259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0270 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0265  TAP domain-containing protein  82.93 
 
 
669 aa  1133    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0441544  normal  0.0338675 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0270  TAP domain-containing protein  100 
 
 
670 aa  1365    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.948991  hitchhiker  0.000175368 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2538  TAP domain-containing protein  40.08 
 
 
693 aa  325  2e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112565 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2826  TAP domain-containing protein  38.36 
 
 
688 aa  311  2e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000578424  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2321  TAP domain-containing protein  35.51 
 
 
612 aa  204  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279811  normal  0.349466 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3206  TAP domain-containing protein  32.22 
 
 
475 aa  193  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812713  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0074  TAP domain-containing protein  31.6 
 
 
535 aa  187  5e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.523955 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0072  TAP domain-containing protein  31.34 
 
 
535 aa  187  5e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0076  TAP domain-containing protein  32 
 
 
539 aa  187  6e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000458817 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0071  alpha/beta fold family hydrolase  31.21 
 
 
539 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2103  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 
645 aa  186  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418615  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0071  TAP domain-containing protein  31.92 
 
 
538 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0057  TAP domain-containing protein  31.68 
 
 
546 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0073  TAP domain protein  31.69 
 
 
545 aa  184  3e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3575  alpha/beta fold family hydrolase  30.79 
 
 
507 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3647  alpha/beta fold family hydrolase  31.63 
 
 
680 aa  183  7e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4278  TAP domain-containing protein  29.5 
 
 
540 aa  184  7e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3977  TAP domain-containing protein  29.46 
 
 
532 aa  183  9.000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.692071  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0079  TAP domain-containing protein  30.3 
 
 
485 aa  182  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4460  TAP domain-containing protein  28.05 
 
 
533 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.726615 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4190  TAP domain-containing protein  28.99 
 
 
519 aa  181  4e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0076  TAP domain-containing protein  29.11 
 
 
549 aa  181  4e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4864  TAP domain-containing protein  28.3 
 
 
527 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3874  TAP domain protein  32.24 
 
 
508 aa  177  4e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3780  TAP domain-containing protein  31.53 
 
 
517 aa  177  8e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0068  peptidase S33, prolyl aminopeptidase  29.81 
 
 
521 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0147  alpha/beta fold family hydrolase  29.36 
 
 
668 aa  174  6.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.557879  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4546  beta-lactamase  39.93 
 
 
740 aa  170  8e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0722  alpha/beta fold family hydrolase  29.46 
 
 
480 aa  169  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0123  TAP domain protein  35.65 
 
 
656 aa  168  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02798  cysteine proteinase  29.94 
 
 
533 aa  165  3e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2979  alpha/beta hydrolase fold protein  26.92 
 
 
480 aa  159  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.171473 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3801  cysteine proteinase  30.81 
 
 
502 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0184346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2145  alpha/beta hydrolase fold protein  27.96 
 
 
477 aa  148  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1502  proteinase  28.09 
 
 
513 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1447  TAP domain-containing protein  27.7 
 
 
511 aa  140  7.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0118  alpha/beta hydrolase fold  28.81 
 
 
503 aa  114  8.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742968  normal  0.120342 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1915  response regulator receiver domain-containing protein  26.24 
 
 
572 aa  99.8  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0435196  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3267  TAP domain protein  27.82 
 
 
538 aa  97.1  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000317549  decreased coverage  0.0000157542 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3330  tripeptidyl-peptidase B  26.36 
 
 
511 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3392  tripeptidyl-peptidase B  26.36 
 
 
511 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3341  tripeptidyl-peptidase B  26.36 
 
 
511 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175683  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2906  alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 
505 aa  96.3  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.834545 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07410  alpha/beta hydrolase family protein  25.9 
 
 
525 aa  94.7  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2904  TAP domain-containing protein  26.35 
 
 
495 aa  94.7  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411145  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4537  TAP domain protein  26.09 
 
 
506 aa  92.8  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2254  TAP domain-containing protein  27.5 
 
 
486 aa  92.4  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.267716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7044  hypothetical protein  24.13 
 
 
522 aa  92.8  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393484  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0907  TAP domain protein  25.22 
 
 
521 aa  92.8  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1192  alpha/beta hydrolase fold  34.29 
 
 
490 aa  92  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0998  alpha/beta hydrolase fold protein  26.87 
 
 
675 aa  90.9  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3600  TAP domain-containing protein  26.12 
 
 
516 aa  90.9  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.601455 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3599  TAP domain-containing protein  25.76 
 
 
505 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0185  TAP domain protein  27.25 
 
 
551 aa  88.6  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.696189  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0066  tripeptidyl-peptidase B  25.7 
 
 
540 aa  87.8  6e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.974168 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1183  TAP domain-containing protein  26.38 
 
 
495 aa  87.4  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6275  TAP domain-containing protein  23.7 
 
 
476 aa  85.9  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12253  exported protease  25.68 
 
 
520 aa  86.3  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.499354  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2416  TAP domain-containing protein  23.11 
 
 
505 aa  84.7  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000258971  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3329  tripeptidyl-peptidase B  26.07 
 
 
533 aa  84.7  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224727  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3391  tripeptidyl-peptidase B  26.07 
 
 
508 aa  84.7  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3340  tripeptidyl-peptidase B  26.07 
 
 
508 aa  84.7  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478437  normal  0.109915 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0663  TAP domain protein  25.32 
 
 
525 aa  84.7  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419459  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1042  TAP domain-containing protein  26.85 
 
 
535 aa  83.6  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0225624 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0577  TAP domain protein  25.17 
 
 
508 aa  80.9  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12252  exported protease  25.84 
 
 
520 aa  80.5  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.212366  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2523  TAP domain protein  24.34 
 
 
564 aa  79.3  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3351  alpha/beta hydrolase fold protein  25.91 
 
 
489 aa  79  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172382  normal  0.0371725 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6093  TAP domain-containing protein  27.69 
 
 
505 aa  78.6  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5024  TAP domain protein  26.69 
 
 
571 aa  77.4  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412323  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11121  conserved hypothetical protein  29.23 
 
 
555 aa  76.6  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0230414 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24850  alpha/beta hydrolase family protein  25.35 
 
 
515 aa  77  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32570  alpha/beta hydrolase family protein  25.58 
 
 
541 aa  75.1  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3369  TAP domain protein  24.68 
 
 
547 aa  75.1  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0557447  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0841  TAP domain protein  24.34 
 
 
521 aa  75.1  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127306 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0491  TAP domain protein  26.61 
 
 
515 aa  74.3  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0481  TAP domain protein  26.01 
 
 
539 aa  74.3  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.223264  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25020  alpha/beta hydrolase family protein  24.51 
 
 
542 aa  73.2  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0220  TAP domain protein  27.4 
 
 
551 aa  72.4  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712779 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0464  TAP domain-containing protein  27.37 
 
 
499 aa  72.8  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000978752 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0388  TAP domain-containing protein  22.74 
 
 
521 aa  72  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2767  TAP domain-containing protein  24.36 
 
 
546 aa  71.6  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2192  TAP domain protein  22.06 
 
 
518 aa  71.2  0.00000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4357  TAP domain-containing protein  28.57 
 
 
504 aa  71.2  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619924  normal  0.129935 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3616  TAP domain protein  25.05 
 
 
546 aa  71.2  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.812667  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1966  hypothetical protein  24.43 
 
 
530 aa  70.9  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52219  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2656  TAP domain protein  29.24 
 
 
535 aa  70.9  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0201051  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2212  TAP domain-containing protein  30.04 
 
 
520 aa  70.5  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.544179  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0476  alpha/beta hydrolase fold protein  26.5 
 
 
625 aa  70.1  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0548452  normal  0.176558 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2729  TAP domain protein  25.1 
 
 
515 aa  68.9  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196617  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1652  hypothetical protein  23.18 
 
 
494 aa  67.8  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.916188  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2970  TAP domain protein  25.36 
 
 
542 aa  66.6  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32712  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0715  TAP domain-containing protein  23.57 
 
 
524 aa  66.6  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6091  TAP domain-containing protein  25.76 
 
 
504 aa  67  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4956  TAP domain protein  24.05 
 
 
507 aa  66.2  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.30314 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2331  putative protease  26.44 
 
 
300 aa  66.2  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0356  TAP domain protein  22.51 
 
 
523 aa  66.2  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1946  TAP domain protein  25.87 
 
 
518 aa  65.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0350254  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7303  hypothetical protein  31.55 
 
 
532 aa  65.1  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2980  TAP domain protein  26.91 
 
 
557 aa  64.7  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.085257  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>