190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3575 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3575  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 		 507 aa  1041    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0073  TAP domain protein  59.22 
 
 		 545 aa  599  1e-170  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4278  TAP domain-containing protein  57.88 
 
 		 540 aa  595  1e-169  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0057  TAP domain-containing protein  56.61 
 
 		 546 aa  592  1e-168  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0071  TAP domain-containing protein  59.43 
 
 		 538 aa  593  1e-168  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0076  TAP domain-containing protein  55.94 
 
 		 549 aa  593  1e-168  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3780  TAP domain-containing protein  60.13 
 
 		 517 aa  590  1e-167  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0074  TAP domain-containing protein  57.35 
 
 		 535 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.523955 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0072  TAP domain-containing protein  57.56 
 
 		 535 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0076  TAP domain-containing protein  55.31 
 
 		 539 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000458817 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3977  TAP domain-containing protein  54.62 
 
 		 532 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.692071  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0071  alpha/beta fold family hydrolase  57.58 
 
 		 539 aa  568  1e-161  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4460  TAP domain-containing protein  56.59 
 
 		 533 aa  569  1e-161  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.726615 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4190  TAP domain-containing protein  57.99 
 
 		 519 aa  568  1e-161  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4864  TAP domain-containing protein  55.38 
 
 		 527 aa  556  1e-157  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0068  peptidase S33, prolyl aminopeptidase  56.86 
 
 		 521 aa  554  1e-156  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0722  alpha/beta fold family hydrolase  38.03 
 
 		 480 aa  339  8e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02798  cysteine proteinase  38.18 
 
 		 533 aa  255  1.0000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1502  proteinase  34.28 
 
 		 513 aa  236  7e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1447  TAP domain-containing protein  33.84 
 
 		 511 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3874  TAP domain protein  35.32 
 
 		 508 aa  232  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3801  cysteine proteinase  34 
 
 		 502 aa  207  3e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184346 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0270  TAP domain-containing protein  30.79 
 
 		 670 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.948991  hitchhiker  0.000175368 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0265  TAP domain-containing protein  30.24 
 
 		 669 aa  173  5.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0441544  normal  0.0338675 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2826  TAP domain-containing protein  28.4 
 
 		 688 aa  170  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000578424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2538  TAP domain-containing protein  28.9 
 
 		 693 aa  167  4e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112565 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2103  alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 		 645 aa  141  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418615  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0079  TAP domain-containing protein  27.45 
 
 		 485 aa  131  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0123  TAP domain protein  29.84 
 
 		 656 aa  126  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3206  TAP domain-containing protein  25 
 
 		 475 aa  125  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6275  TAP domain-containing protein  24.56 
 
 		 476 aa  121  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2436  alpha/beta hydrolase fold protein  28.17 
 
 		 484 aa  120  7e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.425173  normal  0.0661487 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3351  alpha/beta hydrolase fold protein  28.63 
 
 		 489 aa  117  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172382  normal  0.0371725 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24850  alpha/beta hydrolase family protein  26.22 
 
 		 515 aa  115  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0998  alpha/beta hydrolase fold protein  27.51 
 
 		 675 aa  115  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4546  beta-lactamase  30.38 
 
 		 740 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1183  TAP domain-containing protein  26.69 
 
 		 495 aa  114  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7044  hypothetical protein  24.84 
 
 		 522 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3647  alpha/beta fold family hydrolase  26.11 
 
 		 680 aa  111  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0388  TAP domain-containing protein  27.14 
 
 		 521 aa  107  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0147  alpha/beta fold family hydrolase  26.32 
 
 		 668 aa  103  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.557879  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2145  alpha/beta hydrolase fold protein  23.21 
 
 		 477 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2904  TAP domain-containing protein  25.71 
 
 		 495 aa  100  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411145  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0118  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 503 aa  100  6e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742968  normal  0.120342 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0577  TAP domain protein  26.39 
 
 		 508 aa  99.4  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3330  tripeptidyl-peptidase B  26.3 
 
 		 511 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3392  tripeptidyl-peptidase B  26.3 
 
 		 511 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3341  tripeptidyl-peptidase B  26.3 
 
 		 511 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175683  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12253  exported protease  26.29 
 
 		 520 aa  99.4  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.499354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2767  TAP domain-containing protein  24.5 
 
 		 546 aa  97.8  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1192  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 		 490 aa  95.9  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2906  alpha/beta hydrolase fold  26.16 
 
 		 505 aa  95.1  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.834545 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3464  TAP domain-containing protein  26.1 
 
 		 527 aa  94  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.660985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0881  TAP domain protein  30.96 
 
 		 545 aa  93.2  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.478786  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0464  TAP domain-containing protein  24.44 
 
 		 499 aa  92  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000978752 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6091  TAP domain-containing protein  26.86 
 
 		 504 aa  91.7  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2780  tripeptidyl-peptidase B  25.05 
 
 		 500 aa  91.3  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834234  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5024  TAP domain protein  25.15 
 
 		 571 aa  91.3  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412323  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2979  alpha/beta hydrolase fold protein  21.71 
 
 		 480 aa  89.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.171473 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4537  TAP domain protein  25.23 
 
 		 506 aa  87  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4728  TAP domain-containing protein  24.94 
 
 		 506 aa  87  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3329  tripeptidyl-peptidase B  25.91 
 
 		 533 aa  87  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224727  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3391  tripeptidyl-peptidase B  25.91 
 
 		 508 aa  87  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3340  tripeptidyl-peptidase B  25.91 
 
 		 508 aa  87  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478437  normal  0.109915 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6093  TAP domain-containing protein  26.04 
 
 		 505 aa  86.7  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0663  TAP domain protein  23.22 
 
 		 525 aa  86.3  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3599  TAP domain-containing protein  30.48 
 
 		 505 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2192  TAP domain protein  22.34 
 
 		 518 aa  85.5  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32570  alpha/beta hydrolase family protein  26.46 
 
 		 541 aa  85.1  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3257  TAP domain-containing protein  29.26 
 
 		 499 aa  83.6  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.590122  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0907  TAP domain protein  26.82 
 
 		 521 aa  83.6  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0715  TAP domain-containing protein  23.61 
 
 		 524 aa  82.8  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3600  TAP domain-containing protein  25.65 
 
 		 516 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601455 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0491  TAP domain protein  25.37 
 
 		 515 aa  82  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2523  TAP domain protein  24.61 
 
 		 564 aa  82.4  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4956  TAP domain protein  24 
 
 		 507 aa  82.4  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.30314 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0841  TAP domain protein  23.57 
 
 		 521 aa  82.4  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127306 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2687  TAP domain protein  24.01 
 
 		 643 aa  80.1  0.00000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2331  putative protease  28.76 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25020  alpha/beta hydrolase family protein  26.35 
 
 		 542 aa  79.3  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2416  TAP domain-containing protein  28.14 
 
 		 505 aa  79  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000258971  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7397  TAP domain-containing protein  25 
 
 		 613 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0356  TAP domain protein  22.99 
 
 		 523 aa  77.8  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4219  alpha/beta hydrolase fold protein  28.43 
 
 		 486 aa  76.3  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0185  TAP domain protein  22.9 
 
 		 551 aa  76.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.696189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2254  TAP domain-containing protein  22.67 
 
 		 486 aa  76.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.267716 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1652  hypothetical protein  28.57 
 
 		 494 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.916188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7303  hypothetical protein  23.68 
 
 		 532 aa  75.1  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12252  exported protease  24.94 
 
 		 520 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.212366  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2980  TAP domain protein  28.16 
 
 		 557 aa  74.3  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.085257  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2321  TAP domain-containing protein  24.37 
 
 		 612 aa  73.9  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279811  normal  0.349466 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5935  TAP domain protein  24.33 
 
 		 518 aa  72.8  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235476  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8392  TAP domain protein  24.32 
 
 		 537 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258609  normal  0.179275 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1545  TAP domain-containing protein  25.2 
 
 		 542 aa  73.2  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3650  TAP domain-containing protein  27.83 
 
 		 475 aa  72.4  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0804319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0066  tripeptidyl-peptidase B  25.71 
 
 		 540 aa  71.6  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.974168 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9211  hypothetical protein  24.23 
 
 		 485 aa  71.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24000  alpha/beta hydrolase family protein  24.37 
 
 		 514 aa  71.6  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0638812 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2729  TAP domain protein  25 
 
 		 515 aa  70.9  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196617  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1488  TAP domain-containing protein  25 
 
 		 522 aa  70.5  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00026814 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>