140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_B0003 on replicon NC_007641
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007641  Rru_B0003  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 354 aa  725    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3800  putative glycosyl transferase  44.29 
 
 		 355 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0618  glycosyl transferase, group 1 family protein  43.58 
 
 		 366 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2338  glycosyl transferase, group 1  44.82 
 
 		 359 aa  275  7e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0667  glycosyl transferase, group 1  40.11 
 
 		 360 aa  272  5.000000000000001e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30020  Glycosyl transferase, group 1 family protein  47.03 
 
 		 361 aa  263  3e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.349292  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1274  glycosyl transferase, group 1  41.6 
 
 		 359 aa  256  5e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.204906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5371  glycosyl transferase, group 1  43.39 
 
 		 352 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624756  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3989  glycosyl transferase, group 1  42.3 
 
 		 361 aa  250  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2728  glycosyl transferase, group 1  41.6 
 
 		 372 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2650  glycosyl transferase, group 1  36.54 
 
 		 357 aa  233  3e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0629  glycosyl transferase, group 1  40.17 
 
 		 356 aa  223  4.9999999999999996e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.325985 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2859  glycosyl transferase group 1  32.96 
 
 		 368 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1347  glycosyl transferase group 1  33.69 
 
 		 367 aa  183  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.963322 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4264  glycosyl transferase, group 1  33.24 
 
 		 364 aa  173  5e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2590  glycosyltransferase  35.03 
 
 		 331 aa  172  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0360925  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0277  glycosyl transferase group 1  32.88 
 
 		 354 aa  145  1e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0063  a-glycosyltransferase  29.61 
 
 		 361 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.15897  normal  0.0344748 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3711  glycosyl transferase group 1  32.3 
 
 		 371 aa  133  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.102739  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2522  glycosyltransferase  32.57 
 
 		 339 aa  129  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1477  glycosyl transferase  29.9 
 
 		 333 aa  127  3e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0984787  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0384  glycosyl transferase  29.28 
 
 		 384 aa  127  3e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  27.05 
 
 		 2401 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1992  hypothetical protein  28.52 
 
 		 382 aa  70.5  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  0.53449 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3645  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 		 386 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243926 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1367  glycosyltransferase-like protein  30.15 
 
 		 1608 aa  63.2  0.000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0176996  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1786  glycosyl transferase, putative  35.51 
 
 		 1147 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0129098 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2166  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 828 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1100  glycosyl transferase group 1  30.5 
 
 		 924 aa  58.2  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0686  hypothetical protein  30.32 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3647  glycosyl transferase group 1  28.48 
 
 		 384 aa  57  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  hitchhiker  0.000752114 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  34.52 
 
 		 388 aa  57  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3935  glycosyltransferase  37.21 
 
 		 366 aa  56.2  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5057  glycosyl transferase, group 1  24.76 
 
 		 359 aa  56.2  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.312058 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1281  glycosyl transferase group 1  29.79 
 
 		 1292 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0318394  normal  0.169433 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1373  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 1303 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.13365  hitchhiker  0.0000853282 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  32.52 
 
 		 411 aa  53.9  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0291  glycosyl transferase, group 1  27.52 
 
 		 740 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3783  glycosyl transferase, group 1  28.44 
 
 		 394 aa  52.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.653155  normal  0.567349 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0775  glycosyl transferase, group 1  27.52 
 
 		 740 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1761  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 		 390 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  37.35 
 
 		 387 aa  52  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5389  glycosyl transferase group 1  30.19 
 
 		 1265 aa  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.604421  normal  0.386182 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5722  glycosyl transferase group 1  30.19 
 
 		 1271 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.702468  hitchhiker  0.00500958 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0145  hypothetical protein  24.8 
 
 		 414 aa  51.2  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0668  glycosyl transferase, group 1  25.7 
 
 		 392 aa  50.4  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4012  glycosyl transferase group 1  32.43 
 
 		 403 aa  50.4  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  25.39 
 
 		 382 aa  50.1  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  25.23 
 
 		 387 aa  48.9  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3782  glycosyl transferase, group 1  31.03 
 
 		 414 aa  49.3  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3472  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 		 427 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0837222 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2418  glycosyltransferase-like protein  26.64 
 
 		 388 aa  48.1  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.252152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4161  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 382 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3626  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 393 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4205  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 382 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.384396 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0777  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 		 384 aa  48.5  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.135676  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3311  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 382 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  26.16 
 
 		 378 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2606  glycosyl transferase group 1  32.05 
 
 		 398 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2076  glycosyl transferase group 1  33.72 
 
 		 324 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.249499  normal  0.0477078 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4069  glycosyltransferase-like protein  24.21 
 
 		 398 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.269356  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  37.04 
 
 		 378 aa  48.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  21.15 
 
 		 386 aa  47.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4854  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  29.79 
 
 		 362 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3878  glycosyl transferase group 1  24.74 
 
 		 535 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1672  glycosyl transferase group 1  52.5 
 
 		 359 aa  47  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1684  glycosyl transferase, group 1  30.39 
 
 		 416 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1367  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 1301 aa  47  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.833598  normal  0.936092 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  34.94 
 
 		 346 aa  46.6  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  25.43 
 
 		 403 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0161  glycosyl transferase, group 1  23.15 
 
 		 365 aa  46.2  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0045  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.79 
 
 		 362 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0061  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.79 
 
 		 362 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0800  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 		 405 aa  46.2  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4101  glycosyl transferase group 1  32 
 
 		 393 aa  46.2  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03358  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  27.91 
 
 		 362 aa  45.4  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1102  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 953 aa  46.2  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2111  glycosyl transferase, group 1  29.52 
 
 		 821 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.356512 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0766  glycosyl transferase, group 1  38.67 
 
 		 339 aa  45.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  29.01 
 
 		 374 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  32.88 
 
 		 401 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  21.94 
 
 		 415 aa  45.8  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4575  glycosyl transferase group 1  28.74 
 
 		 413 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.161634  normal  0.819576 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3174  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.43 
 
 		 377 aa  45.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  22.76 
 
 		 390 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3333  glycosyltransferase-like protein  24.03 
 
 		 1121 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6180  glycosyl transferase, group 1  29.89 
 
 		 360 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0584  glycosyl transferase group 1  24.34 
 
 		 373 aa  44.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.83028  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3069  group 1 glycosyl transferase  25.29 
 
 		 357 aa  45.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  37.04 
 
 		 391 aa  45.1  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3504  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 		 400 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0009700000000003e-28 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5020  hypothetical protein  37.18 
 
 		 348 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.848752 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0211  glycosyl transferase group 1  25.86 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0613  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 378 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.529786  normal  0.125987 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 		 409 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  31.82 
 
 		 388 aa  44.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3879  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 435 aa  45.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0909048  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0920  glycosyl transferase group 1  31.51 
 
 		 362 aa  44.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.492126 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0261  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  30.11 
 
 		 362 aa  45.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  22.76 
 
 		 390 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.112045 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>