118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2979 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2979  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 480 aa  1003    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.171473 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2145  alpha/beta hydrolase fold protein  40.13 
 
 		 477 aa  349  7e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0270  TAP domain-containing protein  26.92 
 
 		 670 aa  159  9e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.948991  hitchhiker  0.000175368 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0265  TAP domain-containing protein  26.68 
 
 		 669 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0441544  normal  0.0338675 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3874  TAP domain protein  25.18 
 
 		 508 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2538  TAP domain-containing protein  26.19 
 
 		 693 aa  129  9.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112565 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2826  TAP domain-containing protein  24.89 
 
 		 688 aa  127  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000578424  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2321  TAP domain-containing protein  24.77 
 
 		 612 aa  125  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279811  normal  0.349466 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3206  TAP domain-containing protein  25.93 
 
 		 475 aa  119  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812713  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0071  alpha/beta fold family hydrolase  24.34 
 
 		 539 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0079  TAP domain-containing protein  24.08 
 
 		 485 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4546  beta-lactamase  36.46 
 
 		 740 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2103  alpha/beta hydrolase fold  22.47 
 
 		 645 aa  115  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418615  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0076  TAP domain-containing protein  23.58 
 
 		 539 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000458817 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0074  TAP domain-containing protein  23.11 
 
 		 535 aa  111  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.523955 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0072  TAP domain-containing protein  23.11 
 
 		 535 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0057  TAP domain-containing protein  22.72 
 
 		 546 aa  107  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4190  TAP domain-containing protein  23.93 
 
 		 519 aa  104  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02798  cysteine proteinase  23.74 
 
 		 533 aa  103  9e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3647  alpha/beta fold family hydrolase  26.28 
 
 		 680 aa  97.8  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0118  alpha/beta hydrolase fold  23.47 
 
 		 503 aa  95.1  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742968  normal  0.120342 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0068  peptidase S33, prolyl aminopeptidase  21.96 
 
 		 521 aa  94.7  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0147  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 		 668 aa  94.7  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.557879  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0071  TAP domain-containing protein  21.01 
 
 		 538 aa  94.4  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4460  TAP domain-containing protein  22.27 
 
 		 533 aa  92  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.726615 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4278  TAP domain-containing protein  20.63 
 
 		 540 aa  91.7  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0076  TAP domain-containing protein  20.77 
 
 		 549 aa  90.5  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0073  TAP domain protein  20.53 
 
 		 545 aa  90.1  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3575  alpha/beta fold family hydrolase  21.71 
 
 		 507 aa  89.7  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4864  TAP domain-containing protein  21.51 
 
 		 527 aa  89.4  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1502  proteinase  22.55 
 
 		 513 aa  88.6  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3977  TAP domain-containing protein  22.97 
 
 		 532 aa  88.2  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.692071  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3780  TAP domain-containing protein  22.7 
 
 		 517 aa  88.2  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3801  cysteine proteinase  24.6 
 
 		 502 aa  86.3  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184346 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1447  TAP domain-containing protein  22.55 
 
 		 511 aa  85.1  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0123  TAP domain protein  23.24 
 
 		 656 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0722  alpha/beta fold family hydrolase  21.86 
 
 		 480 aa  75.9  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3599  TAP domain-containing protein  27.31 
 
 		 505 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0998  alpha/beta hydrolase fold protein  22.32 
 
 		 675 aa  64.3  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1192  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 		 490 aa  62.4  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2729  TAP domain protein  25.6 
 
 		 515 aa  62  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196617  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2906  alpha/beta hydrolase fold  22.54 
 
 		 505 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.834545 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2523  TAP domain protein  24.49 
 
 		 564 aa  62  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0881  TAP domain protein  26.24 
 
 		 545 aa  60.1  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.478786  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3329  tripeptidyl-peptidase B  23.13 
 
 		 533 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224727  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3391  tripeptidyl-peptidase B  23.13 
 
 		 508 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3340  tripeptidyl-peptidase B  23.13 
 
 		 508 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478437  normal  0.109915 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0066  tripeptidyl-peptidase B  28.84 
 
 		 540 aa  58.5  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.974168 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2767  TAP domain-containing protein  23.61 
 
 		 546 aa  58.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12252  exported protease  22.54 
 
 		 520 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.212366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7044  hypothetical protein  22.17 
 
 		 522 aa  58.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2212  TAP domain-containing protein  26.73 
 
 		 520 aa  57.8  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.544179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5024  TAP domain protein  28.34 
 
 		 571 aa  57.4  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412323  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24850  alpha/beta hydrolase family protein  27.08 
 
 		 515 aa  57  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0464  TAP domain-containing protein  25.42 
 
 		 499 aa  56.2  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000978752 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4537  TAP domain protein  27.27 
 
 		 506 aa  54.7  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1652  hypothetical protein  24.47 
 
 		 494 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.916188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1545  TAP domain-containing protein  28.21 
 
 		 542 aa  53.9  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3369  TAP domain protein  26.07 
 
 		 547 aa  53.9  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0557447  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07410  alpha/beta hydrolase family protein  26.02 
 
 		 525 aa  53.5  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2904  TAP domain-containing protein  21.54 
 
 		 495 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411145  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2416  TAP domain-containing protein  26.09 
 
 		 505 aa  52.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000258971  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3267  TAP domain protein  26.43 
 
 		 538 aa  52.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000317549  decreased coverage  0.0000157542 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0907  TAP domain protein  22.51 
 
 		 521 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6093  TAP domain-containing protein  27.13 
 
 		 505 aa  52.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1946  TAP domain protein  29.32 
 
 		 518 aa  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0350254  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2489  TAP domain-containing protein  27.69 
 
 		 519 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.322289 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0715  TAP domain-containing protein  24.52 
 
 		 524 aa  50.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0577  TAP domain protein  28.95 
 
 		 508 aa  50.8  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1042  TAP domain-containing protein  25.82 
 
 		 535 aa  50.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0225624 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2436  alpha/beta hydrolase fold protein  22.59 
 
 		 484 aa  50.8  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.425173  normal  0.0661487 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2218  TAP-like protein  26.47 
 
 		 520 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2264  TAP domain-containing protein  26.47 
 
 		 520 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.149819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2207  TAP domain-containing protein  26.47 
 
 		 520 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4357  TAP domain-containing protein  24.51 
 
 		 504 aa  50.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619924  normal  0.129935 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2687  TAP domain protein  24.53 
 
 		 643 aa  50.4  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3914  TAP domain-containing protein  24.18 
 
 		 519 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.527163  normal  0.822119 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3330  tripeptidyl-peptidase B  24.68 
 
 		 511 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3392  tripeptidyl-peptidase B  24.68 
 
 		 511 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3600  TAP domain-containing protein  21.85 
 
 		 516 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601455 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3341  tripeptidyl-peptidase B  24.68 
 
 		 511 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175683  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1488  TAP domain-containing protein  24.86 
 
 		 522 aa  48.9  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00026814 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2276  putative protease  25.68 
 
 		 524 aa  48.5  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.494839 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1897  TAP domain protein  24.59 
 
 		 520 aa  48.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2442  TAP domain protein  25.13 
 
 		 597 aa  48.1  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000431609  normal  0.057711 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4728  TAP domain-containing protein  24.59 
 
 		 506 aa  47.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0388  TAP domain-containing protein  25.81 
 
 		 521 aa  47.4  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3351  alpha/beta hydrolase fold protein  39.34 
 
 		 489 aa  47.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172382  normal  0.0371725 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25020  alpha/beta hydrolase family protein  26.2 
 
 		 542 aa  47.4  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12687  protease  27.94 
 
 		 525 aa  47  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.68e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6275  TAP domain-containing protein  25 
 
 		 476 aa  47  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2331  putative protease  24.24 
 
 		 300 aa  47  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2962  proline iminopeptidase  35.09 
 
 		 296 aa  46.6  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.305011  normal  0.0401306 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03961  proline iminopeptidase  30.36 
 
 		 313 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12253  exported protease  21 
 
 		 520 aa  46.2  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.499354  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4956  TAP domain protein  23.83 
 
 		 507 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.30314 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0481  TAP domain protein  24.6 
 
 		 539 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.223264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32570  alpha/beta hydrolase family protein  25.83 
 
 		 541 aa  45.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2254  TAP domain-containing protein  20.52 
 
 		 486 aa  45.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.267716 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2370  proline iminopeptidase  35.09 
 
 		 296 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>