196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4460 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0071  alpha/beta fold family hydrolase  60 
 
 		 539 aa  652    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0074  TAP domain-containing protein  62.77 
 
 		 535 aa  657    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.523955 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0072  TAP domain-containing protein  62.77 
 
 		 535 aa  660    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0076  TAP domain-containing protein  60.75 
 
 		 539 aa  658    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000458817 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4278  TAP domain-containing protein  62.55 
 
 		 540 aa  664    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3780  TAP domain-containing protein  69.07 
 
 		 517 aa  687    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0057  TAP domain-containing protein  64.17 
 
 		 546 aa  661    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0071  TAP domain-containing protein  63.89 
 
 		 538 aa  666    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4460  TAP domain-containing protein  100 
 
 		 533 aa  1113    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.726615 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4190  TAP domain-containing protein  70.92 
 
 		 519 aa  724    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0076  TAP domain-containing protein  62.7 
 
 		 549 aa  660    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4864  TAP domain-containing protein  72.12 
 
 		 527 aa  776    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0073  TAP domain protein  62.6 
 
 		 545 aa  664    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3977  TAP domain-containing protein  62.09 
 
 		 532 aa  628  1e-179  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.692071  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0068  peptidase S33, prolyl aminopeptidase  61.29 
 
 		 521 aa  597  1e-169  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3575  alpha/beta fold family hydrolase  56.59 
 
 		 507 aa  569  1e-161  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0722  alpha/beta fold family hydrolase  35.57 
 
 		 480 aa  316  9e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3874  TAP domain protein  32.72 
 
 		 508 aa  227  3e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02798  cysteine proteinase  34.1 
 
 		 533 aa  219  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1502  proteinase  31.1 
 
 		 513 aa  206  1e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3801  cysteine proteinase  32.59 
 
 		 502 aa  204  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184346 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1447  TAP domain-containing protein  30.93 
 
 		 511 aa  203  7e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2826  TAP domain-containing protein  28.2 
 
 		 688 aa  191  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000578424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2538  TAP domain-containing protein  27.98 
 
 		 693 aa  187  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112565 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0270  TAP domain-containing protein  28.05 
 
 		 670 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.948991  hitchhiker  0.000175368 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0265  TAP domain-containing protein  28.51 
 
 		 669 aa  182  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0441544  normal  0.0338675 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0079  TAP domain-containing protein  26.68 
 
 		 485 aa  152  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2103  alpha/beta hydrolase fold  25.64 
 
 		 645 aa  144  6e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418615  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0123  TAP domain protein  33.2 
 
 		 656 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3206  TAP domain-containing protein  25.44 
 
 		 475 aa  129  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2436  alpha/beta hydrolase fold protein  25.99 
 
 		 484 aa  122  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.425173  normal  0.0661487 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1183  TAP domain-containing protein  25.37 
 
 		 495 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3647  alpha/beta fold family hydrolase  26.8 
 
 		 680 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6275  TAP domain-containing protein  25.86 
 
 		 476 aa  110  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0998  alpha/beta hydrolase fold protein  25.97 
 
 		 675 aa  110  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4546  beta-lactamase  27.45 
 
 		 740 aa  106  9e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3351  alpha/beta hydrolase fold protein  23.59 
 
 		 489 aa  105  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172382  normal  0.0371725 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0118  alpha/beta hydrolase fold  26.23 
 
 		 503 aa  105  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742968  normal  0.120342 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0464  TAP domain-containing protein  27.36 
 
 		 499 aa  104  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000978752 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4956  TAP domain protein  24.84 
 
 		 507 aa  102  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.30314 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6093  TAP domain-containing protein  29.41 
 
 		 505 aa  101  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24850  alpha/beta hydrolase family protein  25.55 
 
 		 515 aa  101  3e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2904  TAP domain-containing protein  25.33 
 
 		 495 aa  100  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411145  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12253  exported protease  25.25 
 
 		 520 aa  100  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.499354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7044  hypothetical protein  22.99 
 
 		 522 aa  100  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2145  alpha/beta hydrolase fold protein  20.81 
 
 		 477 aa  99.8  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2906  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 		 505 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.834545 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0147  alpha/beta fold family hydrolase  25.12 
 
 		 668 aa  95.9  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.557879  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3600  TAP domain-containing protein  25.27 
 
 		 516 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601455 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0715  TAP domain-containing protein  23.69 
 
 		 524 aa  94  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3391  tripeptidyl-peptidase B  25.74 
 
 		 508 aa  93.6  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3340  tripeptidyl-peptidase B  25.74 
 
 		 508 aa  93.6  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478437  normal  0.109915 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3329  tripeptidyl-peptidase B  25.74 
 
 		 533 aa  93.6  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224727  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2780  tripeptidyl-peptidase B  24.88 
 
 		 500 aa  92  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834234  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4537  TAP domain protein  24.47 
 
 		 506 aa  92.8  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0663  TAP domain protein  24.15 
 
 		 525 aa  91.7  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2979  alpha/beta hydrolase fold protein  22.27 
 
 		 480 aa  92  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.171473 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3599  TAP domain-containing protein  27.74 
 
 		 505 aa  91.3  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6091  TAP domain-containing protein  28.12 
 
 		 504 aa  90.5  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1652  hypothetical protein  29.82 
 
 		 494 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.916188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3330  tripeptidyl-peptidase B  24.07 
 
 		 511 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3392  tripeptidyl-peptidase B  24.07 
 
 		 511 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3341  tripeptidyl-peptidase B  24.07 
 
 		 511 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175683  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2523  TAP domain protein  25.15 
 
 		 564 aa  87.4  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0577  TAP domain protein  26.21 
 
 		 508 aa  86.7  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2767  TAP domain-containing protein  22.78 
 
 		 546 aa  85.9  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2729  TAP domain protein  27.37 
 
 		 515 aa  84.7  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196617  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5024  TAP domain protein  25.58 
 
 		 571 aa  83.6  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412323  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2321  TAP domain-containing protein  24.51 
 
 		 612 aa  83.2  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279811  normal  0.349466 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3650  TAP domain-containing protein  27.06 
 
 		 475 aa  82.4  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0804319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4728  TAP domain-containing protein  23.15 
 
 		 506 aa  81.3  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0881  TAP domain protein  29.02 
 
 		 545 aa  80.9  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.478786  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3464  TAP domain-containing protein  29.82 
 
 		 527 aa  80.9  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.660985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1065  TAP domain protein  24.17 
 
 		 544 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0491  TAP domain protein  24.68 
 
 		 515 aa  79.7  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2980  TAP domain protein  29.69 
 
 		 557 aa  79.3  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.085257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2254  TAP domain-containing protein  22.62 
 
 		 486 aa  78.2  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.267716 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2192  TAP domain protein  23.31 
 
 		 518 aa  78.6  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12252  exported protease  24.34 
 
 		 520 aa  78.6  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.212366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2416  TAP domain-containing protein  27.53 
 
 		 505 aa  78.6  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000258971  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07410  alpha/beta hydrolase family protein  24.02 
 
 		 525 aa  77.4  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3369  TAP domain protein  23.62 
 
 		 547 aa  77.4  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0557447  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1192  alpha/beta hydrolase fold  24.51 
 
 		 490 aa  77.4  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0066  tripeptidyl-peptidase B  23.83 
 
 		 540 aa  77.4  0.0000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.974168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8392  TAP domain protein  24.79 
 
 		 537 aa  77  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258609  normal  0.179275 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2750  TAP domain-containing protein  25.06 
 
 		 490 aa  77  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.51195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9211  hypothetical protein  25.12 
 
 		 485 aa  76.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11121  conserved hypothetical protein  25.81 
 
 		 555 aa  75.9  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0230414 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25020  alpha/beta hydrolase family protein  26.67 
 
 		 542 aa  75.9  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2331  putative protease  27.5 
 
 		 300 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4357  TAP domain-containing protein  22.91 
 
 		 504 aa  75.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619924  normal  0.129935 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6090  TAP domain-containing protein  28.24 
 
 		 508 aa  75.1  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3616  TAP domain protein  22.7 
 
 		 546 aa  75.1  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.812667  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1042  TAP domain-containing protein  22.6 
 
 		 535 aa  73.9  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0225624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7303  hypothetical protein  28.57 
 
 		 532 aa  73.6  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0388  TAP domain-containing protein  23.26 
 
 		 521 aa  72.8  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0907  TAP domain protein  26.89 
 
 		 521 aa  72  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0356  TAP domain protein  22.2 
 
 		 523 aa  72.4  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0841  TAP domain protein  21.67 
 
 		 521 aa  72.4  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127306 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5935  TAP domain protein  28.96 
 
 		 518 aa  72  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235476  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>