103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2321 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2321  TAP domain-containing protein  100 
 
 
612 aa  1185    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279811  normal  0.349466 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0270  TAP domain-containing protein  35.29 
 
 
670 aa  220  7.999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.948991  hitchhiker  0.000175368 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0265  TAP domain-containing protein  33.7 
 
 
669 aa  206  8e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0441544  normal  0.0338675 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2538  TAP domain-containing protein  28.26 
 
 
693 aa  185  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112565 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2826  TAP domain-containing protein  27.88 
 
 
688 aa  183  9.000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000578424  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2103  alpha/beta hydrolase fold  22.98 
 
 
645 aa  161  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418615  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3206  TAP domain-containing protein  28.07 
 
 
475 aa  136  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812713  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0147  alpha/beta fold family hydrolase  27.8 
 
 
668 aa  131  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.557879  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2979  alpha/beta hydrolase fold protein  24.66 
 
 
480 aa  128  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.171473 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4546  beta-lactamase  36.76 
 
 
740 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3647  alpha/beta fold family hydrolase  25.43 
 
 
680 aa  120  9e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2145  alpha/beta hydrolase fold protein  26.24 
 
 
477 aa  116  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02798  cysteine proteinase  28.97 
 
 
533 aa  113  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3874  TAP domain protein  27.33 
 
 
508 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0079  TAP domain-containing protein  24.11 
 
 
485 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4278  TAP domain-containing protein  24.69 
 
 
540 aa  107  8e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0071  TAP domain-containing protein  24.79 
 
 
538 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0722  alpha/beta fold family hydrolase  26.42 
 
 
480 aa  104  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0123  TAP domain protein  27.33 
 
 
656 aa  104  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0074  TAP domain-containing protein  24.18 
 
 
535 aa  103  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.523955 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0072  TAP domain-containing protein  24.59 
 
 
535 aa  103  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4864  TAP domain-containing protein  24.32 
 
 
527 aa  103  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0073  TAP domain protein  24.69 
 
 
545 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4190  TAP domain-containing protein  26.79 
 
 
519 aa  100  8e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0071  alpha/beta fold family hydrolase  24.88 
 
 
539 aa  99.8  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0076  TAP domain-containing protein  23.72 
 
 
539 aa  99.8  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000458817 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0076  TAP domain-containing protein  24.43 
 
 
549 aa  98.6  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3977  TAP domain-containing protein  23.32 
 
 
532 aa  97.4  7e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.692071  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0057  TAP domain-containing protein  22.7 
 
 
546 aa  92  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4460  TAP domain-containing protein  24.68 
 
 
533 aa  92  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.726615 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0068  peptidase S33, prolyl aminopeptidase  23.7 
 
 
521 aa  90.1  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3575  alpha/beta fold family hydrolase  24.37 
 
 
507 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3780  TAP domain-containing protein  24.64 
 
 
517 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2523  TAP domain protein  26.1 
 
 
564 aa  82.4  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3801  cysteine proteinase  28.01 
 
 
502 aa  81.6  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0184346 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07410  alpha/beta hydrolase family protein  26.13 
 
 
525 aa  78.2  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7044  hypothetical protein  25.22 
 
 
522 aa  77.4  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393484  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0998  alpha/beta hydrolase fold protein  29.91 
 
 
675 aa  75.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0750  putative secreted peptidase  28.19 
 
 
521 aa  73.2  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1447  TAP domain-containing protein  24.82 
 
 
511 aa  73.2  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3369  TAP domain protein  25.7 
 
 
547 aa  73.2  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0557447  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1502  proteinase  24.07 
 
 
513 aa  72.4  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24000  alpha/beta hydrolase family protein  30.07 
 
 
514 aa  70.5  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0638812 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2904  TAP domain-containing protein  27.29 
 
 
495 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411145  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0118  alpha/beta hydrolase fold  31.28 
 
 
503 aa  67.4  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742968  normal  0.120342 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0066  tripeptidyl-peptidase B  24.37 
 
 
540 aa  67  0.0000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.974168 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3160  TAP domain protein  27.4 
 
 
527 aa  66.6  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3329  tripeptidyl-peptidase B  29.49 
 
 
533 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224727  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3391  tripeptidyl-peptidase B  29.49 
 
 
508 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3340  tripeptidyl-peptidase B  29.49 
 
 
508 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478437  normal  0.109915 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12253  exported protease  25.71 
 
 
520 aa  65.5  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.499354  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0464  TAP domain-containing protein  24.85 
 
 
499 aa  65.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000978752 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2767  TAP domain-containing protein  26.23 
 
 
546 aa  65.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24850  alpha/beta hydrolase family protein  26.65 
 
 
515 aa  64.7  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4357  TAP domain-containing protein  23.7 
 
 
504 aa  64.7  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619924  normal  0.129935 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1065  TAP domain protein  25 
 
 
544 aa  63.9  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2780  tripeptidyl-peptidase B  25.85 
 
 
500 aa  63.9  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834234  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3600  TAP domain-containing protein  26.13 
 
 
516 aa  63.9  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.601455 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1946  TAP domain protein  26.75 
 
 
518 aa  62.4  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0350254  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3599  TAP domain-containing protein  28.24 
 
 
505 aa  61.6  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1183  TAP domain-containing protein  27.11 
 
 
495 aa  61.6  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2906  alpha/beta hydrolase fold  28.27 
 
 
505 aa  60.5  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.834545 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3330  tripeptidyl-peptidase B  25.66 
 
 
511 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3392  tripeptidyl-peptidase B  25.66 
 
 
511 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3341  tripeptidyl-peptidase B  25.66 
 
 
511 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175683  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12252  exported protease  27.37 
 
 
520 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.212366  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0907  TAP domain protein  27.09 
 
 
521 aa  57.8  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2656  TAP domain protein  24.95 
 
 
535 aa  57.4  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0201051  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0185  TAP domain protein  25.83 
 
 
551 aa  57.4  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.696189  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1915  response regulator receiver domain-containing protein  22.75 
 
 
572 aa  56.6  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0435196  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2254  TAP domain-containing protein  27.65 
 
 
486 aa  57  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.267716 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2212  TAP domain-containing protein  27.13 
 
 
520 aa  56.2  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.544179  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2729  TAP domain protein  25.74 
 
 
515 aa  55.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196617  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1966  hypothetical protein  24.54 
 
 
530 aa  55.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52219  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1042  TAP domain-containing protein  25.05 
 
 
535 aa  54.3  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0225624 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1192  alpha/beta hydrolase fold  28.76 
 
 
490 aa  53.5  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0388  TAP domain-containing protein  27.45 
 
 
521 aa  52.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2416  TAP domain-containing protein  29.8 
 
 
505 aa  52.8  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000258971  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2970  TAP domain protein  27.46 
 
 
542 aa  52.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32712  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0481  TAP domain protein  23.13 
 
 
539 aa  52.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.223264  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3345  TAP domain-containing protein  24.24 
 
 
532 aa  52  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0319674  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3267  TAP domain protein  25.75 
 
 
538 aa  51.6  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000317549  decreased coverage  0.0000157542 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6091  TAP domain-containing protein  25.63 
 
 
504 aa  51.2  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2192  TAP domain protein  22.62 
 
 
518 aa  50.8  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32570  alpha/beta hydrolase family protein  24.28 
 
 
541 aa  49.7  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9211  hypothetical protein  28.68 
 
 
485 aa  50.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1723  TAP domain protein  29.03 
 
 
536 aa  50.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00370292  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0491  TAP domain protein  26.12 
 
 
515 aa  48.9  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4414  hypothetical protein  31.47 
 
 
505 aa  49.7  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.694835  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0663  TAP domain protein  24.84 
 
 
525 aa  48.9  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419459  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3616  TAP domain protein  26.4 
 
 
546 aa  48.5  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.812667  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6097  TAP domain protein  26.83 
 
 
559 aa  48.1  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4956  TAP domain protein  24.73 
 
 
507 aa  47  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.30314 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1545  TAP domain-containing protein  24.83 
 
 
542 aa  46.6  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2270  hypothetical protein  27.78 
 
 
517 aa  46.6  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.983408  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2436  alpha/beta hydrolase fold protein  31.1 
 
 
484 aa  46.6  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.425173  normal  0.0661487 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3355  TAP domain protein  40.68 
 
 
321 aa  45.8  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25020  alpha/beta hydrolase family protein  25.73 
 
 
542 aa  45.1  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2687  TAP domain protein  24.61 
 
 
643 aa  45.1  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589968  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5034  alpha/beta hydrolase fold  51.06 
 
 
245 aa  44.7  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.246074  normal  0.671643 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>