141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0079 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0079  TAP domain-containing protein  100 
 
 		 485 aa  1011    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0147  alpha/beta fold family hydrolase  51.82 
 
 		 668 aa  478  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.557879  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3647  alpha/beta fold family hydrolase  48.59 
 
 		 680 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0270  TAP domain-containing protein  30.3 
 
 		 670 aa  182  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.948991  hitchhiker  0.000175368 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2826  TAP domain-containing protein  30.44 
 
 		 688 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000578424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0265  TAP domain-containing protein  28.66 
 
 		 669 aa  172  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0441544  normal  0.0338675 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2538  TAP domain-containing protein  29.48 
 
 		 693 aa  170  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112565 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3206  TAP domain-containing protein  29.17 
 
 		 475 aa  153  8.999999999999999e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4460  TAP domain-containing protein  26.68 
 
 		 533 aa  152  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.726615 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4546  beta-lactamase  38.5 
 
 		 740 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3780  TAP domain-containing protein  27.87 
 
 		 517 aa  141  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0068  peptidase S33, prolyl aminopeptidase  28.16 
 
 		 521 aa  139  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4864  TAP domain-containing protein  26.42 
 
 		 527 aa  136  8e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4190  TAP domain-containing protein  26.36 
 
 		 519 aa  134  5e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0074  TAP domain-containing protein  25.85 
 
 		 535 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.523955 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0072  TAP domain-containing protein  25.85 
 
 		 535 aa  133  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3575  alpha/beta fold family hydrolase  27.45 
 
 		 507 aa  131  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0071  alpha/beta fold family hydrolase  25.48 
 
 		 539 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4278  TAP domain-containing protein  26.3 
 
 		 540 aa  128  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0057  TAP domain-containing protein  24.88 
 
 		 546 aa  127  6e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0071  TAP domain-containing protein  26.3 
 
 		 538 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0073  TAP domain protein  26.07 
 
 		 545 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0076  TAP domain-containing protein  24.82 
 
 		 539 aa  125  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000458817 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0076  TAP domain-containing protein  26.07 
 
 		 549 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02798  cysteine proteinase  26.52 
 
 		 533 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2979  alpha/beta hydrolase fold protein  24.08 
 
 		 480 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.171473 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0722  alpha/beta fold family hydrolase  25.59 
 
 		 480 aa  114  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3977  TAP domain-containing protein  25.06 
 
 		 532 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.692071  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1447  TAP domain-containing protein  25.53 
 
 		 511 aa  111  3e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1502  proteinase  26 
 
 		 513 aa  109  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2321  TAP domain-containing protein  31.28 
 
 		 612 aa  107  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279811  normal  0.349466 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3801  cysteine proteinase  26.48 
 
 		 502 aa  105  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184346 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3874  TAP domain protein  23.75 
 
 		 508 aa  106  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2145  alpha/beta hydrolase fold protein  24.58 
 
 		 477 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0118  alpha/beta hydrolase fold  25.47 
 
 		 503 aa  98.2  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742968  normal  0.120342 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0123  TAP domain protein  26.9 
 
 		 656 aa  94.7  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2103  alpha/beta hydrolase fold  30.88 
 
 		 645 aa  87.8  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418615  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24850  alpha/beta hydrolase family protein  25.6 
 
 		 515 aa  82  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2906  alpha/beta hydrolase fold  24.09 
 
 		 505 aa  77  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.834545 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2254  TAP domain-containing protein  22.84 
 
 		 486 aa  75.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.267716 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0577  TAP domain protein  24.77 
 
 		 508 aa  75.5  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2904  TAP domain-containing protein  21.82 
 
 		 495 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411145  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12252  exported protease  22.17 
 
 		 520 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.212366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3329  tripeptidyl-peptidase B  21.74 
 
 		 533 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224727  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3391  tripeptidyl-peptidase B  21.74 
 
 		 508 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3340  tripeptidyl-peptidase B  21.74 
 
 		 508 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478437  normal  0.109915 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3351  alpha/beta hydrolase fold protein  23.26 
 
 		 489 aa  68.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172382  normal  0.0371725 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1652  hypothetical protein  27.03 
 
 		 494 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.916188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4537  TAP domain protein  21.88 
 
 		 506 aa  67.8  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3600  TAP domain-containing protein  23.18 
 
 		 516 aa  67.4  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601455 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2416  TAP domain-containing protein  28.5 
 
 		 505 aa  65.1  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000258971  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2331  putative protease  26.67 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1915  response regulator receiver domain-containing protein  29.83 
 
 		 572 aa  64.7  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0435196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3599  TAP domain-containing protein  23.68 
 
 		 505 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12253  exported protease  27.1 
 
 		 520 aa  64.7  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.499354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2436  alpha/beta hydrolase fold protein  30.32 
 
 		 484 aa  64.3  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.425173  normal  0.0661487 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7044  hypothetical protein  22.25 
 
 		 522 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3330  tripeptidyl-peptidase B  23.78 
 
 		 511 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0388  TAP domain-containing protein  22.54 
 
 		 521 aa  61.6  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3392  tripeptidyl-peptidase B  23.78 
 
 		 511 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3341  tripeptidyl-peptidase B  23.78 
 
 		 511 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175683  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0185  TAP domain protein  27.96 
 
 		 551 aa  61.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.696189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0998  alpha/beta hydrolase fold protein  23.22 
 
 		 675 aa  60.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0644  hypothetical protein  25.13 
 
 		 597 aa  58.9  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6275  TAP domain-containing protein  28.5 
 
 		 476 aa  58.9  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4219  alpha/beta hydrolase fold protein  23.81 
 
 		 486 aa  57.4  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3267  TAP domain protein  27.85 
 
 		 538 aa  57.4  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000317549  decreased coverage  0.0000157542 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0438  TAP domain protein  29.38 
 
 		 542 aa  56.6  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.574551  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2780  tripeptidyl-peptidase B  22.74 
 
 		 500 aa  56.6  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834234  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1192  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 		 490 aa  55.5  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07410  alpha/beta hydrolase family protein  23.18 
 
 		 525 aa  55.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0663  TAP domain protein  21.69 
 
 		 525 aa  55.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6093  TAP domain-containing protein  24.18 
 
 		 505 aa  54.7  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0253  proline iminopeptidase  27.92 
 
 		 320 aa  53.5  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.381332  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1813  alpha/beta hydrolase fold protein  27.59 
 
 		 439 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000430652 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25020  alpha/beta hydrolase family protein  22.76 
 
 		 542 aa  52  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0691  proline iminopeptidase  29.85 
 
 		 313 aa  52  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527577 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2656  TAP domain protein  22.08 
 
 		 535 aa  51.2  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0201051  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6091  TAP domain-containing protein  20.73 
 
 		 504 aa  51.2  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0552  prolyl aminopeptidase  26.98 
 
 		 323 aa  50.8  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.429543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2767  TAP domain-containing protein  19.59 
 
 		 546 aa  50.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0715  TAP domain-containing protein  21.37 
 
 		 524 aa  50.4  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48996  prolyl aminopeptidase  26.67 
 
 		 478 aa  50.4  0.00007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.750097  normal  0.224061 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04582  proline iminopeptidase  29.2 
 
 		 313 aa  50.4  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3369  TAP domain protein  25.38 
 
 		 547 aa  50.1  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0557447  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1488  TAP domain-containing protein  25.99 
 
 		 522 aa  50.1  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00026814 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2262  proline iminopeptidase  26.25 
 
 		 335 aa  49.7  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.181325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0841  TAP domain protein  21.49 
 
 		 521 aa  50.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127306 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0881  TAP domain protein  26.46 
 
 		 545 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.478786  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0371  prolyl aminopeptidase  28.36 
 
 		 323 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0863  proline iminopeptidase  25.37 
 
 		 318 aa  47.8  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0375  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  28.36 
 
 		 323 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf626  proline iminopeptidase  25.18 
 
 		 315 aa  47.8  0.0004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.719337  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2687  TAP domain protein  24.82 
 
 		 643 aa  48.1  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589968  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5164  proline iminopeptidase  28.36 
 
 		 323 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2523  TAP domain protein  23.41 
 
 		 564 aa  47.8  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5028  proline iminopeptidase  27.61 
 
 		 323 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4902  proline iminopeptidase  27.61 
 
 		 323 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3903  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 426 aa  47.4  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0642789 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0437  proline iminopeptidase  27.61 
 
 		 323 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>