108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1107 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1107  comG operon protein 3  100 
 
 		 105 aa  211  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00201822  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1600  competence protein ComGC-like protein  87.25 
 
 		 103 aa  158  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.530657  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1634  hypothetical protein  87.25 
 
 		 103 aa  158  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.727392  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2926  ComG operon protein 3  48.39 
 
 		 99 aa  95.1  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.972463  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4095  comG operon protein 3  43.88 
 
 		 99 aa  87  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.663959  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4319  comG operon protein 3  39.39 
 
 		 99 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516067  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4372  comG operon protein 3  39.39 
 
 		 99 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0206  DNA transport machinery (exogenous DNA-binding protein)  42.39 
 
 		 98 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3983  comG operon protein 3  37.37 
 
 		 99 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0155019  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4262  comG operon protein 3  37.37 
 
 		 99 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4143  comG operon protein 3  36.36 
 
 		 99 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4464  ComG operon protein 3  36.36 
 
 		 99 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2369  ComG operon protein 3  43.48 
 
 		 98 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4353  comG operon protein 3  40.82 
 
 		 99 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3993  comG operon protein 3  37.37 
 
 		 99 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0555  competence protein ComGC-like protein  33.01 
 
 		 103 aa  62  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2425  competence protein ComGC  47.56 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.402709  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1840  late competence protein, exogenous DNA-binding protein  46.94 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.63084  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1809  hypothetical protein  28.74 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1440  type II secretion system protein G  27.45 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0197781  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3312  general secretion pathway protein G  35.23 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1999  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 131 aa  51.6  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  28 
 
 		 121 aa  50.4  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1351  general secretion pathway protein G  30.99 
 
 		 150 aa  50.4  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1273  competence protein ComGC  32.97 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0185017  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1856  hypothetical protein  31.18 
 
 		 301 aa  50.1  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0863  putative secretory pathway protein  26.26 
 
 		 395 aa  48.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00022206  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3030  general secretion pathway protein G  31.51 
 
 		 139 aa  47.4  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.187173  hitchhiker  0.00937307 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0605  general secretion pathway protein G  30.88 
 
 		 147 aa  47.4  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000021872 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1116  general secretion pathway protein G  34.21 
 
 		 143 aa  47  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  28.12 
 
 		 144 aa  47  0.00009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  29.17 
 
 		 150 aa  47  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3886  type II secretion system protein G  27.38 
 
 		 122 aa  46.2  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  30.43 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03959  general secretion pathway protein G  30.88 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0592  general secretion pathway protein G  27.94 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3128  general secretion pathway protein G  32.81 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  32.79 
 
 		 158 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0234  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4158  general secretion pathway protein G  26.92 
 
 		 151 aa  44.7  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000753103 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0675  general secretion pathway protein G  35 
 
 		 159 aa  44.7  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186648  normal  0.343045 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0654  general secretion pathway protein G  35 
 
 		 159 aa  45.1  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0121173  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02979  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  28.92 
 
 		 129 aa  44.3  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.811632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1301  general secretion pathway protein G  31.33 
 
 		 146 aa  44.3  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.010915 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  32.79 
 
 		 146 aa  44.3  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2240  hypothetical protein  27.54 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.100669 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0102  general secretion pathway protein G  30 
 
 		 149 aa  43.9  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.573705  normal  0.0126574 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1584  general secretion pathway protein G  32.05 
 
 		 166 aa  43.9  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0906658 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  30.16 
 
 		 144 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3450  protein of unknown function DUF1559  32.31 
 
 		 330 aa  43.5  0.0009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.517501  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  29.11 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
NC_003296  RS00348  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  25.77 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02970  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  33.33 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0455058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3218  general secretion pathway protein G  25.64 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.427151 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0865  hypothetical protein  26.92 
 
 		 374 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.220364  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0534  general secretion pathway protein G  35 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2678  protein of unknown function DUF1559  28.38 
 
 		 349 aa  42.7  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.28415  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29510  putative type II secretion system protein  32.84 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  25.93 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  25.93 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16150  General secretion pathway protein G  30 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0032  protein of unknown function DUF1559  25.68 
 
 		 323 aa  42.7  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.98147  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  25.97 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2840  protein of unknown function DUF1559  27.4 
 
 		 348 aa  42.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1024  hypothetical protein  25 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  25 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1280  general secretion pathway protein G  30.88 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2621  type II secretion system protein G  26.03 
 
 		 184 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  28.12 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3525  hypothetical protein  29.17 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00449865  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1892  protein of unknown function DUF1559  32.26 
 
 		 325 aa  42.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2471  protein of unknown function DUF1559  31.15 
 
 		 338 aa  42  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  28.12 
 
 		 154 aa  41.6  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0925  general secretion pathway protein G  31.67 
 
 		 162 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0172546  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1042  hypothetical protein  25.26 
 
 		 120 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  31.82 
 
 		 155 aa  42  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1343  general secretion pathway protein G  28.21 
 
 		 160 aa  41.6  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.657967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1321  general secretion pathway protein G  29.73 
 
 		 158 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  24.64 
 
 		 149 aa  41.2  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  25 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4074  protein of unknown function DUF1559  34.62 
 
 		 321 aa  41.6  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4248  general secretion pathway protein G  28.38 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0347967 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2470  type II secretion system protein G  23.38 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335351  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2532  general secretion pathway protein G  25 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211317  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1480  protein of unknown function DUF1559  34.55 
 
 		 362 aa  41.2  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.546488  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  26.15 
 
 		 150 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  26.56 
 
 		 154 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  26.15 
 
 		 150 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  26.15 
 
 		 150 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  26.15 
 
 		 150 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  26.15 
 
 		 150 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  26.15 
 
 		 150 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  26.15 
 
 		 150 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2857  general secretion pathway protein G  29.51 
 
 		 157 aa  40.8  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1415  general secretion pathway protein G  29.51 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3221  general secretion pathway protein G  27.38 
 
 		 156 aa  40.8  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1757  hypothetical protein  25.27 
 
 		 166 aa  40.4  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1036  hypothetical protein  28.17 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20881  pilin  30.43 
 
 		 159 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1172  hypothetical protein  50 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123806  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>