98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1164 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1164  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 77 aa  150  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000232378 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1274  AsnC/Lrp family regulatory protein  90.91 
 
 		 77 aa  138  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.228348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2110  transcriptional regulator, AsnC family  75.32 
 
 		 77 aa  117  7e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.311997 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3444  transcriptional regulator, AsnC family  64.94 
 
 		 77 aa  102  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.838195  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09180  transcriptional regulator, AsnC family  63.64 
 
 		 77 aa  99.4  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.440046  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4041  transcriptional regulator, AsnC family  63.64 
 
 		 77 aa  99  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0794181  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5986  transcriptional regulator, AsnC family  62.34 
 
 		 77 aa  98.6  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1585  AsnC family transcriptional regulator  61.84 
 
 		 82 aa  97.4  6e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0255561 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2790  AsnC family transcriptional regulator  58.44 
 
 		 77 aa  97.1  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.258633  normal  0.188192 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3611  AsnC family transcriptional regulator  59.74 
 
 		 77 aa  97.1  8e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8006  putative transcriptional regulator, AsnC family  59.74 
 
 		 77 aa  96.3  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1128  AsnC family transcriptional regulator  59.74 
 
 		 77 aa  95.9  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.27533 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0642  AsnC family transcriptional regulator  58.44 
 
 		 79 aa  91.7  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1487  transcriptional regulator, AsnC family  66.23 
 
 		 77 aa  90.1  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.103565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8039  transcriptional regulator, AsnC family  53.85 
 
 		 79 aa  88.6  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0203  transcriptional regulator, AsnC family  55.84 
 
 		 77 aa  87.8  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2150  AsnC family transcriptional regulator  56.76 
 
 		 80 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3289  AsnC family transcriptional regulator  59.74 
 
 		 78 aa  81.3  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.2653  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4217  AsnC family transcriptional regulator  51.35 
 
 		 80 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.119336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1082  AsnC family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 76 aa  73.9  0.0000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1931  AsnC family transcriptional regulator  53.62 
 
 		 75 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1911  AsnC family transcriptional regulator  53.62 
 
 		 75 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1977  AsnC family transcriptional regulator  53.62 
 
 		 75 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.507322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1255  transcriptional regulator, AsnC family  44.44 
 
 		 91 aa  68.9  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.889139  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3207  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  53.33 
 
 		 79 aa  68.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1271  hypothetical protein  39.73 
 
 		 76 aa  67.4  0.00000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0226078  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1054  transcriptional regulator  39.73 
 
 		 76 aa  67.4  0.00000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0684  transcriptional regulator, AsnC family  32.89 
 
 		 84 aa  61.6  0.000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0675913  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0577  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 81 aa  60.5  0.000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1782  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 76 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00773049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2086  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 76 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.737881 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2809  transcriptional regulator, AsnC family  36.99 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.419913 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0784  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 82 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.268379 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0967  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 95 aa  58.5  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.201819 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0212  AsnC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 78 aa  57.8  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0029  AsnC family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2286  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0210  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  41.43 
 
 		 77 aa  53.9  0.0000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0776  transcriptional regulator, AsnC family  36.84 
 
 		 82 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0739  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 82 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0383278  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0776  transcriptional regulator, AsnC family  36.84 
 
 		 82 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.221352  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2207  AsnC family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 93 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00384601  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 170 aa  52.8  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0822  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 80 aa  51.6  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5226  transcriptional regulator, AsnC family  35.21 
 
 		 91 aa  51.6  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2704  transcriptional regulator, AsnC family  32.89 
 
 		 92 aa  50.4  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3066  transcriptional regulator, AsnC family  36.62 
 
 		 94 aa  50.1  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0051918  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1524  AsnC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 79 aa  50.1  0.000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000133196 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1590  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 80 aa  50.4  0.000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.947785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2681  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.84 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.82034 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1944  transcriptional regulator, AsnC family  28.95 
 
 		 93 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102103 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0627  AsnC family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.959135 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1087  transcriptional regulator, AsnC family  31.58 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1935  transcriptional regulator, AsnC family  32.47 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.2155  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1107  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1507  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 94 aa  47.8  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0935679 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3139  transcriptional regulator, AsnC family  36.62 
 
 		 91 aa  47.8  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1025  AsnC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 91 aa  47.4  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.190582  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1584  transcriptional regulator, AsnC family  28 
 
 		 98 aa  47.4  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00433651  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1458  transcriptional regulator, AsnC family  33.8 
 
 		 92 aa  47.4  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1485  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 79 aa  47  0.00008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1686  transcriptional regulator, AsnC family  28.95 
 
 		 95 aa  47  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.253834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0619  AsnC family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 76 aa  46.2  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0619  AsnC family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 99 aa  47  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.742984  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2072  transcriptional regulator, AsnC family  35.53 
 
 		 93 aa  46.2  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6098  transcriptional regulator, AsnC family  32.89 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0740219 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1235  transcriptional regulator, AsnC family  30.99 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2005  transcriptional regulator, AsnC family  34.21 
 
 		 93 aa  45.4  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174457  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1299  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 95 aa  45.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882741 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3129  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 92 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16160  transcriptional regulator, AsnC family  30.26 
 
 		 93 aa  45.4  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0330214  normal  0.554236 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3945  AsnC family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0668  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3195  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 92 aa  44.7  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0002664  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0222  AsnC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 91 aa  44.7  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0460  transcriptional regulator, AsnC family  29.17 
 
 		 76 aa  44.3  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1001  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1895  transcriptional regulator, AsnC family  33.8 
 
 		 93 aa  43.9  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0969365  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1377  transcriptional regulator, AsnC family  34.21 
 
 		 93 aa  43.9  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3534  transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0847  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.86037 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2626  transcriptional regulator, AsnC family  30.99 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.23982  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  30.56 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1993  AsnC family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 170 aa  43.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.556169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14170  transcriptional regulator, AsnC family  36.99 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.353401 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3432  transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 		 342 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0995  AsnC family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.370597  hitchhiker  0.00975593 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0884  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218469  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1197  AsnC family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 76 aa  42  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3052  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  26.32 
 
 		 92 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  32 
 
 		 148 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3463  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1123  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338845  hitchhiker  0.00138165 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15740  transcriptional regulator, AsnC family  28.95 
 
 		 93 aa  40.8  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.229331  normal  0.978576 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1185  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3244  transcriptional regulator, AsnC family  36.84 
 
 		 93 aa  40.8  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0032026  hitchhiker  0.0000772239 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2857  transcriptional regulator, AsnC family  32.2 
 
 		 162 aa  40.4  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.301241  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>