168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3055 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3055  proline iminopeptidase  100 
 
 		 424 aa  884    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2227  alpha/beta hydrolase fold  72.81 
 
 		 429 aa  662    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1624  alpha/beta hydrolase fold protein  85.85 
 
 		 429 aa  773    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.610603  normal  0.321544 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1434  prolyl aminopeptidase 2  91.98 
 
 		 429 aa  818    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1499  prolyl aminopeptidase 2  91.51 
 
 		 429 aa  815    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1410  alpha/beta hydrolase fold  73.29 
 
 		 454 aa  670    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1492  prolyl aminopeptidase 2  91.51 
 
 		 429 aa  812    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2955  alpha/beta hydrolase fold  74.12 
 
 		 431 aa  670    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2735  alpha/beta hydrolase fold  86.08 
 
 		 429 aa  775    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2270  alpha/beta hydrolase fold  73.05 
 
 		 429 aa  651    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.201892 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2429  alpha/beta hydrolase fold  84.2 
 
 		 429 aa  763    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2752  alpha/beta hydrolase fold  86.32 
 
 		 429 aa  775    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1661  alpha/beta hydrolase fold  74.7 
 
 		 429 aa  678    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.485679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1634  alpha/beta hydrolase fold  72.34 
 
 		 433 aa  673    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.16021  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2828  alpha/beta hydrolase fold  86.32 
 
 		 429 aa  776    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0236539 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2143  alpha/beta hydrolase fold  65.72 
 
 		 439 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001130  putative prolyl aminopeptidase  55.18 
 
 		 431 aa  491  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.047339  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3689  putative prolyl aminopeptidase  46.81 
 
 		 430 aa  387  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.798401  normal  0.360636 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2072  alpha/beta hydrolase fold  46.32 
 
 		 463 aa  378  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.612042  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2021  putative proline iminopeptidase  45.48 
 
 		 419 aa  376  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.198655 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1813  alpha/beta hydrolase fold protein  45.48 
 
 		 439 aa  363  4e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000430652 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3642  alpha/beta hydrolase fold protein  43.74 
 
 		 412 aa  357  2.9999999999999997e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0398  alpha/beta hydrolase fold protein  43.12 
 
 		 428 aa  353  2.9999999999999997e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.167053  normal  0.0238108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7145  alpha/beta hydrolase fold protein  43.17 
 
 		 423 aa  350  4e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152071 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4559  prolyl aminopeptidase 2  43.58 
 
 		 421 aa  349  5e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.371108  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6521  alpha/beta hydrolase fold protein  41.53 
 
 		 432 aa  343  5e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.17034 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3903  alpha/beta hydrolase fold  45.15 
 
 		 426 aa  336  3.9999999999999995e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0642789 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2460  alpha/beta hydrolase fold  42.78 
 
 		 453 aa  335  9e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06790  prolyl aminopeptidase 2  42.62 
 
 		 441 aa  332  1e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02092  Putative prolyl aminopeptidase Fragment (EC 3.4.11.5) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96VT1]  40.75 
 
 		 443 aa  304  2.0000000000000002e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.707401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4714  alpha/beta hydrolase fold protein  37.77 
 
 		 439 aa  293  5e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05870  prolyl aminopeptidase 2  39.35 
 
 		 424 aa  292  6e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.208476  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11240  hypothetical protein with alpha/beta hydrolase fold  37.83 
 
 		 488 aa  291  1e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.163814  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0646  hydrolase, alpha/beta domain protein  36.3 
 
 		 460 aa  278  1e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.291247 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33188  predicted protein  36.91 
 
 		 510 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.860325  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0134  alpha/beta hydrolase fold protein  39.05 
 
 		 420 aa  271  2e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00350  prolyl aminopeptidase 2  37.29 
 
 		 443 aa  268  2e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.358137 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0669  putative hydrolse  37.67 
 
 		 447 aa  261  2e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.272037  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48996  prolyl aminopeptidase  32.83 
 
 		 478 aa  227  2e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.750097  normal  0.224061 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47448  predicted protein  33.05 
 
 		 692 aa  198  2.0000000000000003e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.445648  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0722  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 		 480 aa  75.5  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4864  TAP domain-containing protein  28.57 
 
 		 527 aa  62.4  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0074  TAP domain-containing protein  25.31 
 
 		 535 aa  60.1  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.523955 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0072  TAP domain-containing protein  25.31 
 
 		 535 aa  60.1  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1623  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4278  TAP domain-containing protein  26.23 
 
 		 540 aa  56.6  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0073  TAP domain protein  26.23 
 
 		 545 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0076  TAP domain-containing protein  25.82 
 
 		 549 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0552  prolyl aminopeptidase  31.43 
 
 		 323 aa  55.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.429543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0076  TAP domain-containing protein  28.32 
 
 		 539 aa  55.1  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000458817 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0057  TAP domain-containing protein  27.49 
 
 		 546 aa  54.7  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4916  proline iminopeptidase  34.96 
 
 		 312 aa  54.3  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0071  TAP domain-containing protein  25.82 
 
 		 538 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0071  alpha/beta fold family hydrolase  28.9 
 
 		 539 aa  53.9  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0068  peptidase S33, prolyl aminopeptidase  26.86 
 
 		 521 aa  53.5  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3126  hydrolase, alpha/beta fold family  23.72 
 
 		 301 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.83373  normal  0.0124269 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0771  proline iminopeptidase  30.71 
 
 		 320 aa  52.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.270138  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3780  TAP domain-containing protein  27.01 
 
 		 517 aa  52.8  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12478  proline iminopeptidase, putative  31.53 
 
 		 306 aa  51.6  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2262  proline iminopeptidase  31.54 
 
 		 335 aa  51.2  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.181325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0253  proline iminopeptidase  36.54 
 
 		 320 aa  51.6  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.381332  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4190  TAP domain-containing protein  27.12 
 
 		 519 aa  51.2  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0208  proline iminopeptidase  30.71 
 
 		 316 aa  50.8  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1447  TAP domain-containing protein  24.16 
 
 		 511 aa  50.8  0.00004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1940  proline iminopeptidase  32.2 
 
 		 317 aa  50.8  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04582  proline iminopeptidase  30.25 
 
 		 313 aa  50.8  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2329  hydrolase, alpha/beta fold family  24.81 
 
 		 291 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000968473  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0375  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  28.74 
 
 		 323 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1033  proline iminopeptidase  30 
 
 		 320 aa  50.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0998  alpha/beta hydrolase fold protein  27.05 
 
 		 675 aa  50.1  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2466  prolyl aminopeptidase  35.87 
 
 		 346 aa  50.1  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.186961 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0825  alpha/beta hydrolase fold protein  32.59 
 
 		 287 aa  49.7  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.135627  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2000  proline iminopeptidase  23.08 
 
 		 301 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118293  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0691  proline iminopeptidase  30.08 
 
 		 313 aa  49.7  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527577 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0371  prolyl aminopeptidase  29.29 
 
 		 323 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3091  proline iminopeptidase  33.9 
 
 		 319 aa  49.3  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133982  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1352  proline iminopeptidase  29.41 
 
 		 312 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.800954 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4460  TAP domain-containing protein  28.9 
 
 		 533 aa  49.3  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.726615 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2776  proline iminopeptidase  28.03 
 
 		 313 aa  48.9  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00879626  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5164  proline iminopeptidase  28.16 
 
 		 323 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2780  tripeptidyl-peptidase B  26.01 
 
 		 500 aa  48.5  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834234  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1502  proteinase  24.15 
 
 		 513 aa  48.5  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2315  prolyl aminopeptidase  29.51 
 
 		 319 aa  48.5  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000889953  hitchhiker  0.0000338054 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1180  proline iminopeptidase  33.83 
 
 		 320 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270645  normal  0.812597 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0066  tripeptidyl-peptidase B  25.65 
 
 		 540 aa  48.5  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.974168 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1492  proline iminopeptidase  29.88 
 
 		 330 aa  48.5  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0426318  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2199  hydrolase, alpha/beta fold family  24.06 
 
 		 291 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2042  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 		 291 aa  48.9  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2001  proline iminopeptidase  23.08 
 
 		 301 aa  47.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000475333  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2217  alpha/beta fold family hydrolase  23.08 
 
 		 303 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.716655  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1402  proline iminopeptidase  26.95 
 
 		 322 aa  48.1  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0193  alpha/beta hydrolase fold  31.2 
 
 		 305 aa  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.306421 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3551  proline iminopeptidase  31.93 
 
 		 328 aa  48.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1797  alpha/beta hydrolase fold protein  30.58 
 
 		 280 aa  48.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.287372  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2061  alpha/beta fold family hydrolase  23.08 
 
 		 301 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2245  hydrolase, alpha/beta fold family  23.08 
 
 		 301 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1528899999999994e-27 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2838  proline iminopeptidase  30.83 
 
 		 321 aa  47.4  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00251437  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0431  proline iminopeptidase  30.25 
 
 		 318 aa  47.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2011  proline iminopeptidase  31.82 
 
 		 321 aa  47.8  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0118869  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0314  proline iminopeptidase  34.07 
 
 		 316 aa  47.4  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>