236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_2038 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_2038  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 
153 aa  309  1e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0079  lipoprotein signal peptidase  55.94 
 
 
150 aa  156  8e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1790  lipoprotein signal peptidase  56.35 
 
 
160 aa  142  2e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.434015  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1808  lipoprotein signal peptidase  57.48 
 
 
150 aa  141  3e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.154233  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1566  lipoprotein signal peptidase  54.01 
 
 
155 aa  136  1e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0743  lipoprotein signal peptidase  56.15 
 
 
148 aa  135  3.0000000000000003e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1716  lipoprotein signal peptidase  57.26 
 
 
147 aa  130  7.999999999999999e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.463602  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0410  lipoprotein signal peptidase  46.67 
 
 
156 aa  122  1e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0384  lipoprotein signal peptidase  46.67 
 
 
156 aa  122  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1596  lipoprotein signal peptidase  45.93 
 
 
156 aa  117  6e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  32.45 
 
 
178 aa  70.1  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4414  signal peptidase II  34.75 
 
 
123 aa  63.9  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849735  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0149  lipoprotein signal peptidase  37.78 
 
 
160 aa  62  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0144  lipoprotein signal peptidase  37.78 
 
 
160 aa  62  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  28.08 
 
 
159 aa  60.5  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1257  lipoprotein signal peptidase  27.04 
 
 
160 aa  60.5  0.000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0288  lipoprotein signal peptidase  34.82 
 
 
184 aa  59.7  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0711  lipoprotein signal peptidase  31.68 
 
 
168 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.395122  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  38.33 
 
 
170 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  33.79 
 
 
169 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0161  lipoprotein signal peptidase  35.37 
 
 
160 aa  58.9  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1207  lipoprotein signal peptidase  33.1 
 
 
170 aa  58.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.31544  normal  0.0825265 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  33.1 
 
 
169 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1126  lipoprotein signal peptidase  29.03 
 
 
174 aa  57.4  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2281  lipoprotein signal peptidase  31.53 
 
 
171 aa  57.4  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  28.78 
 
 
164 aa  57  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4211  lipoprotein signal peptidase  33.64 
 
 
174 aa  56.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2326  lipoprotein signal peptidase  31.53 
 
 
171 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231394  normal  0.6435 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0807  lipoprotein signal peptidase  31.68 
 
 
173 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
168 aa  56.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  30.34 
 
 
178 aa  55.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3531  lipoprotein signal peptidase  32.23 
 
 
165 aa  55.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331407  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2231  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
189 aa  55.5  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4439  signal peptidase II  30.38 
 
 
165 aa  55.5  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4973  lipoprotein signal peptidase  31.75 
 
 
160 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2603  lipoprotein signal peptidase  30.63 
 
 
171 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.172447 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1409  lipoprotein signal peptidase  29.93 
 
 
170 aa  54.7  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0139  lipoprotein signal peptidase  31.97 
 
 
157 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000441491 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0954  lipoprotein signal peptidase  30.26 
 
 
169 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0645  lipoprotein signal peptidase  32.64 
 
 
171 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.11552 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0142  lipoprotein signal peptidase  31.97 
 
 
157 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4558  lipoprotein signal peptidase  32.17 
 
 
171 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21418  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10890  lipoprotein signal peptidase  30.09 
 
 
204 aa  53.9  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0587746  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0604  lipoprotein signal peptidase  32.64 
 
 
176 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.975545  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0911  lipoprotein signal peptidase  32.59 
 
 
204 aa  53.9  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  36.44 
 
 
159 aa  53.9  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3857  lipoprotein signal peptidase  36 
 
 
178 aa  53.5  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0363332  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
166 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
166 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  28.57 
 
 
157 aa  53.5  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
166 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
166 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4193  lipoprotein signal peptidase  29.27 
 
 
173 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
166 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  32.43 
 
 
181 aa  53.1  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
166 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  32.35 
 
 
166 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  28.47 
 
 
169 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  32.35 
 
 
166 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
166 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
166 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  32.35 
 
 
166 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00031  signal peptidase II  33.93 
 
 
164 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00165346  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3572  lipoprotein signal peptidase  33.93 
 
 
164 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.262738  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  30.41 
 
 
171 aa  52.4  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1726  lipoprotein signal peptidase  34.21 
 
 
163 aa  52.8  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.88791  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0025  lipoprotein signal peptidase  33.93 
 
 
164 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.258735  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0031  lipoprotein signal peptidase  33.93 
 
 
164 aa  52.8  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112205  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0650  lipoprotein signal peptidase  32.17 
 
 
171 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  27.89 
 
 
163 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  31.2 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3628  lipoprotein signal peptidase  33.93 
 
 
164 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.73283  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1135  lipoprotein signal peptidase  28.48 
 
 
166 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  31.37 
 
 
166 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  32.35 
 
 
166 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0029  lipoprotein signal peptidase  33.93 
 
 
164 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0677738  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00030  hypothetical protein  33.93 
 
 
164 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0011292  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0027  lipoprotein signal peptidase  33.93 
 
 
164 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.102784  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0029  lipoprotein signal peptidase  42.47 
 
 
164 aa  52  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0223845  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4001  lipoprotein signal peptidase  34.21 
 
 
195 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.983815 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4043  signal peptidase II  28.95 
 
 
157 aa  52  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  31.37 
 
 
166 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  29.85 
 
 
167 aa  51.6  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2328  lipoprotein signal peptidase  37.72 
 
 
157 aa  51.2  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  30 
 
 
179 aa  51.6  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  29.52 
 
 
168 aa  51.2  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  29.73 
 
 
150 aa  50.8  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0051  lipoprotein signal peptidase  44.12 
 
 
166 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.322975 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0052  lipoprotein signal peptidase  44.12 
 
 
166 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.876995  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1799  lipoprotein signal peptidase  29.06 
 
 
171 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.408205  normal  0.0603455 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0050  lipoprotein signal peptidase  44.12 
 
 
166 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.612919  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0051  lipoprotein signal peptidase  44.12 
 
 
166 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0475146 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0051  lipoprotein signal peptidase  44.12 
 
 
166 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  29.32 
 
 
167 aa  50.4  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  32.58 
 
 
176 aa  50.4  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4493  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 
180 aa  50.4  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124328  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  30.39 
 
 
166 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  28.57 
 
 
160 aa  50.4  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4860  lipoprotein signal peptidase  29.61 
 
 
164 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.777227  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3451  lipoprotein signal peptidase  30.37 
 
 
169 aa  49.7  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10093  normal  0.187541 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>