240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0079 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0079  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 
150 aa  303  7e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1808  lipoprotein signal peptidase  62.12 
 
 
150 aa  167  5e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.154233  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0743  lipoprotein signal peptidase  56.03 
 
 
148 aa  164  3e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2038  lipoprotein signal peptidase  55.94 
 
 
153 aa  156  8e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1790  lipoprotein signal peptidase  55.8 
 
 
160 aa  154  3e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.434015  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1566  lipoprotein signal peptidase  55.91 
 
 
155 aa  140  6e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1716  lipoprotein signal peptidase  54.26 
 
 
147 aa  132  1e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.463602  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0410  lipoprotein signal peptidase  50.81 
 
 
156 aa  132  2e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0384  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 
156 aa  127  4e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1596  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 
156 aa  127  5e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  31.72 
 
 
178 aa  69.7  1e-11  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0288  lipoprotein signal peptidase  38.94 
 
 
184 aa  65.9  2e-10  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_004310  BR0149  lipoprotein signal peptidase  34.62 
 
 
160 aa  63.2  1e-09  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0144  lipoprotein signal peptidase  34.62 
 
 
160 aa  63.2  1e-09  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4211  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 
174 aa  62.4  2e-09  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  33.33 
 
 
157 aa  62.4  2e-09  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  29.5 
 
 
178 aa  61.6  3e-09  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4414  signal peptidase II  37.74 
 
 
123 aa  61.2  5e-09  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849735  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4493  lipoprotein signal peptidase  33.93 
 
 
180 aa  60.5  7e-09  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124328  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0415  lipoprotein signal peptidase  41.24 
 
 
163 aa  59.7  1e-08  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  31.03 
 
 
166 aa  58.9  2e-08  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  6.40597e-09 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0161  lipoprotein signal peptidase  29.94 
 
 
160 aa  58.9  2e-08  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  33.93 
 
 
168 aa  58.9  2e-08  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  31.03 
 
 
166 aa  59.3  2e-08  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  31.58 
 
 
166 aa  58.5  3e-08  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  3.63425e-05 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  31.43 
 
 
164 aa  57.8  4e-08  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  29.1 
 
 
167 aa  57.8  5e-08  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4439  signal peptidase II  32.5 
 
 
165 aa  57.8  5e-08  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  29.25 
 
 
170 aa  57.4  6e-08  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1207  lipoprotein signal peptidase  30.17 
 
 
170 aa  57.4  6e-08  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.31544  normal  0.0825265 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  28.95 
 
 
166 aa  57.4  7e-08  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  30.7 
 
 
166 aa  57  8e-08  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  30.7 
 
 
166 aa  57  8e-08  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  30.7 
 
 
166 aa  57  8e-08  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  4.08677e-06 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  30.77 
 
 
160 aa  57  8e-08  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  31.48 
 
 
160 aa  57  9e-08  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1726  lipoprotein signal peptidase  33.62 
 
 
163 aa  56.2  1e-07  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.88791  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  31.93 
 
 
182 aa  55.5  2e-07  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  27.82 
 
 
159 aa  55.5  2e-07  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1243  signal peptidase II  33.33 
 
 
364 aa  55.5  3e-07  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10890  lipoprotein signal peptidase  33.6 
 
 
204 aa  55.5  3e-07  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0587746  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2281  lipoprotein signal peptidase  27.63 
 
 
171 aa  55.1  3e-07  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  29.2 
 
 
166 aa  55.5  3e-07  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1126  lipoprotein signal peptidase  31.78 
 
 
174 aa  54.7  4e-07  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  28.78 
 
 
176 aa  54.7  4e-07  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  35.19 
 
 
154 aa  54.7  4e-07  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  31.53 
 
 
150 aa  54.7  4e-07  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  29.63 
 
 
163 aa  54.7  5e-07  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2630  peptidase A8, signal peptidase II  29.2 
 
 
166 aa  54.3  6e-07  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  29.57 
 
 
166 aa  53.9  7e-07  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  29.57 
 
 
166 aa  53.9  7e-07  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  29.05 
 
 
168 aa  53.9  7e-07  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  29.57 
 
 
166 aa  53.9  7e-07  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  29.57 
 
 
166 aa  53.9  7e-07  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  29.57 
 
 
166 aa  53.9  7e-07  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  29.57 
 
 
166 aa  53.9  7e-07  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  29.57 
 
 
166 aa  53.9  7e-07  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  29.57 
 
 
166 aa  53.9  7e-07  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  32.23 
 
 
181 aa  53.5  1e-06  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  30.34 
 
 
169 aa  53.1  1e-06  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  29.57 
 
 
159 aa  53.5  1e-06  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4001  lipoprotein signal peptidase  32.47 
 
 
195 aa  52.8  2e-06  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.983815 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  29.82 
 
 
172 aa  52.4  2e-06  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  33.96 
 
 
171 aa  52.4  2e-06  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  26.35 
 
 
171 aa  52.4  2e-06  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  34.86 
 
 
149 aa  52.8  2e-06  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  32.14 
 
 
171 aa  52.4  2e-06  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  29.93 
 
 
153 aa  51.6  3e-06  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  29.82 
 
 
172 aa  52  3e-06  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2146  lipoprotein signal peptidase  27.34 
 
 
167 aa  52  3e-06  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.669133  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  31.11 
 
 
169 aa  51.6  3e-06  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  4.09977e-07 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  31.11 
 
 
169 aa  51.6  3e-06  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  31.53 
 
 
170 aa  52  3e-06  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  31.53 
 
 
170 aa  52  3e-06  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  29.91 
 
 
173 aa  52  3e-06  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  29.91 
 
 
174 aa  52  3e-06  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  31.53 
 
 
170 aa  52  3e-06  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  33.64 
 
 
157 aa  51.6  4e-06  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  29.36 
 
 
179 aa  51.2  4e-06  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2207  lipoprotein signal peptidase  27.86 
 
 
151 aa  51.2  4e-06  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0303481  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4193  lipoprotein signal peptidase  29.46 
 
 
173 aa  51.2  4e-06  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2543  lipoprotein signal peptidase  30.7 
 
 
165 aa  51.6  4e-06  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1257  lipoprotein signal peptidase  23.75 
 
 
160 aa  51.2  5e-06  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  30.43 
 
 
171 aa  51.2  5e-06  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  30.43 
 
 
171 aa  51.2  5e-06  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  29.06 
 
 
174 aa  51.2  5e-06  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  30.43 
 
 
171 aa  51.2  5e-06  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  30.43 
 
 
171 aa  51.2  5e-06  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  29.41 
 
 
165 aa  50.4  7e-06  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  31.53 
 
 
170 aa  50.4  7e-06  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3850  lipoprotein signal peptidase  29.51 
 
 
164 aa  50.4  7e-06  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777675  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05536  lipoprotein signal peptidase  30.84 
 
 
166 aa  50.4  7e-06  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192233  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2580  lipoprotein signal peptidase  29.24 
 
 
173 aa  50.4  8e-06  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  28.06 
 
 
154 aa  50.4  8e-06  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2736  lipoprotein signal peptidase  29.41 
 
 
165 aa  50.4  8e-06  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396586  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3857  lipoprotein signal peptidase  36 
 
 
178 aa  50.4  8e-06  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0363332  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2861  lipoprotein signal peptidase  29.36 
 
 
171 aa  50.4  9e-06  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0978018 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3163  lipoprotein signal peptidase  31.67 
 
 
164 aa  50.1  1e-05  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  29.29 
 
 
170 aa  50.1  1e-05  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  30.37 
 
 
176 aa  50.1  1e-05  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>