More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A2845 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A2845  phage integrase family protein  100 
 
 		 409 aa  851    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  0.121401 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3273  phage integrase family protein  47.37 
 
 		 401 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0956673  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3410  integrase family protein  47.37 
 
 		 401 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.134022  hitchhiker  0.000868318 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2650  integrase family protein  43.24 
 
 		 410 aa  351  1e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0205154  hitchhiker  0.00000395125 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3013  phage integrase family site specific recombinase  39.56 
 
 		 419 aa  301  1e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2942  phage integrase family protein  32.65 
 
 		 392 aa  209  9e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000983731 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3579  integrase  31.79 
 
 		 389 aa  196  7e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000745226 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1639  phage integrase family protein  30.08 
 
 		 403 aa  188  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0427266  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2292  phage integrase family protein  32.23 
 
 		 393 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.919949  normal  0.20238 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2626  phage integrase family protein  31.11 
 
 		 393 aa  179  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000269871  normal  0.0831358 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0948  putative integrase  32.46 
 
 		 385 aa  177  4e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3754  integrase family protein  28.02 
 
 		 407 aa  168  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.290204  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2668  phage integrase family site specific recombinase  27.25 
 
 		 411 aa  167  4e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1571  site-specific recombinase, phage integrase family  27.86 
 
 		 409 aa  160  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0359454  decreased coverage  0.000000698249 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2015  phage integrase family site specific recombinase  28.96 
 
 		 390 aa  160  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0939  phage integrase family site specific recombinase  27.07 
 
 		 406 aa  156  6e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.456123  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  28.72 
 
 		 413 aa  151  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  27.34 
 
 		 414 aa  149  8e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  27.09 
 
 		 414 aa  147  3e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  26.94 
 
 		 406 aa  146  7.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3935  site-specific recombinase, phage integrase family  27.01 
 
 		 420 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.191126  decreased coverage  0.00000299734 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  28.46 
 
 		 410 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  27.8 
 
 		 432 aa  137  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0388  phage integrase family site specific recombinase  26.33 
 
 		 429 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  28.43 
 
 		 403 aa  133  5e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  28.68 
 
 		 420 aa  133  6e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0395  phage integrase family protein  27.99 
 
 		 396 aa  133  6e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436905  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  28.91 
 
 		 409 aa  130  6e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2709  putative prophage integrase  29.66 
 
 		 418 aa  130  6e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  27.83 
 
 		 425 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001829  integrase  26.74 
 
 		 405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  28.21 
 
 		 413 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0064  integrative genetic element Gsu32, integrase  26.09 
 
 		 439 aa  127  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4070  site-specific recombinase, phage integrase family  26.24 
 
 		 439 aa  127  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  27.3 
 
 		 406 aa  127  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0393  integrase family protein  27.02 
 
 		 403 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000451154 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1597  integrase family protein  27.42 
 
 		 602 aa  124  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.754785  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4162  integrase family protein  25.49 
 
 		 422 aa  124  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806899  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  26.89 
 
 		 421 aa  124  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0054  phage integrase family site specific recombinase  25.99 
 
 		 422 aa  124  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  27.73 
 
 		 414 aa  123  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  25.81 
 
 		 406 aa  122  8e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  27.73 
 
 		 409 aa  122  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0943  putative integrase prophage protein  26.96 
 
 		 400 aa  122  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3466  integrase family protein  27.4 
 
 		 644 aa  122  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  27.47 
 
 		 409 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3122  integrase family protein  27.52 
 
 		 404 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4160  phage integrase family protein  26.87 
 
 		 419 aa  121  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0690268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  24.94 
 
 		 404 aa  121  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  27.46 
 
 		 410 aa  120  3e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  27.93 
 
 		 394 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3997  integrase family protein  24.51 
 
 		 419 aa  119  7.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2072  integrase family protein  26.41 
 
 		 407 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.841134  normal  0.685608 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  25.19 
 
 		 433 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3082  phage integrase family protein  27.3 
 
 		 437 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2119  integrative genetic element Gsu56, integrase  23.77 
 
 		 453 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0997  integrase family protein  26.24 
 
 		 410 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1097  putative phage integrase  27 
 
 		 643 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0408493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1977  phage integrase family protein  27.08 
 
 		 617 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.602154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3372  integrase family protein  25.87 
 
 		 601 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2408  integrase (int)  27.08 
 
 		 617 aa  112  9e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.71715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2892  phage integrase family protein  25.74 
 
 		 423 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2823  putative phage integrase  24.53 
 
 		 440 aa  111  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.339344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2767  phage integrase family protein  26.02 
 
 		 421 aa  110  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00105965 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  24.82 
 
 		 419 aa  110  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1871  putative integrase prophage protein  26 
 
 		 405 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00740779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1340  phage integrase family protein  26.11 
 
 		 487 aa  110  7.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.680009  normal  0.929089 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3353  phage integrase family protein  24.94 
 
 		 393 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0747  Phage integrase  26.38 
 
 		 418 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236649  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0912  phage integrase family protein  25.86 
 
 		 413 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1442  phage integrase  26.11 
 
 		 404 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2546  phage integrase family protein  26.82 
 
 		 400 aa  107  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40023  hitchhiker  0.00168033 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0318  hypothetical protein  25.43 
 
 		 515 aa  107  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0681  integrase family protein  26.51 
 
 		 401 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  25.74 
 
 		 404 aa  107  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2656  phage integrase family site specific recombinase  26.26 
 
 		 395 aa  106  7e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000325439  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1859  phage integrase family protein  26.25 
 
 		 427 aa  106  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0222826  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1216  phage integrase family protein  26.61 
 
 		 402 aa  106  7e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.190832  normal  0.145773 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  26.56 
 
 		 401 aa  106  8e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0615  Phage integrase  25.94 
 
 		 399 aa  106  9e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.862313  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2300  phage integrase family protein  25.99 
 
 		 403 aa  106  9e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  27.21 
 
 		 404 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15350  putative integrase  27.11 
 
 		 400 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000770896  unclonable  1.43377e-21 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0697  integrase family protein  25.65 
 
 		 618 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  25.98 
 
 		 404 aa  105  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01122  integrase  24.14 
 
 		 410 aa  104  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2200  integrase family protein  25 
 
 		 415 aa  104  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  24.08 
 
 		 411 aa  104  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3266  site-specific recombinase, phage integrase family  28.43 
 
 		 367 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1281  integrase family protein  26.72 
 
 		 410 aa  103  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250481  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0718  integrase family protein  28.13 
 
 		 419 aa  104  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4814  site-specific recombinase, phage integrase family protein  26.67 
 
 		 422 aa  103  5e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.751833  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0354  Phage integrase  26.21 
 
 		 402 aa  103  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1213  phage integrase family protein  26.18 
 
 		 411 aa  103  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.550435  normal  0.724829 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3779  phage integrase family protein  25.19 
 
 		 404 aa  103  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.794944 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1726  phage integrase family protein  25.74 
 
 		 395 aa  103  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0362  phage integrase family site specific recombinase  26.52 
 
 		 402 aa  103  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1188  phage integrase family protein  24.81 
 
 		 419 aa  103  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0317  phage integrase  25.26 
 
 		 404 aa  103  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1844  phage integrase family protein  24.94 
 
 		 426 aa  103  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>