptidase 2  39.36 
 
 
424 aa  271  2e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.208476  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0646  hydrolase, alpha/beta domain protein  36.69 
 
 
460 aa  271  2e-71  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.291247 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0134  alpha/beta hydrolase fold protein  41.08 
 
 
420 aa  264  2e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33188  predicted protein  37.5 
 
 
510 aa  257  3e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.860325  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00350  prolyl aminopeptidase 2  38.55 
 
 
443 aa  254  3e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.358137 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0669  putative hydrolse  36.79 
 
 
447 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.272037  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48996  prolyl aminopeptidase  30.74 
 
 
478 aa  223  7e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.750097  normal  0.224061 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47448  predicted protein  32.52 
 
 
692 aa  197  4.0000000000000005e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.445648  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2000  proline iminopeptidase  28.21 
 
 
301 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118293  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3126  hydrolase, alpha/beta fold family  27.35 
 
 
301 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.83373  normal  0.0124269 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2329  hydrolase, alpha/beta fold family  22.14 
 
 
291 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000968473  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0722  alpha/beta fold family hydrolase  28.41 
 
 
480 aa  50.8  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1623  alpha/beta hydrolase fold  25.64 
 
 
291 aa  50.4  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2247  alpha/beta fold family hydrolase  25.64 
 
 
291 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371226  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2061  alpha/beta fold family hydrolase  27.35 
 
 
301 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2001  proline iminopeptidase  27.35 
 
 
301 aa  49.7  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000475333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2245  hydrolase, alpha/beta fold family  27.35 
 
 
301 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1528899999999994e-27 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2217  alpha/beta fold family hydrolase  27.35 
 
 
303 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.716655  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1133  putative hydrolase  30.83 
 
 
200 aa  48.5  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.146654  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2199  hydrolase, alpha/beta fold family  26.5 
 
 
291 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2466  prolyl aminopeptidase  40.58 
 
 
346 aa  47.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.186961 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2262  proline iminopeptidase  33.33 
 
 
335 aa  47.4  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.181325  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2042  alpha/beta hydrolase fold  24.79 
 
 
291 aa  46.6  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0068  peptidase S33, prolyl aminopeptidase  31.34 
 
 
521 aa  46.2  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07350  prolyl aminopeptidase  27.74 
 
 
332 aa  45.1  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2780  tripeptidyl-peptidase B  22.73 
 
 
500 aa  44.7  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834234  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0312  prolyl aminopeptidase  34.26 
 
 
301 aa  43.9  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.361295  normal  0.544281 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4916  proline iminopeptidase  30.59 
 
 
312 aa  43.9  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0317  prolyl aminopeptidase  35.19 
 
 
318 aa  43.9  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.463031  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3707  prolyl aminopeptidase  35.19 
 
 
301 aa  43.5  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.30287 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2011  proline iminopeptidase  32.35 
 
 
321 aa  43.5  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0118869  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0771  proline iminopeptidase  32.35 
 
 
320 aa  43.1  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.270138  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12478  proline iminopeptidase, putative  30.58 
 
 
306 aa  43.1  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>